More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2132 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2132  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  100 
 
 		 488 aa  1010    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.550582  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3777  glutamate synthase subunit beta  62.6 
 
 		 500 aa  649    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0731  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  70.19 
 
 		 491 aa  705    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000132905 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2320  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  62.07 
 
 		 496 aa  624  1e-178  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106456  normal  0.283017 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5478  glutamate synthase subunit beta  60.29 
 
 		 502 aa  612  9.999999999999999e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1953  glutamate synthase subunit beta  57.56 
 
 		 489 aa  593  1e-168  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00927  glutamate synthase subunit beta  57.56 
 
 		 489 aa  588  1e-167  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2160  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  59.13 
 
 		 484 aa  584  1.0000000000000001e-165  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2563  glutamate synthase subunit beta  56.29 
 
 		 490 aa  580  1e-164  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004467  glutamate synthase [NADPH] small chain  56.94 
 
 		 489 aa  580  1e-164  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1008  glutamate synthase subunit beta  55.42 
 
 		 489 aa  562  1.0000000000000001e-159  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2040  glutamate synthase subunit beta  55.72 
 
 		 479 aa  560  1e-158  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.401643  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3679  glutamate synthase (NADH) small subunit  55.65 
 
 		 471 aa  550  1e-155  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.15931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1261  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  55.46 
 
 		 492 aa  543  1e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1603  glutamate synthase subunit beta  52.6 
 
 		 480 aa  535  1e-150  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.879773  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0792  glutamate synthase subunit beta  54.03 
 
 		 488 aa  533  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.135801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2865  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  52.89 
 
 		 487 aa  529  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000168893  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3395  glutamate synthase subunit beta  52.71 
 
 		 491 aa  526  1e-148  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0331  glutamate synthase subunit beta  53.23 
 
 		 488 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.718365  normal  0.62843 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3874  glutamate synthase subunit beta  53.43 
 
 		 472 aa  525  1e-148  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134009 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3032  glutamate synthase subunit beta  54.26 
 
 		 472 aa  528  1e-148  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0322  glutamate synthase subunit beta  53.23 
 
 		 488 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0707  glutamate synthase (NADH) small subunit  52.92 
 
 		 482 aa  525  1e-148  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153272 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3102  glutamate synthase subunit beta  53.83 
 
 		 488 aa  527  1e-148  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.541547 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1153  glutamate synthase subunit beta  52.4 
 
 		 492 aa  521  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1174  glutamate synthase (NADH) small subunit  54.04 
 
 		 485 aa  525  1e-147  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3125  glutamate synthase subunit beta  52.52 
 
 		 487 aa  525  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.996212  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0264  glutamate synthase (NADH) small subunit  52.78 
 
 		 478 aa  522  1e-147  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153251  normal  0.0665114 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4530  glutamate synthase subunit beta  53.35 
 
 		 484 aa  521  1e-147  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3590  glutamate synthase subunit beta  51.71 
 
 		 489 aa  523  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.633224  hitchhiker  0.00000356893 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3165  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  53.64 
 
 		 484 aa  523  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00040465  normal  0.173868 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0684  glutamate synthase subunit beta  52.82 
 
 		 488 aa  523  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.874899 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1616  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  53.28 
 
 		 488 aa  524  1e-147  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2934  glutamate synthase subunit beta  52.42 
 
 		 488 aa  521  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0366  glutamate synthase subunit beta  51.31 
 
 		 489 aa  519  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3262  glutamate synthase subunit beta  52.22 
 
 		 487 aa  521  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0760  glutamate synthase subunit beta  52.8 
 
 		 485 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.423731  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0960  glutamate synthase subunit beta  52.94 
 
 		 484 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.538211  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1009  glutamate synthase subunit beta  52.8 
 
 		 492 aa  517  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0473  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  51.69 
 
 		 489 aa  513  1e-144  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1459  glutamate synthase, NADH/NADPH small subunit  51.02 
 
 		 494 aa  512  1e-144  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.1665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0218  glutamate synthase (NADH) small subunit  53.02 
 
 		 488 aa  514  1e-144  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0876  glutamate synthase subunit beta  52.33 
 
 		 484 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.490935 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6713  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  52.03 
 
 		 495 aa  514  1e-144  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3242  glutamate synthase subunit beta  50.81 
 
 		 487 aa  508  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1936  glutamate synthase subunit beta  51.56 
 
 		 481 aa  510  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.336215  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0306  glutamate synthase subunit beta  53.23 
 
 		 488 aa  510  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2704  glutamate synthase subunit beta  53.23 
 
 		 488 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2787  glutamate synthase subunit beta  52.62 
 
 		 505 aa  508  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0403  glutamate synthase subunit beta  53.23 
 
 		 488 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.709199  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2895  glutamate synthase subunit beta  51.01 
 
 		 487 aa  509  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.217171 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0762  glutamate synthase subunit beta  52.81 
 
 		 496 aa  506  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3656  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  51.21 
 
 		 494 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3500  glutamate synthase subunit beta  53.23 
 
 		 488 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3013  glutamate synthase subunit beta  53.02 
 
 		 488 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2339  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  49.9 
 
 		 482 aa  508  9.999999999999999e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0382  glutamate synthase subunit beta  53.02 
 
 		 488 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5557  glutamate synthase subunit beta  51.29 
 
 		 491 aa  503  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1795  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  51.31 
 
 		 506 aa  503  1e-141  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0843  glutamate synthase subunit beta  52.62 
 
 		 487 aa  502  1e-141  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2627  glutamate synthase subunit beta  52.22 
 
 		 488 aa  504  1e-141  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0895  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  54.21 
 
 		 461 aa  503  1e-141  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426068  normal  0.302268 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2964  glutamate synthase subunit beta  52.82 
 
 		 487 aa  500  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3716  glutamate synthase subunit beta  52.42 
 
 		 488 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.912921  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3012  glutamate synthase subunit beta  51.88 
 
 		 480 aa  500  1e-140  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.183003 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3746  glutamate synthase subunit beta  52.42 
 
 		 488 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1137  glutamate synthase subunit beta  50.3 
 
 		 484 aa  499  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0331749  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2950  glutamate synthase (NADH) small subunit  50.82 
 
 		 492 aa  501  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.227052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3689  glutamate synthase subunit beta  52.02 
 
 		 488 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0613  glutamate synthase subunit beta  52.01 
 
 		 491 aa  498  1e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2735  glutamate synthase subunit beta  52.41 
 
 		 488 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2954  glutamate synthase subunit beta  50.3 
 
 		 484 aa  495  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0855  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  49.9 
 
 		 495 aa  495  1e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.554857  normal  0.298305 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2786  glutamate synthase subunit beta  52.41 
 
 		 488 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5065  glutamate synthase subunit beta  51.85 
 
 		 489 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0108  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  50.82 
 
 		 488 aa  496  1e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808183  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0629  glutamate synthase subunit beta  51.81 
 
 		 491 aa  497  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5153  glutamate synthase subunit beta  51.85 
 
 		 489 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.973427 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3217  glutamate synthase subunit beta  52.41 
 
 		 506 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1768  glutamate synthase subunit beta  52.41 
 
 		 488 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956795  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5444  glutamate synthase subunit beta  51.53 
 
 		 492 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0503  glutamate synthase subunit beta  52.3 
 
 		 492 aa  492  9.999999999999999e-139  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.114994  normal  0.266316 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2693  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  50.91 
 
 		 489 aa  492  9.999999999999999e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207302  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5701  glutamate synthase subunit beta  51.45 
 
 		 486 aa  493  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3021  glutamate synthase subunit beta  50.2 
 
 		 493 aa  494  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0349235  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2396  glutamate synthase subunit beta  49.2 
 
 		 492 aa  492  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3212  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  49.59 
 
 		 495 aa  493  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0119  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  51.45 
 
 		 484 aa  490  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1963  glutamate synthase subunit beta  51.14 
 
 		 473 aa  489  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3015  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  51.81 
 
 		 493 aa  491  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0095  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  50.4 
 
 		 487 aa  487  1e-136  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.440417  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1370  glutamate synthase subunit beta  52.73 
 
 		 482 aa  486  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02910  glutamate synthase (NADH), putative  51.21 
 
 		 2135 aa  482  1e-135  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.844202  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2804  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  50.71 
 
 		 490 aa  483  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3175  glutamate synthase (NADH) small subunit  51.86 
 
 		 477 aa  483  1e-135  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2225  glutamate synthase subunit beta  50.3 
 
 		 494 aa  483  1e-135  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0710  glutamate synthase subunit beta  51.4 
 
 		 492 aa  479  1e-134  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.893657  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1347  glutamate synthase subunit beta  50.1 
 
 		 493 aa  481  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0782  glutamate synthase subunit beta  50 
 
 		 491 aa  481  1e-134  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5697  glutamate synthase subunit beta  50.82 
 
 		 488 aa  480  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159886 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>