More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0108 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_5444  glutamate synthase subunit beta  79.67 
 
 		 492 aa  783    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0108  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  100 
 
 		 488 aa  998    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808183  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5701  glutamate synthase subunit beta  64.97 
 
 		 486 aa  634    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1115  glutamate synthase subunit beta  77.8 
 
 		 491 aa  763    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal  0.334154 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0119  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  79.96 
 
 		 484 aa  779    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1174  glutamate synthase (NADH) small subunit  69.88 
 
 		 485 aa  691    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3165  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  68.99 
 
 		 484 aa  682    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00040465  normal  0.173868 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13894  glutamate synthase subunit beta  78.6 
 
 		 488 aa  775    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1459  glutamate synthase, NADH/NADPH small subunit  65.86 
 
 		 494 aa  654    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.1665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3012  glutamate synthase subunit beta  69.96 
 
 		 480 aa  648    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.183003 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5065  glutamate synthase subunit beta  79.96 
 
 		 489 aa  786    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2865  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  66.4 
 
 		 487 aa  660    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000168893  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2960  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  63.88 
 
 		 485 aa  637    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2950  glutamate synthase (NADH) small subunit  67.14 
 
 		 492 aa  666    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.227052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1936  glutamate synthase subunit beta  68.17 
 
 		 481 aa  650    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.336215  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5153  glutamate synthase subunit beta  79.96 
 
 		 489 aa  786    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.973427 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5697  glutamate synthase subunit beta  78.48 
 
 		 488 aa  769    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159886 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3212  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  65.07 
 
 		 495 aa  640    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1692  glutamate synthase subunit beta  63.77 
 
 		 485 aa  629  1e-179  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0179657  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3021  glutamate synthase subunit beta  65.52 
 
 		 493 aa  625  1e-178  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0349235  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20700  glutamate synthase (NADH) small subunit  63.21 
 
 		 488 aa  616  1e-175  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.176887  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1079  glutamate synthase (NADH) small subunit  67.41 
 
 		 486 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1687  glutamate synthase subunit beta  63.77 
 
 		 485 aa  613  9.999999999999999e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000871139 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2216  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  59.8 
 
 		 488 aa  588  1e-167  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45323  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1981  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  62.22 
 
 		 491 aa  586  1e-166  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.376175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1504  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  61.11 
 
 		 488 aa  583  1.0000000000000001e-165  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.465203  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3679  glutamate synthase (NADH) small subunit  60.5 
 
 		 471 aa  583  1.0000000000000001e-165  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.15931  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2426  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  64.02 
 
 		 494 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0689344  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3071  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  61.34 
 
 		 487 aa  574  1.0000000000000001e-162  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000130486  hitchhiker  0.00545228 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1220  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  58.18 
 
 		 487 aa  550  1e-155  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.462072  normal  0.673117 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0473  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  57.2 
 
 		 489 aa  544  1e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0792  glutamate synthase subunit beta  56.09 
 
 		 488 aa  541  9.999999999999999e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.135801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5692  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  58.02 
 
 		 500 aa  540  9.999999999999999e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1261  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  55.79 
 
 		 492 aa  536  1e-151  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3777  glutamate synthase subunit beta  53.27 
 
 		 500 aa  532  1e-150  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3592  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  58.22 
 
 		 502 aa  534  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4693  normal  0.0250321 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3032  glutamate synthase subunit beta  55.62 
 
 		 472 aa  530  1e-149  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2320  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  55.24 
 
 		 496 aa  530  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106456  normal  0.283017 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1153  glutamate synthase subunit beta  54.82 
 
 		 492 aa  529  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0684  glutamate synthase subunit beta  55.46 
 
 		 488 aa  529  1e-149  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.874899 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28030  glutamate synthase (NADH) small subunit  58.42 
 
 		 501 aa  526  1e-148  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.328015 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0264  glutamate synthase (NADH) small subunit  53.97 
 
 		 478 aa  528  1e-148  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153251  normal  0.0665114 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11010  glutamate synthase (NADH) small subunit  56.82 
 
 		 486 aa  526  1e-148  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.709567  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3059  glutamate synthase (NADH) small subunit  58.02 
 
 		 502 aa  524  1e-147  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.519079  normal  0.394132 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3043  glutamate synthase (NADH) small subunit  58.02 
 
 		 502 aa  524  1e-147  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.119225  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0342  glutamate synthase (NADH) small subunit  57.29 
 
 		 475 aa  523  1e-147  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0707  glutamate synthase (NADH) small subunit  53.29 
 
 		 482 aa  522  1e-147  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153272 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3102  glutamate synthase (NADH) small subunit  58.02 
 
 		 502 aa  524  1e-147  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2040  glutamate synthase subunit beta  53.73 
 
 		 479 aa  520  1e-146  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.401643  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3395  glutamate synthase subunit beta  53.32 
 
 		 491 aa  520  1e-146  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5478  glutamate synthase subunit beta  53.71 
 
 		 502 aa  521  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2823  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  57.82 
 
 		 502 aa  521  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.366322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2941  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  54.76 
 
 		 501 aa  515  1.0000000000000001e-145  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0286232  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0566  glutamate synthase subunit beta  52.79 
 
 		 512 aa  513  1e-144  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3102  glutamate synthase subunit beta  54.32 
 
 		 488 aa  514  1e-144  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.541547 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6713  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  54.6 
 
 		 495 aa  510  1e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3166  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  58.2 
 
 		 501 aa  509  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0116079 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3262  glutamate synthase subunit beta  52.23 
 
 		 487 aa  508  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1009  glutamate synthase subunit beta  54.58 
 
 		 492 aa  510  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0843  glutamate synthase subunit beta  54.05 
 
 		 487 aa  507  9.999999999999999e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3125  glutamate synthase subunit beta  52.41 
 
 		 487 aa  508  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.996212  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1603  glutamate synthase subunit beta  52.8 
 
 		 480 aa  505  9.999999999999999e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.879773  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2934  glutamate synthase subunit beta  53.36 
 
 		 488 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2627  glutamate synthase subunit beta  54.86 
 
 		 488 aa  508  9.999999999999999e-143  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2396  glutamate synthase subunit beta  52.21 
 
 		 492 aa  505  9.999999999999999e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2895  glutamate synthase subunit beta  52.51 
 
 		 487 aa  504  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.217171 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3175  glutamate synthase (NADH) small subunit  55.11 
 
 		 477 aa  504  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0331  glutamate synthase subunit beta  52.23 
 
 		 488 aa  503  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.718365  normal  0.62843 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3242  glutamate synthase subunit beta  52.6 
 
 		 487 aa  503  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3874  glutamate synthase subunit beta  52.92 
 
 		 472 aa  502  1e-141  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134009 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3590  glutamate synthase subunit beta  51.92 
 
 		 489 aa  504  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.633224  hitchhiker  0.00000356893 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0322  glutamate synthase subunit beta  52.23 
 
 		 488 aa  502  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2954  glutamate synthase subunit beta  55.08 
 
 		 484 aa  500  1e-140  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2160  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  52.82 
 
 		 484 aa  501  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0366  glutamate synthase subunit beta  51.92 
 
 		 489 aa  500  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5557  glutamate synthase subunit beta  52.51 
 
 		 491 aa  497  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0960  glutamate synthase subunit beta  53.56 
 
 		 484 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.538211  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1137  glutamate synthase subunit beta  54.45 
 
 		 484 aa  494  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0331749  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2693  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  51.52 
 
 		 489 aa  494  9.999999999999999e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207302  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0731  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  52.67 
 
 		 491 aa  493  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000132905 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3806  glutamate synthase NADH/NADPH, small subunit  57.72 
 
 		 488 aa  493  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319112  hitchhiker  0.00341242 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1953  glutamate synthase subunit beta  50.62 
 
 		 489 aa  490  1e-137  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004467  glutamate synthase [NADPH] small chain  50.21 
 
 		 489 aa  489  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3391  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  58.92 
 
 		 501 aa  489  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.498468  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4530  glutamate synthase subunit beta  52.34 
 
 		 484 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0742  glutamate synthase subunit beta  52.81 
 
 		 492 aa  490  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0648887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0710  glutamate synthase subunit beta  53.75 
 
 		 492 aa  486  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.893657  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0760  glutamate synthase subunit beta  51.73 
 
 		 485 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.423731  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0876  glutamate synthase subunit beta  52.14 
 
 		 484 aa  487  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.490935 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00927  glutamate synthase subunit beta  50.41 
 
 		 489 aa  488  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2964  glutamate synthase subunit beta  52.91 
 
 		 487 aa  484  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2563  glutamate synthase subunit beta  49.18 
 
 		 490 aa  483  1e-135  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1987  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  56.94 
 
 		 485 aa  481  1e-135  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.107233  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2132  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  50.82 
 
 		 488 aa  484  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.550582  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0306  glutamate synthase subunit beta  52.83 
 
 		 488 aa  483  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2787  glutamate synthase subunit beta  52.43 
 
 		 505 aa  484  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0762  glutamate synthase subunit beta  50.5 
 
 		 496 aa  479  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1768  glutamate synthase subunit beta  52.23 
 
 		 488 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956795  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3716  glutamate synthase subunit beta  52.23 
 
 		 488 aa  478  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.912921  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3746  glutamate synthase subunit beta  52.23 
 
 		 488 aa  478  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>