More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1953 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004467  glutamate synthase [NADPH] small chain  88.96 
 
 		 489 aa  918    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1953  glutamate synthase subunit beta  100 
 
 		 489 aa  1014    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2563  glutamate synthase subunit beta  86.5 
 
 		 490 aa  894    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00927  glutamate synthase subunit beta  89.37 
 
 		 489 aa  920    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3777  glutamate synthase subunit beta  61.9 
 
 		 500 aa  636    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1008  glutamate synthase subunit beta  77.46 
 
 		 489 aa  818    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5478  glutamate synthase subunit beta  60.08 
 
 		 502 aa  628  1e-179  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0731  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  61.99 
 
 		 491 aa  622  1e-177  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000132905 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2320  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  61.17 
 
 		 496 aa  622  1e-177  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106456  normal  0.283017 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2132  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  57.56 
 
 		 488 aa  580  1e-164  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.550582  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0707  glutamate synthase (NADH) small subunit  57.17 
 
 		 482 aa  574  1.0000000000000001e-162  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153272 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3679  glutamate synthase (NADH) small subunit  55.77 
 
 		 471 aa  554  1e-156  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.15931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2160  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  54.77 
 
 		 484 aa  552  1e-156  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0264  glutamate synthase (NADH) small subunit  53.93 
 
 		 478 aa  530  1e-149  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153251  normal  0.0665114 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2040  glutamate synthase subunit beta  53.43 
 
 		 479 aa  530  1e-149  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.401643  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2865  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  52.69 
 
 		 487 aa  525  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000168893  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1009  glutamate synthase subunit beta  53.8 
 
 		 492 aa  526  1e-148  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1616  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  53.47 
 
 		 488 aa  523  1e-147  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1153  glutamate synthase subunit beta  52.69 
 
 		 492 aa  523  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0792  glutamate synthase subunit beta  53.43 
 
 		 488 aa  522  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.135801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1603  glutamate synthase subunit beta  52.81 
 
 		 480 aa  521  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.879773  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2934  glutamate synthase subunit beta  53.52 
 
 		 488 aa  521  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0331  glutamate synthase subunit beta  53.12 
 
 		 488 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.718365  normal  0.62843 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0322  glutamate synthase subunit beta  53.12 
 
 		 488 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3242  glutamate synthase subunit beta  53.23 
 
 		 487 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0684  glutamate synthase subunit beta  53.23 
 
 		 488 aa  515  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.874899 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2895  glutamate synthase subunit beta  52.62 
 
 		 487 aa  513  1e-144  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.217171 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3125  glutamate synthase subunit beta  52.11 
 
 		 487 aa  513  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.996212  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1261  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  52.16 
 
 		 492 aa  512  1e-144  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0366  glutamate synthase subunit beta  52.71 
 
 		 489 aa  511  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3395  glutamate synthase subunit beta  53 
 
 		 491 aa  511  1e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3102  glutamate synthase subunit beta  53.12 
 
 		 488 aa  509  1e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.541547 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3262  glutamate synthase subunit beta  51.21 
 
 		 487 aa  509  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3590  glutamate synthase subunit beta  52.1 
 
 		 489 aa  509  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.633224  hitchhiker  0.00000356893 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2339  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  52.67 
 
 		 482 aa  511  1e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2964  glutamate synthase subunit beta  54.23 
 
 		 487 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1174  glutamate synthase (NADH) small subunit  53.01 
 
 		 485 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5701  glutamate synthase subunit beta  52.08 
 
 		 486 aa  501  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0473  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  51.37 
 
 		 489 aa  504  1e-141  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3165  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  51.67 
 
 		 484 aa  499  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00040465  normal  0.173868 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2627  glutamate synthase subunit beta  53.01 
 
 		 488 aa  499  1e-140  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5557  glutamate synthase subunit beta  51.9 
 
 		 491 aa  500  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2787  glutamate synthase subunit beta  52.82 
 
 		 505 aa  500  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2950  glutamate synthase (NADH) small subunit  51.33 
 
 		 492 aa  500  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.227052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3021  glutamate synthase subunit beta  52.04 
 
 		 493 aa  500  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0349235  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3212  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  50.2 
 
 		 495 aa  498  1e-140  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0306  glutamate synthase subunit beta  53.12 
 
 		 488 aa  497  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3032  glutamate synthase subunit beta  52.59 
 
 		 472 aa  496  1e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6713  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  52.39 
 
 		 495 aa  494  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0218  glutamate synthase (NADH) small subunit  53.11 
 
 		 488 aa  493  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2693  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  51.61 
 
 		 489 aa  493  9.999999999999999e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207302  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3500  glutamate synthase subunit beta  52.52 
 
 		 488 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3175  glutamate synthase (NADH) small subunit  53.81 
 
 		 477 aa  492  9.999999999999999e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0382  glutamate synthase subunit beta  52.72 
 
 		 488 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2704  glutamate synthase subunit beta  52.72 
 
 		 488 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0403  glutamate synthase subunit beta  52.72 
 
 		 488 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.709199  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2396  glutamate synthase subunit beta  50.6 
 
 		 492 aa  493  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0108  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  50.62 
 
 		 488 aa  490  1e-137  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808183  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5444  glutamate synthase subunit beta  51.93 
 
 		 492 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1459  glutamate synthase, NADH/NADPH small subunit  51.12 
 
 		 494 aa  488  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.1665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0613  glutamate synthase subunit beta  50.2 
 
 		 491 aa  488  1e-137  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3013  glutamate synthase subunit beta  52.61 
 
 		 488 aa  489  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0818  glutamate synthase (NADH) small subunit  51.83 
 
 		 495 aa  488  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1936  glutamate synthase subunit beta  52.49 
 
 		 481 aa  490  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.336215  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0876  glutamate synthase subunit beta  50.91 
 
 		 484 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.490935 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5065  glutamate synthase subunit beta  51.75 
 
 		 489 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3874  glutamate synthase subunit beta  51.97 
 
 		 472 aa  491  1e-137  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134009 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5153  glutamate synthase subunit beta  51.75 
 
 		 489 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.973427 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0843  glutamate synthase subunit beta  52.52 
 
 		 487 aa  490  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1768  glutamate synthase subunit beta  51.71 
 
 		 488 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956795  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0866  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  51.63 
 
 		 495 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2735  glutamate synthase subunit beta  51.71 
 
 		 488 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2786  glutamate synthase subunit beta  51.71 
 
 		 488 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3716  glutamate synthase subunit beta  51.91 
 
 		 488 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.912921  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3746  glutamate synthase subunit beta  51.91 
 
 		 488 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3012  glutamate synthase subunit beta  52.82 
 
 		 480 aa  486  1e-136  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.183003 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4530  glutamate synthase subunit beta  51.32 
 
 		 484 aa  488  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0870  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  51.83 
 
 		 495 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13894  glutamate synthase subunit beta  51.75 
 
 		 488 aa  487  1e-136  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1692  glutamate synthase subunit beta  51.24 
 
 		 485 aa  485  1e-136  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0179657  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0855  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  50.82 
 
 		 495 aa  487  1e-136  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.554857  normal  0.298305 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3689  glutamate synthase subunit beta  51.91 
 
 		 488 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1115  glutamate synthase subunit beta  52.04 
 
 		 491 aa  485  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal  0.334154 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0762  glutamate synthase subunit beta  48.8 
 
 		 496 aa  481  1e-135  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2954  glutamate synthase subunit beta  50.71 
 
 		 484 aa  482  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20700  glutamate synthase (NADH) small subunit  51.13 
 
 		 488 aa  482  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.176887  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0760  glutamate synthase subunit beta  51.21 
 
 		 485 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.423731  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1137  glutamate synthase subunit beta  51.52 
 
 		 484 aa  484  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0331749  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3656  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  50.7 
 
 		 494 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1504  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  51.45 
 
 		 488 aa  482  1e-135  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.465203  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3217  glutamate synthase subunit beta  51.71 
 
 		 506 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1963  glutamate synthase subunit beta  52.6 
 
 		 473 aa  479  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5697  glutamate synthase subunit beta  52.16 
 
 		 488 aa  478  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159886 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0742  glutamate synthase subunit beta  52.8 
 
 		 492 aa  481  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0648887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0710  glutamate synthase subunit beta  52.6 
 
 		 492 aa  478  1e-133  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.893657  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0119  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  50.83 
 
 		 484 aa  475  1e-133  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0960  glutamate synthase subunit beta  49.7 
 
 		 484 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.538211  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0185  glutamate synthase subunit beta  49.19 
 
 		 491 aa  473  1e-132  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0095  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  50.8 
 
 		 487 aa  473  1e-132  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.440417  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2960  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  48.98 
 
 		 485 aa  469  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>