153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2980 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012028  Hlac_2980  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  100 
 
 		 309 aa  627  1e-179  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1462  thiazole biosynthesis enzyme  73.87 
 
 		 310 aa  450  1e-125  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2718  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  74.76 
 
 		 308 aa  442  1e-123  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2419  thiazole biosynthesis enzyme  71.52 
 
 		 309 aa  443  1e-123  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0002  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  71.94 
 
 		 307 aa  427  1e-119  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0678  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  48.08 
 
 		 272 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2100  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  39.01 
 
 		 260 aa  181  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2109  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  37.72 
 
 		 258 aa  170  3e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1121  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  37.28 
 
 		 286 aa  169  4e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1411  thiazole biosynthesis enzyme  37.77 
 
 		 267 aa  162  7e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1498  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  37.67 
 
 		 275 aa  159  8e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.16629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2426  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  35 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00205999  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1609  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  36.33 
 
 		 268 aa  155  6e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000241948  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0277  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  35.61 
 
 		 255 aa  153  4e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.720039 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2251  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  35.34 
 
 		 254 aa  152  7e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1358  thiazole biosynthesis enzyme  37.45 
 
 		 264 aa  151  1e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000774298  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1420  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  34.04 
 
 		 263 aa  149  5e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.043335 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0963  thiazole biosynthesis enzyme  34.8 
 
 		 254 aa  148  1.0000000000000001e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1998  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  36.3 
 
 		 273 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.310517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2221  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  35.25 
 
 		 271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000384751 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0421  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  35.44 
 
 		 271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000154841  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1052  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  36.93 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.273545  normal  0.78871 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1555  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  35.07 
 
 		 261 aa  145  1e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0142  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  36.07 
 
 		 248 aa  142  7e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0859  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  36.43 
 
 		 259 aa  142  8e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.841302  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0798  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  35.34 
 
 		 263 aa  142  9e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0725876  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0140  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  35.71 
 
 		 248 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0663  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  34.48 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.397509  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1935  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  32.86 
 
 		 254 aa  140  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50942  predicted protein  32.77 
 
 		 351 aa  138  1e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.920544 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1007  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  34.64 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03928  Putative thiazole synthaseTHI4_ASPOR Thiazole biosynthetic enzyme, mitochondrial ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q76B84]  32.11 
 
 		 331 aa  132  9e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.514294 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1422  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  33.09 
 
 		 277 aa  123  4e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0226  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  33.68 
 
 		 261 aa  122  7e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0597  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  33.68 
 
 		 262 aa  122  7e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.469921  normal  0.642946 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1590  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  33.21 
 
 		 258 aa  122  9e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00059443  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1321  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  33.33 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  41.79 
 
 		 427 aa  56.2  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0672  HI0933 family protein  45.9 
 
 		 436 aa  52.8  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2641  FAD dependent oxidoreductase  30.67 
 
 		 542 aa  50.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  27.74 
 
 		 435 aa  50.8  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1867  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  43.64 
 
 		 472 aa  50.1  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00543949  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2101  monooxygenase FAD-binding protein  41.1 
 
 		 368 aa  48.9  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0262  flavoprotein  34.69 
 
 		 424 aa  48.5  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000227955  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  32.53 
 
 		 430 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  51.22 
 
 		 463 aa  47.4  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0541  hypothetical protein  45.28 
 
 		 558 aa  47  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.9586 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  42.31 
 
 		 245 aa  46.6  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4522  FAD dependent oxidoreductase  61.11 
 
 		 443 aa  46.6  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.682037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1545  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45 
 
 		 365 aa  46.6  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0160439 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1057  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase domain protein  67.74 
 
 		 426 aa  46.6  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  44.23 
 
 		 479 aa  46.6  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2265  UDP-galactopyranose mutase  32.84 
 
 		 384 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1260  FAD dependent oxidoreductase  54.35 
 
 		 438 aa  46.6  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2982  hypothetical protein  28.81 
 
 		 419 aa  46.2  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  47.62 
 
 		 510 aa  46.6  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  47.27 
 
 		 776 aa  46.2  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.98211  hitchhiker  0.000275945 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0599  monooxygenase FAD-binding protein  62.16 
 
 		 488 aa  45.8  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1474  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  50 
 
 		 784 aa  45.4  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.293744  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0041  HI0933-like protein  40 
 
 		 399 aa  45.8  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.32138 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  46.34 
 
 		 462 aa  45.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3440  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  46.34 
 
 		 605 aa  45.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.845304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3271  Fe-S oxidoreductase  32.56 
 
 		 763 aa  45.8  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3262  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.28 
 
 		 687 aa  45.8  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2150  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  46.77 
 
 		 563 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.357931 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  51.22 
 
 		 464 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  46 
 
 		 484 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3231  FAD-dependent oxidoreductase  27.37 
 
 		 553 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4061  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  33.33 
 
 		 476 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3177  FAD-dependent oxidoreductase  27.37 
 
 		 553 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3216  FAD-dependent oxidoreductase  27.37 
 
 		 553 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13170  FAD dependent oxidoreductase  52.5 
 
 		 423 aa  45.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3371  hypothetical protein  44.26 
 
 		 426 aa  44.3  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000385799  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0977  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  34.02 
 
 		 561 aa  45.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1447  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.82 
 
 		 1012 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2084  FAD dependent oxidoreductase  39.22 
 
 		 477 aa  44.3  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4456  nopaline dehydrogenase, putative  51.28 
 
 		 464 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.733359  hitchhiker  0.00000723906 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3601  FAD dependent oxidoreductase  24.77 
 
 		 513 aa  43.9  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4911  putative FAD-binding dehydrogenase  32.41 
 
 		 578 aa  43.9  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.855718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5080  amine oxidase  56.41 
 
 		 506 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.984429  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4604  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  29.03 
 
 		 432 aa  43.9  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5168  amine oxidase  56.41 
 
 		 506 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5459  amine oxidase  56.41 
 
 		 506 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.723961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0544  amine oxidase  46 
 
 		 525 aa  43.9  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00189501  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03043  hypothetical protein  45.45 
 
 		 670 aa  43.9  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  43.48 
 
 		 447 aa  43.9  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4482  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  51.22 
 
 		 490 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3482  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.75 
 
 		 683 aa  43.5  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0818  dehydrogenase  52.5 
 
 		 496 aa  43.9  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.486977 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2774  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  46.94 
 
 		 430 aa  43.5  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.372841  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1043  putative FAD-binding dehydrogenase  38.2 
 
 		 558 aa  43.5  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2125  hypothetical protein  47.73 
 
 		 406 aa  43.5  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  38.89 
 
 		 431 aa  43.5  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22640  aspartate oxidase  37.5 
 
 		 623 aa  43.1  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.73746 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  33.96 
 
 		 511 aa  43.5  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  47.5 
 
 		 435 aa  43.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2085  putative FAD-binding dehydrogenase  50.98 
 
 		 558 aa  43.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.376668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0279  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 519 aa  43.5  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0419  glucose-methanol-choline oxidoreductase  57.58 
 
 		 563 aa  43.5  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1058  HI0933 family protein  60 
 
 		 425 aa  43.1  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>