More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1936 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5701  glutamate synthase subunit beta  65.84 
 
 		 486 aa  635    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2950  glutamate synthase (NADH) small subunit  70.82 
 
 		 492 aa  692    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.227052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1115  glutamate synthase subunit beta  68.78 
 
 		 491 aa  664    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal  0.334154 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13894  glutamate synthase subunit beta  70.84 
 
 		 488 aa  669    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1174  glutamate synthase (NADH) small subunit  69.29 
 
 		 485 aa  672    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3212  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  71.22 
 
 		 495 aa  702    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2865  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  70.31 
 
 		 487 aa  696    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000168893  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3012  glutamate synthase subunit beta  86.67 
 
 		 480 aa  830    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.183003 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3165  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  68.88 
 
 		 484 aa  686    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00040465  normal  0.173868 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5065  glutamate synthase subunit beta  71.66 
 
 		 489 aa  685    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5444  glutamate synthase subunit beta  71.02 
 
 		 492 aa  684    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0119  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  71.52 
 
 		 484 aa  688    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1936  glutamate synthase subunit beta  100 
 
 		 481 aa  970    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.336215  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1079  glutamate synthase (NADH) small subunit  71.13 
 
 		 486 aa  642    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1459  glutamate synthase, NADH/NADPH small subunit  68.29 
 
 		 494 aa  670    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.1665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3021  glutamate synthase subunit beta  68.57 
 
 		 493 aa  649    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0349235  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5153  glutamate synthase subunit beta  71.66 
 
 		 489 aa  685    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.973427 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5697  glutamate synthase subunit beta  70.23 
 
 		 488 aa  674    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159886 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0108  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  68.17 
 
 		 488 aa  661    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808183  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1692  glutamate synthase subunit beta  63.2 
 
 		 485 aa  612  9.999999999999999e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0179657  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2960  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  63.73 
 
 		 485 aa  593  1e-168  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3679  glutamate synthase (NADH) small subunit  62.74 
 
 		 471 aa  594  1e-168  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.15931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1687  glutamate synthase subunit beta  63.2 
 
 		 485 aa  590  1e-167  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000871139 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3071  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  62.53 
 
 		 487 aa  585  1e-166  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000130486  hitchhiker  0.00545228 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20700  glutamate synthase (NADH) small subunit  62.24 
 
 		 488 aa  584  1.0000000000000001e-165  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.176887  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3592  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  61.4 
 
 		 502 aa  571  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4693  normal  0.0250321 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1504  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  60.17 
 
 		 488 aa  568  1e-161  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.465203  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3043  glutamate synthase (NADH) small subunit  61.72 
 
 		 502 aa  569  1e-161  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.119225  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3102  glutamate synthase (NADH) small subunit  61.72 
 
 		 502 aa  569  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3059  glutamate synthase (NADH) small subunit  61.52 
 
 		 502 aa  568  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.519079  normal  0.394132 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5692  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  61.04 
 
 		 500 aa  567  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2216  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  59.79 
 
 		 488 aa  566  1e-160  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2823  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  60.2 
 
 		 502 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.366322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0473  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  58.33 
 
 		 489 aa  559  1e-158  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28030  glutamate synthase (NADH) small subunit  59.72 
 
 		 501 aa  559  1e-158  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.328015 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1981  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  61.2 
 
 		 491 aa  559  1e-158  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.376175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3777  glutamate synthase subunit beta  53.24 
 
 		 500 aa  551  1e-156  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2941  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  57.43 
 
 		 501 aa  546  1e-154  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0286232  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6713  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  57.84 
 
 		 495 aa  536  1e-151  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0264  glutamate synthase (NADH) small subunit  56.99 
 
 		 478 aa  534  1e-150  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153251  normal  0.0665114 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2320  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  54.62 
 
 		 496 aa  533  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106456  normal  0.283017 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0342  glutamate synthase (NADH) small subunit  60.96 
 
 		 475 aa  532  1e-150  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2426  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  61.81 
 
 		 494 aa  531  1e-149  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0689344  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0731  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  54.49 
 
 		 491 aa  527  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000132905 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11010  glutamate synthase (NADH) small subunit  58.18 
 
 		 486 aa  524  1e-147  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.709567  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5478  glutamate synthase subunit beta  52.11 
 
 		 502 aa  523  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1603  glutamate synthase subunit beta  55.62 
 
 		 480 aa  522  1e-147  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.879773  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0707  glutamate synthase (NADH) small subunit  53.11 
 
 		 482 aa  523  1e-147  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153272 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3032  glutamate synthase subunit beta  56.84 
 
 		 472 aa  519  1e-146  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3166  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  59.24 
 
 		 501 aa  518  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0116079 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2040  glutamate synthase subunit beta  56.16 
 
 		 479 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.401643  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1261  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  56.11 
 
 		 492 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0855  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  57.06 
 
 		 495 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.554857  normal  0.298305 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0366  glutamate synthase subunit beta  53.67 
 
 		 489 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3395  glutamate synthase subunit beta  53.46 
 
 		 491 aa  517  1.0000000000000001e-145  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3806  glutamate synthase NADH/NADPH, small subunit  59.47 
 
 		 488 aa  512  1e-144  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319112  hitchhiker  0.00341242 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1220  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  57.41 
 
 		 487 aa  514  1e-144  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.462072  normal  0.673117 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0566  glutamate synthase subunit beta  54.33 
 
 		 512 aa  511  1e-144  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004467  glutamate synthase [NADPH] small chain  52.9 
 
 		 489 aa  512  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0322  glutamate synthase subunit beta  53.58 
 
 		 488 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0331  glutamate synthase subunit beta  53.58 
 
 		 488 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.718365  normal  0.62843 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00927  glutamate synthase subunit beta  53.11 
 
 		 489 aa  513  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0866  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  55.56 
 
 		 495 aa  509  1e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1153  glutamate synthase subunit beta  52.54 
 
 		 492 aa  508  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0818  glutamate synthase (NADH) small subunit  55.96 
 
 		 495 aa  511  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2627  glutamate synthase subunit beta  55.83 
 
 		 488 aa  510  1e-143  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0870  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  55.76 
 
 		 495 aa  510  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2563  glutamate synthase subunit beta  52.49 
 
 		 490 aa  508  1e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3590  glutamate synthase subunit beta  52.86 
 
 		 489 aa  508  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.633224  hitchhiker  0.00000356893 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1953  glutamate synthase subunit beta  52.49 
 
 		 489 aa  505  9.999999999999999e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2693  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  52.34 
 
 		 489 aa  505  9.999999999999999e-143  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207302  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3125  glutamate synthase subunit beta  53.78 
 
 		 487 aa  508  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.996212  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2132  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  51.56 
 
 		 488 aa  508  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.550582  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0792  glutamate synthase subunit beta  52.35 
 
 		 488 aa  508  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.135801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0960  glutamate synthase subunit beta  56.06 
 
 		 484 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.538211  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0843  glutamate synthase subunit beta  55.01 
 
 		 487 aa  505  9.999999999999999e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1009  glutamate synthase subunit beta  52.74 
 
 		 492 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0684  glutamate synthase subunit beta  52.97 
 
 		 488 aa  506  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.874899 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1616  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  53.59 
 
 		 488 aa  503  1e-141  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3656  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  53.12 
 
 		 494 aa  502  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4530  glutamate synthase subunit beta  54.41 
 
 		 484 aa  501  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0876  glutamate synthase subunit beta  54.62 
 
 		 484 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.490935 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3874  glutamate synthase subunit beta  54.11 
 
 		 472 aa  503  1e-141  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134009 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2396  glutamate synthase subunit beta  53.75 
 
 		 492 aa  503  1e-141  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2160  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  51.05 
 
 		 484 aa  499  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0218  glutamate synthase (NADH) small subunit  53.06 
 
 		 488 aa  499  1e-140  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5557  glutamate synthase subunit beta  51.63 
 
 		 491 aa  498  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0760  glutamate synthase subunit beta  55.12 
 
 		 485 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.423731  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1008  glutamate synthase subunit beta  51.24 
 
 		 489 aa  500  1e-140  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3102  glutamate synthase subunit beta  51.94 
 
 		 488 aa  497  1e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.541547 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2954  glutamate synthase subunit beta  54.62 
 
 		 484 aa  496  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3391  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  59.4 
 
 		 501 aa  497  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.498468  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1137  glutamate synthase subunit beta  55.03 
 
 		 484 aa  496  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0331749  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3262  glutamate synthase subunit beta  52.97 
 
 		 487 aa  496  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0306  glutamate synthase subunit beta  54.4 
 
 		 488 aa  495  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2787  glutamate synthase subunit beta  53.99 
 
 		 505 aa  496  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3689  glutamate synthase subunit beta  54.4 
 
 		 488 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3746  glutamate synthase subunit beta  54.4 
 
 		 488 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3716  glutamate synthase subunit beta  54.4 
 
 		 488 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.912921  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3013  glutamate synthase subunit beta  54.4 
 
 		 488 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>