More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0322 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3102  glutamate synthase subunit beta  74.39 
 
 		 488 aa  761    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.541547 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0095  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  76.64 
 
 		 487 aa  780    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.440417  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2786  glutamate synthase subunit beta  91.19 
 
 		 488 aa  912    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3689  glutamate synthase subunit beta  91.39 
 
 		 488 aa  914    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0843  glutamate synthase subunit beta  76.64 
 
 		 487 aa  744    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2040  glutamate synthase subunit beta  64.04 
 
 		 479 aa  642    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.401643  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2964  glutamate synthase subunit beta  80.33 
 
 		 487 aa  784    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5557  glutamate synthase subunit beta  74.13 
 
 		 491 aa  754    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536283  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2735  glutamate synthase subunit beta  91.19 
 
 		 488 aa  912    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0218  glutamate synthase (NADH) small subunit  71.02 
 
 		 488 aa  697    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3125  glutamate synthase subunit beta  78.28 
 
 		 487 aa  799    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.996212  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3716  glutamate synthase subunit beta  91.6 
 
 		 488 aa  915    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.912921  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1603  glutamate synthase subunit beta  66 
 
 		 480 aa  642    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.879773  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0264  glutamate synthase (NADH) small subunit  65.31 
 
 		 478 aa  660    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153251  normal  0.0665114 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0331  glutamate synthase subunit beta  99.8 
 
 		 488 aa  1008    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.718365  normal  0.62843 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3500  glutamate synthase subunit beta  97.95 
 
 		 488 aa  967    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1153  glutamate synthase subunit beta  75 
 
 		 492 aa  764    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3746  glutamate synthase subunit beta  91.6 
 
 		 488 aa  915    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3013  glutamate synthase subunit beta  92.01 
 
 		 488 aa  918    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2934  glutamate synthase subunit beta  71.52 
 
 		 488 aa  736    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0792  glutamate synthase subunit beta  73.16 
 
 		 488 aa  758    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.135801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0366  glutamate synthase subunit beta  90.18 
 
 		 489 aa  931    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1768  glutamate synthase subunit beta  91.19 
 
 		 488 aa  912    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956795  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3262  glutamate synthase subunit beta  79.3 
 
 		 487 aa  811    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2627  glutamate synthase subunit beta  71.93 
 
 		 488 aa  717    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0382  glutamate synthase subunit beta  97.13 
 
 		 488 aa  959    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2704  glutamate synthase subunit beta  97.34 
 
 		 488 aa  961    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0710  glutamate synthase subunit beta  73.98 
 
 		 492 aa  716    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.893657  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3395  glutamate synthase subunit beta  72.3 
 
 		 491 aa  741    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2895  glutamate synthase subunit beta  79.51 
 
 		 487 aa  805    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.217171 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0322  glutamate synthase subunit beta  100 
 
 		 488 aa  1009    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3590  glutamate synthase subunit beta  90.18 
 
 		 489 aa  927    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.633224  hitchhiker  0.00000356893 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2787  glutamate synthase subunit beta  89.75 
 
 		 505 aa  905    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0403  glutamate synthase subunit beta  97.34 
 
 		 488 aa  961    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.709199  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0306  glutamate synthase subunit beta  96.11 
 
 		 488 aa  953    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3242  glutamate synthase subunit beta  79.92 
 
 		 487 aa  807    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1009  glutamate synthase subunit beta  75.41 
 
 		 492 aa  766    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0684  glutamate synthase subunit beta  74.39 
 
 		 488 aa  766    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.874899 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0742  glutamate synthase subunit beta  73.58 
 
 		 492 aa  712    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0648887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3217  glutamate synthase subunit beta  91.19 
 
 		 506 aa  912    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2396  glutamate synthase subunit beta  69.92 
 
 		 492 aa  723    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3032  glutamate synthase subunit beta  61.51 
 
 		 472 aa  617  1e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3175  glutamate synthase (NADH) small subunit  65.18 
 
 		 477 aa  614  9.999999999999999e-175  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1137  glutamate synthase subunit beta  61.12 
 
 		 484 aa  607  9.999999999999999e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0331749  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3874  glutamate synthase subunit beta  61.3 
 
 		 472 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134009 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0760  glutamate synthase subunit beta  60.8 
 
 		 485 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.423731  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0876  glutamate synthase subunit beta  59.8 
 
 		 484 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.490935 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2954  glutamate synthase subunit beta  58.84 
 
 		 484 aa  595  1e-169  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4530  glutamate synthase subunit beta  59.8 
 
 		 484 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0960  glutamate synthase subunit beta  59.8 
 
 		 484 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.538211  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1616  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  59.28 
 
 		 488 aa  585  1e-166  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1963  glutamate synthase subunit beta  60.69 
 
 		 473 aa  577  1.0000000000000001e-163  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1370  glutamate synthase subunit beta  59.2 
 
 		 482 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3679  glutamate synthase (NADH) small subunit  56.76 
 
 		 471 aa  556  1e-157  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.15931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3777  glutamate synthase subunit beta  55.95 
 
 		 500 aa  557  1e-157  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0731  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  56.25 
 
 		 491 aa  545  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000132905 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2320  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  55.67 
 
 		 496 aa  548  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106456  normal  0.283017 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2160  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  54.56 
 
 		 484 aa  546  1e-154  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0037  glutamate synthase subunit beta  56.25 
 
 		 477 aa  545  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3267  glutamate synthase subunit beta  56.36 
 
 		 477 aa  542  1e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.534293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3591  glutamate synthase subunit beta  56.36 
 
 		 477 aa  542  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.118629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3465  glutamate synthase subunit beta  55.04 
 
 		 477 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.590112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5478  glutamate synthase subunit beta  56.35 
 
 		 502 aa  540  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0707  glutamate synthase (NADH) small subunit  54.64 
 
 		 482 aa  540  9.999999999999999e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153272 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1811  glutamate synthase subunit beta  58.1 
 
 		 476 aa  537  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228111  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1172  glutamate synthase subunit beta  56.57 
 
 		 477 aa  531  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.203047  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1115  glutamate synthase subunit beta  56.43 
 
 		 491 aa  524  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal  0.334154 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00927  glutamate synthase subunit beta  53.43 
 
 		 489 aa  522  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1261  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  53.61 
 
 		 492 aa  521  1e-147  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004467  glutamate synthase [NADPH] small chain  53.43 
 
 		 489 aa  523  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1953  glutamate synthase subunit beta  53.12 
 
 		 489 aa  520  1e-146  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5697  glutamate synthase subunit beta  55.26 
 
 		 488 aa  519  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159886 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2865  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  53.24 
 
 		 487 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000168893  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3165  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  53.88 
 
 		 484 aa  511  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00040465  normal  0.173868 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2132  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  53.23 
 
 		 488 aa  514  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.550582  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0119  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  53.99 
 
 		 484 aa  514  1e-144  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5065  glutamate synthase subunit beta  55.35 
 
 		 489 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0342  glutamate synthase (NADH) small subunit  54.27 
 
 		 475 aa  512  1e-144  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2563  glutamate synthase subunit beta  52.02 
 
 		 490 aa  513  1e-144  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5153  glutamate synthase subunit beta  55.35 
 
 		 489 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.973427 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5444  glutamate synthase subunit beta  55.02 
 
 		 492 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3615  glutamate synthase subunit beta  52 
 
 		 491 aa  510  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.28988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1174  glutamate synthase (NADH) small subunit  53.67 
 
 		 485 aa  511  1e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3316  glutamate synthase subunit beta  52.2 
 
 		 491 aa  511  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0476  glutamate synthase subunit beta  57.69 
 
 		 473 aa  509  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.638304  normal  0.914259 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13894  glutamate synthase subunit beta  54.86 
 
 		 488 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2339  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  50.8 
 
 		 482 aa  507  9.999999999999999e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2743  glutamate synthase subunit beta  53.49 
 
 		 484 aa  507  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.664254  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0108  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  52.23 
 
 		 488 aa  502  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808183  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1936  glutamate synthase subunit beta  53.58 
 
 		 481 aa  502  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.336215  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2950  glutamate synthase (NADH) small subunit  53.04 
 
 		 492 aa  502  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.227052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3212  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  52.1 
 
 		 495 aa  500  1e-140  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1692  glutamate synthase subunit beta  51.63 
 
 		 485 aa  500  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0179657  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3012  glutamate synthase subunit beta  53.99 
 
 		 480 aa  496  1e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.183003 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3021  glutamate synthase subunit beta  53.01 
 
 		 493 aa  498  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0349235  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1459  glutamate synthase, NADH/NADPH small subunit  52.22 
 
 		 494 aa  496  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.1665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2710  glutamate synthase subunit beta  53.39 
 
 		 485 aa  492  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.405041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1079  glutamate synthase (NADH) small subunit  53.75 
 
 		 486 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1008  glutamate synthase subunit beta  49.4 
 
 		 489 aa  491  9.999999999999999e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6713  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  52.1 
 
 		 495 aa  489  1e-137  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>