42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1121 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1121  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  100 
 
 		 286 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2109  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  66.15 
 
 		 258 aa  333  2e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2100  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  63.32 
 
 		 260 aa  328  5.0000000000000004e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2426  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  56.2 
 
 		 258 aa  285  5e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00205999  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2251  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  55.21 
 
 		 254 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1609  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  53.08 
 
 		 268 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000241948  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1358  thiazole biosynthesis enzyme  53.36 
 
 		 264 aa  248  6e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000774298  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1935  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  52.33 
 
 		 254 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0421  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  54.02 
 
 		 271 aa  242  6e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000154841  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1998  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  50.94 
 
 		 273 aa  227  1e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.310517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0859  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  47.29 
 
 		 259 aa  228  1e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.841302  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1052  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  51.35 
 
 		 259 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.273545  normal  0.78871 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1498  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  50.19 
 
 		 275 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.16629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2221  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  47.67 
 
 		 271 aa  219  3.9999999999999997e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000384751 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1555  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  49.22 
 
 		 261 aa  217  1e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0963  thiazole biosynthesis enzyme  48.64 
 
 		 254 aa  216  4e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0277  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  43.31 
 
 		 255 aa  211  1e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.720039 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1007  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  47.24 
 
 		 256 aa  211  1e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1411  thiazole biosynthesis enzyme  45.98 
 
 		 267 aa  206  3e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0798  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  45.49 
 
 		 263 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0725876  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0663  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  47.67 
 
 		 261 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.397509  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0140  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  47.45 
 
 		 248 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0142  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  47.06 
 
 		 248 aa  195  6e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0597  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  49.22 
 
 		 262 aa  193  3e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.469921  normal  0.642946 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1420  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  41.29 
 
 		 263 aa  192  4e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.043335 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0226  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  48.84 
 
 		 261 aa  192  6e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1321  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  48.84 
 
 		 261 aa  191  8e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1422  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  41.2 
 
 		 277 aa  179  4.999999999999999e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1590  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  41.47 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00059443  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2980  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  37.28 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0002  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  38.97 
 
 		 307 aa  167  1e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1462  thiazole biosynthesis enzyme  37.88 
 
 		 310 aa  165  6.9999999999999995e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2419  thiazole biosynthesis enzyme  37.54 
 
 		 309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2718  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  36.81 
 
 		 308 aa  162  8.000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0678  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  38.61 
 
 		 272 aa  159  3e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50942  predicted protein  33.57 
 
 		 351 aa  120  3e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.920544 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03928  Putative thiazole synthaseTHI4_ASPOR Thiazole biosynthetic enzyme, mitochondrial ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q76B84]  31.6 
 
 		 331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.514294 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0405  FMN-binding domain protein  58.14 
 
 		 626 aa  45.4  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.07228 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1959  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  43.75 
 
 		 647 aa  43.1  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1115  glutamate synthase subunit beta  38.1 
 
 		 491 aa  42.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal  0.334154 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  29.22 
 
 		 472 aa  42.4  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  28.89 
 
 		 470 aa  42.4  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308572 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>