More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2209 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  100 
 
 
430 aa  877    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0708  FAD dependent oxidoreductase  45.74 
 
 
409 aa  370  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  43.83 
 
 
427 aa  358  9e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1733  HI0933 family protein  46.08 
 
 
408 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4539  hypothetical protein  44.07 
 
 
423 aa  354  2e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0672  HI0933 family protein  43.75 
 
 
436 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3371  hypothetical protein  43.58 
 
 
426 aa  352  1e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000385799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4604  hypothetical protein  43.58 
 
 
423 aa  351  1e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00629914  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4440  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  43.58 
 
 
423 aa  351  1e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0621454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4458  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  43.58 
 
 
423 aa  351  1e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4825  conserved hypothetical protein TIGR00275  43.58 
 
 
423 aa  351  1e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4960  hypothetical protein  43.58 
 
 
423 aa  351  1e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.979568  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0416  hypothetical protein TIGR00275  43.58 
 
 
423 aa  350  2e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0139426  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4820  conserved hypothetical protein TIGR00275  43.58 
 
 
423 aa  350  2e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4850  hypothetical protein  43.58 
 
 
423 aa  350  3e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.473198  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4843  conserved hypothetical protein TIGR00275  43.58 
 
 
423 aa  350  3e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000266049  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0908  HI0933 family protein  44.71 
 
 
426 aa  349  5e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0262  flavoprotein  40.24 
 
 
424 aa  338  9.999999999999999e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000227955  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2378  HI0933 family protein  45.78 
 
 
412 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.270996  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1601  hypothetical protein  42.58 
 
 
406 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3399  HI0933 family protein  41.83 
 
 
419 aa  316  4e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000862547  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1810  hypothetical protein  39.85 
 
 
422 aa  315  9.999999999999999e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261505  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1845  hypothetical protein  39.85 
 
 
422 aa  315  9.999999999999999e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1339  hypothetical protein  39.9 
 
 
406 aa  309  6.999999999999999e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0646456  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_183  hypothetical protein  41.16 
 
 
435 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.277985  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0195  hypothetical protein  41.4 
 
 
435 aa  307  3e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0437859  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2135  hypothetical protein  40.61 
 
 
415 aa  306  3e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00468248  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1150  YhiN family flavoprotein  39.66 
 
 
406 aa  306  4.0000000000000004e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.823305  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1315  hypothetical protein  40.1 
 
 
420 aa  301  2e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476308  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0158  hypothetical protein  40.92 
 
 
435 aa  300  3e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0861  HI0933 family protein  37.29 
 
 
412 aa  292  7e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883164  normal  0.741633 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1752  hypothetical protein  39.47 
 
 
390 aa  290  3e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00572064  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2451  hypothetical protein  38.42 
 
 
446 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000138411  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1567  hypothetical protein  39.36 
 
 
393 aa  283  5.000000000000001e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1197  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  36.1 
 
 
403 aa  279  5e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00144707  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2050  hypothetical protein  40.24 
 
 
419 aa  277  2e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000118961  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0187  HI0933 family protein  40.72 
 
 
433 aa  276  4e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1025  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  35.85 
 
 
403 aa  276  8e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0617168  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0030  HI0933 family protein  40.44 
 
 
412 aa  271  2e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0927  HI0933 family protein  35.94 
 
 
408 aa  252  9.000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1022  HI0933 family protein  33.5 
 
 
403 aa  246  4e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0291  hypothetical protein  37.59 
 
 
408 aa  242  7e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2387  hypothetical protein  34.75 
 
 
410 aa  237  3e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1378  hypothetical protein  34.96 
 
 
415 aa  236  6e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.275116 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1237  HI0933-like protein  34.38 
 
 
412 aa  229  7e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4030  HI0933 family protein  35.71 
 
 
414 aa  227  3e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1561  hypothetical protein  32.29 
 
 
455 aa  222  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1437  hypothetical protein  34.16 
 
 
413 aa  220  3e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2605  hypothetical protein  33.09 
 
 
407 aa  221  3e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00291222  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1926  HI0933-like protein  32.45 
 
 
414 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0825  HI0933 family protein  32.23 
 
 
414 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.689631 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2952  hypothetical protein  32.46 
 
 
415 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00592847  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1430  HI0933 family protein  34.62 
 
 
452 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.223271  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1467  hypothetical protein  33.01 
 
 
415 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.196184  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2635  YhiN family flavoprotein  32.39 
 
 
414 aa  211  3e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1122  hypothetical protein  32.77 
 
 
443 aa  210  4e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.138213  normal  0.379331 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0627  HI0933 family protein  30.81 
 
 
404 aa  207  2e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000930463  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2316  hypothetical protein  33.08 
 
 
410 aa  207  3e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3520  HI0933 family protein  32.48 
 
 
408 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15581  flavoprotein  32.93 
 
 
414 aa  207  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379962  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0128  hypothetical protein  33.9 
 
 
394 aa  207  4e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0603016  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15361  flavoprotein  31.67 
 
 
411 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0647863  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1209  HI0933 family protein  32.23 
 
 
443 aa  200  3.9999999999999996e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00892484 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3791  hypothetical protein  33.9 
 
 
398 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3901  hypothetical protein  33.9 
 
 
398 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1076  HI0933 family protein  32.99 
 
 
407 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0249257  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15731  flavoprotein  32.86 
 
 
410 aa  199  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3962  hypothetical protein  33.9 
 
 
398 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.327369  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3781  hypothetical protein  33.9 
 
 
398 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1052  hypothetical protein  32.35 
 
 
442 aa  196  6e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.843089  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1282  HI0933 family protein  32.08 
 
 
457 aa  196  7e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.138775  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3858  hypothetical protein  33.66 
 
 
398 aa  196  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00469108  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3945  hypothetical protein  32.47 
 
 
405 aa  195  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2949  putative FAD dependent oxidoreductase  32.62 
 
 
401 aa  195  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0017  hypothetical protein  33.57 
 
 
422 aa  195  2e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1476  HI0933 family protein  32.44 
 
 
413 aa  194  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3802  hypothetical protein  32 
 
 
394 aa  193  4e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001943  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  33.49 
 
 
397 aa  192  7e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1018  HI0933 family protein  29.85 
 
 
404 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1341  hypothetical protein  33.33 
 
 
393 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07621  hypothetical protein  33.89 
 
 
407 aa  190  4e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0179283 
 
 
-
 
NC_002936  DET0226  hypothetical protein  33 
 
 
379 aa  189  9e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0145  hypothetical protein  31.89 
 
 
394 aa  188  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0130  hypothetical protein  33.89 
 
 
405 aa  189  1e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.700212  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1574  HI0933 family protein  32.05 
 
 
409 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1597  HI0933 family protein  32.05 
 
 
409 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.168995 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_202  hypothetical protein  32.91 
 
 
394 aa  187  3e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4118  HI0933 family protein  32.45 
 
 
394 aa  187  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2623  hypothetical protein  30.84 
 
 
393 aa  187  3e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1899  HI0933 family protein  30.79 
 
 
409 aa  187  4e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.279809  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1238  hypothetical protein  32.46 
 
 
414 aa  187  4e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5845  HI0933 family protein  31.88 
 
 
408 aa  186  5e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599184  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4466  hypothetical protein  31.08 
 
 
394 aa  186  6e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.119173 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4873  hypothetical protein  30.36 
 
 
394 aa  186  7e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2547  hypothetical protein  32.62 
 
 
394 aa  186  8e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.374165  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4017  hypothetical protein  31.97 
 
 
393 aa  186  8e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4688  hypothetical protein  33.25 
 
 
413 aa  185  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1007  hypothetical protein  32.05 
 
 
389 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.775195  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28030  HI0933-like protein  31.96 
 
 
411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2555  hypothetical protein  32.02 
 
 
396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00730633  hitchhiker  0.0000156467 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>