More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2040 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2040  glutamate synthase subunit beta  100 
 
 
479 aa  988    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.401643  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3125  glutamate synthase subunit beta  65.86 
 
 
487 aa  642    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.996212  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2954  glutamate synthase subunit beta  63.34 
 
 
484 aa  650    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1603  glutamate synthase subunit beta  74.58 
 
 
480 aa  750    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.879773  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3032  glutamate synthase subunit beta  65.76 
 
 
472 aa  677    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0331  glutamate synthase subunit beta  64.04 
 
 
488 aa  642    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.718365  normal  0.62843 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3590  glutamate synthase subunit beta  63.91 
 
 
489 aa  639    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.633224  hitchhiker  0.00000356893 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4530  glutamate synthase subunit beta  65.65 
 
 
484 aa  680    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0760  glutamate synthase subunit beta  63.82 
 
 
485 aa  667    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.423731  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0366  glutamate synthase subunit beta  63.91 
 
 
489 aa  640    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0876  glutamate synthase subunit beta  65.04 
 
 
484 aa  672    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.490935 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1137  glutamate synthase subunit beta  64.02 
 
 
484 aa  660    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0331749  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3262  glutamate synthase subunit beta  65.45 
 
 
487 aa  652    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1963  glutamate synthase subunit beta  67.22 
 
 
473 aa  665    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0322  glutamate synthase subunit beta  64.04 
 
 
488 aa  642    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0264  glutamate synthase (NADH) small subunit  67.15 
 
 
478 aa  682    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153251  normal  0.0665114 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1616  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  64.55 
 
 
488 aa  656    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0960  glutamate synthase subunit beta  63.62 
 
 
484 aa  658    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.538211  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3874  glutamate synthase subunit beta  68.06 
 
 
472 aa  689    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134009 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3175  glutamate synthase (NADH) small subunit  64.73 
 
 
477 aa  629  1e-179  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1370  glutamate synthase subunit beta  64.08 
 
 
482 aa  626  1e-178  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2895  glutamate synthase subunit beta  62.83 
 
 
487 aa  627  1e-178  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.217171 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3242  glutamate synthase subunit beta  62.42 
 
 
487 aa  624  1e-177  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3102  glutamate synthase subunit beta  62.83 
 
 
488 aa  623  1e-177  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.541547 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0792  glutamate synthase subunit beta  61.82 
 
 
488 aa  624  1e-177  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.135801  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1009  glutamate synthase subunit beta  63.33 
 
 
492 aa  624  1e-177  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0306  glutamate synthase subunit beta  64.24 
 
 
488 aa  618  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2934  glutamate synthase subunit beta  62.02 
 
 
488 aa  618  1e-176  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0843  glutamate synthase subunit beta  65.05 
 
 
487 aa  621  1e-176  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2787  glutamate synthase subunit beta  64.04 
 
 
505 aa  618  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5557  glutamate synthase subunit beta  62.12 
 
 
491 aa  616  1e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536283  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2627  glutamate synthase subunit beta  65.32 
 
 
488 aa  615  1e-175  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2704  glutamate synthase subunit beta  63.84 
 
 
488 aa  614  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1153  glutamate synthase subunit beta  62.2 
 
 
492 aa  617  1e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0403  glutamate synthase subunit beta  63.84 
 
 
488 aa  614  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.709199  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0684  glutamate synthase subunit beta  61.01 
 
 
488 aa  615  1e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.874899 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0382  glutamate synthase subunit beta  63.84 
 
 
488 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3013  glutamate synthase subunit beta  64.24 
 
 
488 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0095  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  62.63 
 
 
487 aa  612  9.999999999999999e-175  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.440417  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3500  glutamate synthase subunit beta  63.03 
 
 
488 aa  611  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3395  glutamate synthase subunit beta  60.92 
 
 
491 aa  608  1e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2396  glutamate synthase subunit beta  61.4 
 
 
492 aa  609  1e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1768  glutamate synthase subunit beta  63.03 
 
 
488 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956795  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2964  glutamate synthase subunit beta  63.03 
 
 
487 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2735  glutamate synthase subunit beta  63.03 
 
 
488 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3716  glutamate synthase subunit beta  63.23 
 
 
488 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.912921  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3689  glutamate synthase subunit beta  63.23 
 
 
488 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3746  glutamate synthase subunit beta  63.23 
 
 
488 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3217  glutamate synthase subunit beta  63.03 
 
 
506 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2786  glutamate synthase subunit beta  63.03 
 
 
488 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3267  glutamate synthase subunit beta  60.04 
 
 
477 aa  601  1e-170  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.534293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3591  glutamate synthase subunit beta  60.04 
 
 
477 aa  601  1e-170  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.118629  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0037  glutamate synthase subunit beta  59.3 
 
 
477 aa  597  1e-169  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359975  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3465  glutamate synthase subunit beta  58.68 
 
 
477 aa  594  1e-168  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.590112  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2743  glutamate synthase subunit beta  60.08 
 
 
484 aa  591  1e-168  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.664254  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0710  glutamate synthase subunit beta  61.92 
 
 
492 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.893657  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0742  glutamate synthase subunit beta  61.92 
 
 
492 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0648887  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3316  glutamate synthase subunit beta  57.76 
 
 
491 aa  579  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5478  glutamate synthase subunit beta  57.87 
 
 
502 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3615  glutamate synthase subunit beta  57.55 
 
 
491 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.28988  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1811  glutamate synthase subunit beta  60.54 
 
 
476 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228111  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0218  glutamate synthase (NADH) small subunit  59.68 
 
 
488 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3777  glutamate synthase subunit beta  55.94 
 
 
500 aa  571  1.0000000000000001e-162  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3679  glutamate synthase (NADH) small subunit  58.47 
 
 
471 aa  570  1e-161  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.15931  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1172  glutamate synthase subunit beta  59.42 
 
 
477 aa  569  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.203047  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2710  glutamate synthase subunit beta  58.94 
 
 
485 aa  565  1e-160  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.405041  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2320  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  56.26 
 
 
496 aa  566  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106456  normal  0.283017 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0731  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  56.04 
 
 
491 aa  559  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000132905 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0707  glutamate synthase (NADH) small subunit  56.93 
 
 
482 aa  559  1e-158  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.153272 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0476  glutamate synthase subunit beta  61.12 
 
 
473 aa  561  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.638304  normal  0.914259 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2132  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  55.72 
 
 
488 aa  551  1e-155  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.550582  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3730  glutamate synthase subunit beta  56.62 
 
 
484 aa  549  1e-155  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178567  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2339  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  53.42 
 
 
482 aa  548  1e-155  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4276  glutamate synthase subunit beta  57.43 
 
 
484 aa  532  1e-150  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156086  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0055  glutamate synthase subunit beta  58.04 
 
 
484 aa  531  1e-150  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0050  glutamate synthase subunit beta  58.04 
 
 
484 aa  531  1e-150  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1953  glutamate synthase subunit beta  53.43 
 
 
489 aa  530  1e-149  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3165  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  55.62 
 
 
484 aa  525  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00040465  normal  0.173868 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2865  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  54.34 
 
 
487 aa  526  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000168893  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2160  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  53.33 
 
 
484 aa  521  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1008  glutamate synthase subunit beta  53.21 
 
 
489 aa  522  1e-147  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0108  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  53.73 
 
 
488 aa  520  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808183  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004467  glutamate synthase [NADPH] small chain  52.38 
 
 
489 aa  520  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0342  glutamate synthase (NADH) small subunit  55.42 
 
 
475 aa  520  1e-146  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00927  glutamate synthase subunit beta  52.17 
 
 
489 aa  518  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5701  glutamate synthase subunit beta  54.15 
 
 
486 aa  514  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1174  glutamate synthase (NADH) small subunit  54.37 
 
 
485 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1261  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  54.04 
 
 
492 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3656  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  51.21 
 
 
494 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2950  glutamate synthase (NADH) small subunit  54.1 
 
 
492 aa  512  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.227052  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2563  glutamate synthase subunit beta  51.55 
 
 
490 aa  513  1e-144  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5444  glutamate synthase subunit beta  55.53 
 
 
492 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1459  glutamate synthase, NADH/NADPH small subunit  54.69 
 
 
494 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.1665  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0855  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  52.62 
 
 
495 aa  508  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.554857  normal  0.298305 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3012  glutamate synthase subunit beta  56.16 
 
 
480 aa  506  9.999999999999999e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.183003 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0119  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  53.64 
 
 
484 aa  505  9.999999999999999e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0866  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  52.42 
 
 
495 aa  504  1e-141  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5065  glutamate synthase subunit beta  55.46 
 
 
489 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1079  glutamate synthase (NADH) small subunit  55.9 
 
 
486 aa  503  1e-141  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3021  glutamate synthase subunit beta  54.4 
 
 
493 aa  501  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0349235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>