More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1609 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1609  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  100 
 
 
268 aa  547  1e-155  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000241948  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0421  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  68.58 
 
 
271 aa  356  1.9999999999999998e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000154841  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0859  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  62.45 
 
 
259 aa  320  1.9999999999999998e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.841302  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2426  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  53.75 
 
 
258 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00205999  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1358  thiazole biosynthesis enzyme  53.52 
 
 
264 aa  267  1e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000774298  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1121  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  53.08 
 
 
286 aa  260  2e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2109  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  54.05 
 
 
258 aa  258  6e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2251  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  52.76 
 
 
254 aa  253  3e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0963  thiazole biosynthesis enzyme  49.6 
 
 
254 aa  252  4.0000000000000004e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1007  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  49.4 
 
 
256 aa  241  9e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2100  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  47.91 
 
 
260 aa  237  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1935  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  48.82 
 
 
254 aa  237  2e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0277  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  46.37 
 
 
255 aa  233  3e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.720039 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0663  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  48.06 
 
 
261 aa  230  2e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.397509  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1411  thiazole biosynthesis enzyme  49.6 
 
 
267 aa  228  1e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2221  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  47.19 
 
 
271 aa  227  2e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000384751 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1555  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  49.8 
 
 
261 aa  223  3e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0798  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  45.91 
 
 
263 aa  222  4e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0725876  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1498  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  49.21 
 
 
275 aa  221  9.999999999999999e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.16629  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0597  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  50.39 
 
 
262 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.469921  normal  0.642946 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0226  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  50 
 
 
261 aa  219  5e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1321  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  50 
 
 
261 aa  218  7e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1052  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  49.4 
 
 
259 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.273545  normal  0.78871 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1998  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  48.22 
 
 
273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.310517  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1420  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  42.97 
 
 
263 aa  204  1e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.043335 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0142  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  45.24 
 
 
248 aa  203  3e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0140  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  44.84 
 
 
248 aa  201  9e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1590  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  41.8 
 
 
258 aa  187  2e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00059443  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1422  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  40.15 
 
 
277 aa  179  4.999999999999999e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2419  thiazole biosynthesis enzyme  37.41 
 
 
309 aa  171  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1462  thiazole biosynthesis enzyme  37.77 
 
 
310 aa  169  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0002  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  38.55 
 
 
307 aa  169  3e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2718  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  35.87 
 
 
308 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0678  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  36.25 
 
 
272 aa  159  6e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2980  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  36.33 
 
 
309 aa  158  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50942  predicted protein  31.19 
 
 
351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.920544 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03928  Putative thiazole synthaseTHI4_ASPOR Thiazole biosynthetic enzyme, mitochondrial ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q76B84]  31.23 
 
 
331 aa  119  7e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.514294 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2165  glutamate synthase subunit beta  36.84 
 
 
513 aa  54.7  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000111952  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2257  glutamate synthase subunit beta  36.84 
 
 
513 aa  54.3  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000664143  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0404  glutamate synthase subunit beta  39.73 
 
 
472 aa  53.1  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0157845 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2623  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  32.98 
 
 
653 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1933  glutamate synthase, small subunit  35.79 
 
 
469 aa  52.4  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.889564  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2738  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  32.98 
 
 
653 aa  52.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2672  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  32.98 
 
 
653 aa  52.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2712  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  32.98 
 
 
653 aa  52.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0772  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.8 
 
 
551 aa  51.6  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2845  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  32.98 
 
 
653 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.625431  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0616  glutamate synthase subunit beta  32.63 
 
 
472 aa  51.2  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0835  glutamate synthase subunit beta  33.68 
 
 
472 aa  51.2  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.387522  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  52.83 
 
 
324 aa  50.4  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  55.56 
 
 
310 aa  50.1  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  28.05 
 
 
537 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1873  glutamate synthase subunit beta  40 
 
 
473 aa  50.1  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4965  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.86 
 
 
466 aa  50.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0772589 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4011  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  34.02 
 
 
671 aa  50.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0063  glutamate synthase subunit beta  35.42 
 
 
481 aa  50.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0779  thioredoxin reductase  43.55 
 
 
310 aa  49.7  0.00005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2164  glutamate synthase subunit beta  40 
 
 
473 aa  49.7  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0515227  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0856  glutamate synthase subunit beta  33.33 
 
 
472 aa  49.7  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0344  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  40.51 
 
 
658 aa  49.3  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1125  glutamate synthase subunit beta  32.63 
 
 
469 aa  49.7  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1370  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  31.65 
 
 
434 aa  49.3  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  40.35 
 
 
409 aa  49.3  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  41.94 
 
 
311 aa  49.3  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0271  glutamate synthase, small subunit  33 
 
 
467 aa  49.3  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0925346 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  41.94 
 
 
311 aa  49.3  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2361  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.73 
 
 
306 aa  48.9  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244772  hitchhiker  0.000649797 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1220  glutamate synthase subunit beta  30.53 
 
 
469 aa  48.9  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3657  glutamate synthase subunit beta  36.84 
 
 
472 aa  48.9  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.18059 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2774  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  33.57 
 
 
430 aa  48.9  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.372841  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1925  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  47.17 
 
 
561 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0956827  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1324  glutamate synthase subunit beta  31.58 
 
 
468 aa  48.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3522  glutamate synthase subunit beta  36.84 
 
 
472 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  34.07 
 
 
470 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  54.17 
 
 
556 aa  48.1  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3691  glutamate synthase subunit beta  36.84 
 
 
472 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.752822  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1958  glutamate synthase subunit beta  32.29 
 
 
470 aa  48.1  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3524  glutamate synthase subunit beta  36.84 
 
 
472 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3593  glutamate synthase subunit beta  36.84 
 
 
472 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0529  glutamate synthase subunit beta  32.65 
 
 
472 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0465  glutamate synthase subunit beta  32.65 
 
 
472 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000235827  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2955  glutamate synthase subunit beta  31.58 
 
 
468 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0982485 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  54.55 
 
 
462 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2614  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  29.79 
 
 
659 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.28 
 
 
776 aa  48.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.98211  hitchhiker  0.000275945 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3051  glutamate synthase subunit beta  31.58 
 
 
468 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0368167 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3629  glutamate synthase subunit beta  36.84 
 
 
472 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.344291 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08910  thioredoxin-disulfide reductase  38.1 
 
 
305 aa  48.1  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000637944  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1129  glutamate synthase subunit beta  32.65 
 
 
472 aa  48.5  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0513615  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  58.14 
 
 
463 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03318  glutamate synthase subunit beta  34.74 
 
 
493 aa  47.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  43.4 
 
 
348 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0298  glutamate synthase subunit beta  39.13 
 
 
472 aa  48.1  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2682  glutamate synthase subunit beta  40.91 
 
 
483 aa  47.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.287891 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2747  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  29.79 
 
 
659 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0304  glutamate synthase subunit beta  39.13 
 
 
472 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1469  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.35 
 
 
556 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0649357  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  33.33 
 
 
472 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2873  glutamate synthase subunit beta  31.58 
 
 
468 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0110656 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0027  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.84 
 
 
468 aa  47.8  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>