More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5697 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0119  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  78.32 
 
 
484 aa  770    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0108  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  78.48 
 
 
488 aa  791    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808183  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5444  glutamate synthase subunit beta  84.35 
 
 
492 aa  834    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1459  glutamate synthase, NADH/NADPH small subunit  68.67 
 
 
494 aa  671    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.1665  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1174  glutamate synthase (NADH) small subunit  72.28 
 
 
485 aa  704    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13894  glutamate synthase subunit beta  82.72 
 
 
488 aa  822    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2950  glutamate synthase (NADH) small subunit  69.35 
 
 
492 aa  676    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.227052  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3012  glutamate synthase subunit beta  73.76 
 
 
480 aa  700    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.183003 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5701  glutamate synthase subunit beta  65.85 
 
 
486 aa  640    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1115  glutamate synthase subunit beta  91.24 
 
 
491 aa  905    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal  0.334154 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5065  glutamate synthase subunit beta  85.69 
 
 
489 aa  848    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3212  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  67.66 
 
 
495 aa  667    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3165  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  72.48 
 
 
484 aa  710    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00040465  normal  0.173868 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1936  glutamate synthase subunit beta  70.23 
 
 
481 aa  680    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.336215  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2865  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  69.25 
 
 
487 aa  681    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000168893  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5153  glutamate synthase subunit beta  85.69 
 
 
489 aa  848    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.973427 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5697  glutamate synthase subunit beta  100 
 
 
488 aa  999    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.159886 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1692  glutamate synthase subunit beta  65.42 
 
 
485 aa  632  1e-180  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0179657  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3021  glutamate synthase subunit beta  66.94 
 
 
493 aa  630  1e-179  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0349235  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1079  glutamate synthase (NADH) small subunit  68.64 
 
 
486 aa  621  1e-177  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2960  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  63.99 
 
 
485 aa  621  1e-176  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1687  glutamate synthase subunit beta  65.42 
 
 
485 aa  613  9.999999999999999e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000871139 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20700  glutamate synthase (NADH) small subunit  63.62 
 
 
488 aa  609  1e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.176887  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3679  glutamate synthase (NADH) small subunit  62.63 
 
 
471 aa  596  1e-169  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.15931  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1981  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  63.43 
 
 
491 aa  591  1e-167  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.376175  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3071  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  62.47 
 
 
487 aa  587  1e-166  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000130486  hitchhiker  0.00545228 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2216  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  61.02 
 
 
488 aa  579  1e-164  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45323  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1504  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  60.91 
 
 
488 aa  567  1e-160  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.465203  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0473  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  60.13 
 
 
489 aa  567  1e-160  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1220  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  58.45 
 
 
487 aa  552  1e-156  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.462072  normal  0.673117 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3032  glutamate synthase subunit beta  56.07 
 
 
472 aa  541  1e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3777  glutamate synthase subunit beta  54.29 
 
 
500 aa  543  1e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2426  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  61.38 
 
 
494 aa  540  9.999999999999999e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0689344  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0342  glutamate synthase (NADH) small subunit  59.96 
 
 
475 aa  539  9.999999999999999e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3059  glutamate synthase (NADH) small subunit  58.61 
 
 
502 aa  535  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.519079  normal  0.394132 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5692  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  56.66 
 
 
500 aa  536  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1261  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  57.32 
 
 
492 aa  535  1e-151  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0366  glutamate synthase subunit beta  54.95 
 
 
489 aa  535  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3395  glutamate synthase subunit beta  55.33 
 
 
491 aa  536  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2320  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  56.15 
 
 
496 aa  534  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106456  normal  0.283017 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0792  glutamate synthase subunit beta  54.45 
 
 
488 aa  532  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.135801  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3043  glutamate synthase (NADH) small subunit  58.81 
 
 
502 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.119225  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0322  glutamate synthase subunit beta  55.26 
 
 
488 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3590  glutamate synthase subunit beta  54.55 
 
 
489 aa  533  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.633224  hitchhiker  0.00000356893 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0331  glutamate synthase subunit beta  55.26 
 
 
488 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.718365  normal  0.62843 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3102  glutamate synthase (NADH) small subunit  58.81 
 
 
502 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2941  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  55.84 
 
 
501 aa  533  1e-150  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0286232  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3125  glutamate synthase subunit beta  55.67 
 
 
487 aa  530  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.996212  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0566  glutamate synthase subunit beta  55.36 
 
 
512 aa  531  1e-149  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0264  glutamate synthase (NADH) small subunit  54.39 
 
 
478 aa  528  1e-149  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153251  normal  0.0665114 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11010  glutamate synthase (NADH) small subunit  57.94 
 
 
486 aa  526  1e-148  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.709567  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3592  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  57 
 
 
502 aa  528  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4693  normal  0.0250321 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0707  glutamate synthase (NADH) small subunit  53.07 
 
 
482 aa  525  1e-148  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.153272 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1009  glutamate synthase subunit beta  54.62 
 
 
492 aa  526  1e-148  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28030  glutamate synthase (NADH) small subunit  56.24 
 
 
501 aa  523  1e-147  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.328015 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1153  glutamate synthase subunit beta  54.02 
 
 
492 aa  524  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0843  glutamate synthase subunit beta  55.35 
 
 
487 aa  521  1e-147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3874  glutamate synthase subunit beta  55.23 
 
 
472 aa  524  1e-147  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134009 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0684  glutamate synthase subunit beta  53.85 
 
 
488 aa  523  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.874899 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3242  glutamate synthase subunit beta  53.85 
 
 
487 aa  518  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3102  glutamate synthase subunit beta  53.44 
 
 
488 aa  519  1e-146  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.541547 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3262  glutamate synthase subunit beta  54.86 
 
 
487 aa  520  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2895  glutamate synthase subunit beta  54.05 
 
 
487 aa  519  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.217171 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3166  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  58.8 
 
 
501 aa  520  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0116079 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2823  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  56.63 
 
 
502 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.366322  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2396  glutamate synthase subunit beta  53.41 
 
 
492 aa  515  1.0000000000000001e-145  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2040  glutamate synthase subunit beta  53.73 
 
 
479 aa  514  1e-144  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.401643  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5478  glutamate synthase subunit beta  53.47 
 
 
502 aa  514  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2934  glutamate synthase subunit beta  53.04 
 
 
488 aa  512  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5557  glutamate synthase subunit beta  52.92 
 
 
491 aa  512  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536283  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2787  glutamate synthase subunit beta  55.47 
 
 
505 aa  513  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6713  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  55.02 
 
 
495 aa  508  1e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1603  glutamate synthase subunit beta  53.21 
 
 
480 aa  508  9.999999999999999e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.879773  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0306  glutamate synthase subunit beta  55.06 
 
 
488 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2160  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  53.24 
 
 
484 aa  503  1e-141  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00927  glutamate synthase subunit beta  52.77 
 
 
489 aa  504  1e-141  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2954  glutamate synthase subunit beta  54.38 
 
 
484 aa  504  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3500  glutamate synthase subunit beta  54.45 
 
 
488 aa  503  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3806  glutamate synthase NADH/NADPH, small subunit  59.63 
 
 
488 aa  501  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319112  hitchhiker  0.00341242 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2693  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  54.75 
 
 
489 aa  502  1e-141  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207302  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004467  glutamate synthase [NADPH] small chain  52.57 
 
 
489 aa  504  1e-141  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2964  glutamate synthase subunit beta  54.66 
 
 
487 aa  499  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3175  glutamate synthase (NADH) small subunit  54.39 
 
 
477 aa  498  1e-140  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2627  glutamate synthase subunit beta  54.25 
 
 
488 aa  500  1e-140  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0855  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  55.51 
 
 
495 aa  498  1e-140  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.554857  normal  0.298305 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2704  glutamate synthase subunit beta  54.25 
 
 
488 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0403  glutamate synthase subunit beta  54.25 
 
 
488 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.709199  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0960  glutamate synthase subunit beta  53.97 
 
 
484 aa  498  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.538211  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3013  glutamate synthase subunit beta  53.85 
 
 
488 aa  495  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1137  glutamate synthase subunit beta  53.97 
 
 
484 aa  498  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0331749  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0382  glutamate synthase subunit beta  54.05 
 
 
488 aa  498  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3391  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  59.8 
 
 
501 aa  494  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.498468  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2563  glutamate synthase subunit beta  51.54 
 
 
490 aa  494  9.999999999999999e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1953  glutamate synthase subunit beta  52.16 
 
 
489 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1768  glutamate synthase subunit beta  53.44 
 
 
488 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956795  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2786  glutamate synthase subunit beta  53.44 
 
 
488 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3716  glutamate synthase subunit beta  53.64 
 
 
488 aa  491  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.912921  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3689  glutamate synthase subunit beta  53.64 
 
 
488 aa  491  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0742  glutamate synthase subunit beta  54.02 
 
 
492 aa  491  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0648887  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3217  glutamate synthase subunit beta  53.44 
 
 
506 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>