138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1007 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1007  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  100 
 
 		 256 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0277  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  54.51 
 
 		 255 aa  275  4e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.720039 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2426  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  53.54 
 
 		 258 aa  271  6e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00205999  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1358  thiazole biosynthesis enzyme  50.59 
 
 		 264 aa  244  8e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000774298  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1609  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  49.4 
 
 		 268 aa  237  2e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000241948  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0859  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  47.64 
 
 		 259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.841302  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1422  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  50.97 
 
 		 277 aa  231  7.000000000000001e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0421  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  49.61 
 
 		 271 aa  228  7e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000154841  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0142  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  49.4 
 
 		 248 aa  225  6e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0140  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  49 
 
 		 248 aa  224  1e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0963  thiazole biosynthesis enzyme  49.6 
 
 		 254 aa  217  1e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2109  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  49.03 
 
 		 258 aa  217  2e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2100  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  47.47 
 
 		 260 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1121  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  47.24 
 
 		 286 aa  211  7.999999999999999e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1590  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  47.62 
 
 		 258 aa  208  9e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00059443  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1052  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  42.86 
 
 		 259 aa  189  5e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.273545  normal  0.78871 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2251  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  44.09 
 
 		 254 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1998  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  43.63 
 
 		 273 aa  188  7e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.310517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1498  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  44.02 
 
 		 275 aa  186  3e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.16629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1935  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  44.05 
 
 		 254 aa  186  4e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1555  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  42.47 
 
 		 261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0663  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  44.36 
 
 		 261 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.397509  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1411  thiazole biosynthesis enzyme  43.41 
 
 		 267 aa  182  7e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0798  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  42.35 
 
 		 263 aa  177  1e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0725876  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0226  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  44.75 
 
 		 261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2221  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  41.54 
 
 		 271 aa  172  2.9999999999999996e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000384751 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1321  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  44.36 
 
 		 261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0597  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  44.36 
 
 		 262 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.469921  normal  0.642946 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1420  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  37.93 
 
 		 263 aa  162  6e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.043335 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0678  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  36.19 
 
 		 272 aa  145  8.000000000000001e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2980  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  34.64 
 
 		 309 aa  134  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50942  predicted protein  34.28 
 
 		 351 aa  130  2.0000000000000002e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.920544 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2419  thiazole biosynthesis enzyme  34.4 
 
 		 309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2718  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  33.09 
 
 		 308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0002  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  34.17 
 
 		 307 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1462  thiazole biosynthesis enzyme  33.1 
 
 		 310 aa  127  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03928  Putative thiazole synthaseTHI4_ASPOR Thiazole biosynthetic enzyme, mitochondrial ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q76B84]  32.7 
 
 		 331 aa  117  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.514294 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  55.56 
 
 		 463 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  54.76 
 
 		 462 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0423  selenate reductase YgfK  59.46 
 
 		 1075 aa  47.8  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1194  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  55 
 
 		 1487 aa  47.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0227  putative oxidoreductase  54.55 
 
 		 469 aa  47  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.967797 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  55.26 
 
 		 478 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  55.26 
 
 		 478 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  27.11 
 
 		 435 aa  47  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12040  2,4-dienoyl-CoA reductase  34.94 
 
 		 676 aa  46.6  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.138062  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4378  FAD-binding protein  60.53 
 
 		 436 aa  46.2  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  60.53 
 
 		 435 aa  46.2  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  60.53 
 
 		 435 aa  46.2  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0331  monooxygenase, FAD-binding  60.53 
 
 		 435 aa  46.2  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 429 aa  45.8  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  50 
 
 		 429 aa  45.4  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0068  amine oxidase  48.94 
 
 		 557 aa  45.4  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  47.73 
 
 		 429 aa  45.4  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  50 
 
 		 429 aa  45.4  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2545  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.1 
 
 		 464 aa  45.4  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000029955  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  50 
 
 		 429 aa  45.4  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1828  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  54.55 
 
 		 448 aa  45.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0185  glutamate synthase subunit beta  27.27 
 
 		 491 aa  44.7  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3148  amine oxidase  34.57 
 
 		 527 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0719859  normal  0.0908383 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87428  glutamate synthase  57.14 
 
 		 2126 aa  45.4  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1282  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.71 
 
 		 447 aa  44.7  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  52.63 
 
 		 478 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43800  predicted protein  28.05 
 
 		 528 aa  45.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1900  putative bifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta  47.54 
 
 		 747 aa  44.7  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.22072  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0109  glutamate synthase subunit beta  52.38 
 
 		 487 aa  44.3  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0818  glutamate synthase (NADH) small subunit  37.11 
 
 		 495 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3204  HI0933-like protein  50 
 
 		 410 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1117  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  57.14 
 
 		 447 aa  44.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0870  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  37.11 
 
 		 495 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2205  putative oxidoreductase  57.14 
 
 		 598 aa  44.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204646  normal  0.261416 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49644  predicted protein  50 
 
 		 516 aa  44.3  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2481  HI0933 family protein  46.34 
 
 		 411 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0212712  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0866  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  37.11 
 
 		 495 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3730  glutamate synthase subunit beta  51.43 
 
 		 484 aa  43.9  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178567  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1349  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  57.14 
 
 		 493 aa  43.9  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828565 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  42.86 
 
 		 537 aa  43.9  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  39.39 
 
 		 427 aa  43.5  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0580  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  39.73 
 
 		 653 aa  43.9  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000307705  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1112  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  36.04 
 
 		 446 aa  43.9  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0682  Putrescine oxidase  30 
 
 		 512 aa  43.9  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.016891  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1138  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  44.07 
 
 		 458 aa  43.9  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2710  glutamate synthase subunit beta  48.57 
 
 		 485 aa  43.9  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.405041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2853  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.35 
 
 		 614 aa  43.5  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2109  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  57.14 
 
 		 445 aa  43.9  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3286  FAD dependent oxidoreductase  61.11 
 
 		 488 aa  43.5  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.370539 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0344  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  38.57 
 
 		 658 aa  43.9  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1936  glutamate synthase subunit beta  27.27 
 
 		 491 aa  43.5  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6713  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  39.06 
 
 		 495 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2867  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  57.14 
 
 		 493 aa  43.9  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4456  nopaline dehydrogenase, putative  48.84 
 
 		 464 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.733359  hitchhiker  0.00000723906 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1536  amine oxidase  59.52 
 
 		 557 aa  43.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1328  putative oxidoreductase  63.16 
 
 		 455 aa  43.1  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100001  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3137  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.05 
 
 		 681 aa  43.1  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.226158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  51.28 
 
 		 424 aa  43.1  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2006  FAD dependent oxidoreductase  57.5 
 
 		 524 aa  43.5  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  52.63 
 
 		 510 aa  43.5  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05250  T3P18.10, putative  50 
 
 		 557 aa  43.1  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2251  HI0933-like protein  50 
 
 		 414 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294962  normal  0.0473731 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  36.26 
 
 		 529 aa  43.1  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>