More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3730 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3316  glutamate synthase subunit beta  89.86 
 
 		 491 aa  922    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0037  glutamate synthase subunit beta  69.69 
 
 		 477 aa  702    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3267  glutamate synthase subunit beta  69.21 
 
 		 477 aa  694    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.534293 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4276  glutamate synthase subunit beta  81.61 
 
 		 484 aa  778    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156086  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3465  glutamate synthase subunit beta  70.52 
 
 		 477 aa  701    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.590112  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0055  glutamate synthase subunit beta  82.44 
 
 		 484 aa  794    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3591  glutamate synthase subunit beta  69.21 
 
 		 477 aa  694    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.118629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3615  glutamate synthase subunit beta  89.23 
 
 		 491 aa  919    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.28988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0476  glutamate synthase subunit beta  68.6 
 
 		 473 aa  635    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.638304  normal  0.914259 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0050  glutamate synthase subunit beta  82.44 
 
 		 484 aa  794    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1172  glutamate synthase subunit beta  69.42 
 
 		 477 aa  677    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.203047  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2710  glutamate synthase subunit beta  87.63 
 
 		 485 aa  870    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.405041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2743  glutamate synthase subunit beta  82.02 
 
 		 484 aa  827    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.664254  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1811  glutamate synthase subunit beta  69.57 
 
 		 476 aa  684    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228111  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3730  glutamate synthase subunit beta  100 
 
 		 484 aa  1001    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178567  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3032  glutamate synthase subunit beta  62.81 
 
 		 472 aa  630  1e-179  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3874  glutamate synthase subunit beta  61.16 
 
 		 472 aa  619  1e-176  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134009 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1963  glutamate synthase subunit beta  61.78 
 
 		 473 aa  600  1e-170  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0760  glutamate synthase subunit beta  58.18 
 
 		 485 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.423731  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1370  glutamate synthase subunit beta  61.26 
 
 		 482 aa  589  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1137  glutamate synthase subunit beta  58.99 
 
 		 484 aa  587  1e-166  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0331749  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2954  glutamate synthase subunit beta  58.5 
 
 		 484 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4530  glutamate synthase subunit beta  57.78 
 
 		 484 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0960  glutamate synthase subunit beta  57.78 
 
 		 484 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.538211  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0876  glutamate synthase subunit beta  57.17 
 
 		 484 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.490935 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2040  glutamate synthase subunit beta  56.62 
 
 		 479 aa  570  1e-161  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.401643  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1603  glutamate synthase subunit beta  55.17 
 
 		 480 aa  541  1e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.879773  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0264  glutamate synthase (NADH) small subunit  53.5 
 
 		 478 aa  528  1e-149  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153251  normal  0.0665114 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3125  glutamate synthase subunit beta  52.1 
 
 		 487 aa  521  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.996212  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3175  glutamate synthase (NADH) small subunit  56.35 
 
 		 477 aa  523  1e-147  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3262  glutamate synthase subunit beta  51.8 
 
 		 487 aa  521  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1153  glutamate synthase subunit beta  51.98 
 
 		 492 aa  519  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3242  glutamate synthase subunit beta  52.3 
 
 		 487 aa  513  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0843  glutamate synthase subunit beta  53.66 
 
 		 487 aa  513  1e-144  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2895  glutamate synthase subunit beta  52.3 
 
 		 487 aa  513  1e-144  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.217171 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3395  glutamate synthase subunit beta  51.79 
 
 		 491 aa  509  1e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1616  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  51.92 
 
 		 488 aa  505  9.999999999999999e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0792  glutamate synthase subunit beta  50.8 
 
 		 488 aa  506  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.135801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5557  glutamate synthase subunit beta  50.99 
 
 		 491 aa  508  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3102  glutamate synthase subunit beta  52.5 
 
 		 488 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.541547 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1009  glutamate synthase subunit beta  51.59 
 
 		 492 aa  507  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0684  glutamate synthase subunit beta  51.2 
 
 		 488 aa  506  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.874899 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2934  glutamate synthase subunit beta  51.2 
 
 		 488 aa  504  1e-141  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3590  glutamate synthase subunit beta  51 
 
 		 489 aa  502  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.633224  hitchhiker  0.00000356893 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2627  glutamate synthase subunit beta  52.3 
 
 		 488 aa  499  1e-140  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0322  glutamate synthase subunit beta  50.9 
 
 		 488 aa  501  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0331  glutamate synthase subunit beta  50.9 
 
 		 488 aa  501  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.718365  normal  0.62843 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2964  glutamate synthase subunit beta  52.69 
 
 		 487 aa  496  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0366  glutamate synthase subunit beta  50.3 
 
 		 489 aa  498  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0095  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  51.9 
 
 		 487 aa  494  9.999999999999999e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.440417  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2396  glutamate synthase subunit beta  50.6 
 
 		 492 aa  492  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0218  glutamate synthase (NADH) small subunit  51.19 
 
 		 488 aa  489  1e-137  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3716  glutamate synthase subunit beta  51.8 
 
 		 488 aa  488  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.912921  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3689  glutamate synthase subunit beta  51.8 
 
 		 488 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3746  glutamate synthase subunit beta  51.8 
 
 		 488 aa  488  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1768  glutamate synthase subunit beta  51.6 
 
 		 488 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956795  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2735  glutamate synthase subunit beta  51.6 
 
 		 488 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0306  glutamate synthase subunit beta  51.9 
 
 		 488 aa  487  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2786  glutamate synthase subunit beta  51.6 
 
 		 488 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3013  glutamate synthase subunit beta  51.6 
 
 		 488 aa  488  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3679  glutamate synthase (NADH) small subunit  50.1 
 
 		 471 aa  486  1e-136  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.15931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3217  glutamate synthase subunit beta  51.6 
 
 		 506 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3500  glutamate synthase subunit beta  51.3 
 
 		 488 aa  481  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2704  glutamate synthase subunit beta  51 
 
 		 488 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0382  glutamate synthase subunit beta  51 
 
 		 488 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2787  glutamate synthase subunit beta  51.3 
 
 		 505 aa  480  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0403  glutamate synthase subunit beta  51 
 
 		 488 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.709199  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0731  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  50.2 
 
 		 491 aa  476  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000132905 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2339  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  48.07 
 
 		 482 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0742  glutamate synthase subunit beta  50.89 
 
 		 492 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0648887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0710  glutamate synthase subunit beta  50.69 
 
 		 492 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.893657  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5478  glutamate synthase subunit beta  48.59 
 
 		 502 aa  463  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2865  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  48.68 
 
 		 487 aa  458  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000168893  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2950  glutamate synthase (NADH) small subunit  48.98 
 
 		 492 aa  454  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.227052  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3165  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  48.98 
 
 		 484 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00040465  normal  0.173868 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1174  glutamate synthase (NADH) small subunit  48.98 
 
 		 485 aa  451  1e-125  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0108  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  48.16 
 
 		 488 aa  449  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808183  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0342  glutamate synthase (NADH) small subunit  47.03 
 
 		 475 aa  451  1e-125  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3777  glutamate synthase subunit beta  46.98 
 
 		 500 aa  450  1e-125  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2160  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  46.34 
 
 		 484 aa  448  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20700  glutamate synthase (NADH) small subunit  48.47 
 
 		 488 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.176887  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1692  glutamate synthase subunit beta  49.29 
 
 		 485 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0179657  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0707  glutamate synthase (NADH) small subunit  47.54 
 
 		 482 aa  447  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153272 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3212  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  48.3 
 
 		 495 aa  442  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1261  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  46.54 
 
 		 492 aa  442  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2320  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  47.68 
 
 		 496 aa  443  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106456  normal  0.283017 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5697  glutamate synthase subunit beta  48.77 
 
 		 488 aa  444  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159886 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1459  glutamate synthase, NADH/NADPH small subunit  47.88 
 
 		 494 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.1665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13894  glutamate synthase subunit beta  48.57 
 
 		 488 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6713  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  46.41 
 
 		 495 aa  437  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1115  glutamate synthase subunit beta  47.45 
 
 		 491 aa  436  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal  0.334154 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5065  glutamate synthase subunit beta  48.88 
 
 		 489 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5153  glutamate synthase subunit beta  48.88 
 
 		 489 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.973427 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1687  glutamate synthase subunit beta  49.28 
 
 		 485 aa  433  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000871139 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5444  glutamate synthase subunit beta  48.58 
 
 		 492 aa  435  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0119  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  47.23 
 
 		 484 aa  432  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2132  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  46.65 
 
 		 488 aa  435  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.550582  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5701  glutamate synthase subunit beta  48.26 
 
 		 486 aa  435  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1936  glutamate synthase subunit beta  47.84 
 
 		 481 aa  431  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.336215  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1953  glutamate synthase subunit beta  46.45 
 
 		 489 aa  431  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>