More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0382 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_1153  glutamate synthase subunit beta  74.8 
 
 
492 aa  764    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0264  glutamate synthase (NADH) small subunit  64.71 
 
 
478 aa  652    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153251  normal  0.0665114 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3746  glutamate synthase subunit beta  92.83 
 
 
488 aa  927    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3102  glutamate synthase subunit beta  73.98 
 
 
488 aa  757    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.541547 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3689  glutamate synthase subunit beta  92.62 
 
 
488 aa  925    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3242  glutamate synthase subunit beta  80.12 
 
 
487 aa  805    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2040  glutamate synthase subunit beta  63.84 
 
 
479 aa  638    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.401643  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2964  glutamate synthase subunit beta  79.92 
 
 
487 aa  775    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2786  glutamate synthase subunit beta  92.42 
 
 
488 aa  924    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2735  glutamate synthase subunit beta  92.42 
 
 
488 aa  924    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5557  glutamate synthase subunit beta  74.13 
 
 
491 aa  753    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536283  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0218  glutamate synthase (NADH) small subunit  72.04 
 
 
488 aa  700    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3125  glutamate synthase subunit beta  78.48 
 
 
487 aa  796    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.996212  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1768  glutamate synthase subunit beta  92.42 
 
 
488 aa  924    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956795  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3716  glutamate synthase subunit beta  92.83 
 
 
488 aa  927    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.912921  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1603  glutamate synthase subunit beta  65.59 
 
 
480 aa  638    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.879773  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3500  glutamate synthase subunit beta  97.95 
 
 
488 aa  969    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0710  glutamate synthase subunit beta  74.19 
 
 
492 aa  715    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.893657  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0306  glutamate synthase subunit beta  96.72 
 
 
488 aa  961    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3013  glutamate synthase subunit beta  93.24 
 
 
488 aa  930    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2934  glutamate synthase subunit beta  70.7 
 
 
488 aa  727    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0792  glutamate synthase subunit beta  72.54 
 
 
488 aa  752    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.135801  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0366  glutamate synthase subunit beta  90.8 
 
 
489 aa  933    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3395  glutamate synthase subunit beta  72.1 
 
 
491 aa  737    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3262  glutamate synthase subunit beta  79.1 
 
 
487 aa  805    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2627  glutamate synthase subunit beta  71.52 
 
 
488 aa  711    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0331  glutamate synthase subunit beta  97.34 
 
 
488 aa  986    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.718365  normal  0.62843 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2704  glutamate synthase subunit beta  99.8 
 
 
488 aa  1007    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2895  glutamate synthase subunit beta  79.51 
 
 
487 aa  800    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.217171 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0095  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  76.43 
 
 
487 aa  779    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.440417  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0322  glutamate synthase subunit beta  97.13 
 
 
488 aa  984    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0382  glutamate synthase subunit beta  100 
 
 
488 aa  1009    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3590  glutamate synthase subunit beta  90.39 
 
 
489 aa  928    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.633224  hitchhiker  0.00000356893 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2787  glutamate synthase subunit beta  90.16 
 
 
505 aa  906    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0403  glutamate synthase subunit beta  99.8 
 
 
488 aa  1007    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.709199  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0843  glutamate synthase subunit beta  76.43 
 
 
487 aa  743    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1009  glutamate synthase subunit beta  75.2 
 
 
492 aa  766    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0684  glutamate synthase subunit beta  74.18 
 
 
488 aa  764    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.874899 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0742  glutamate synthase subunit beta  73.78 
 
 
492 aa  711    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0648887  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3217  glutamate synthase subunit beta  92.42 
 
 
506 aa  924    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2396  glutamate synthase subunit beta  70.33 
 
 
492 aa  730    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3032  glutamate synthase subunit beta  61.3 
 
 
472 aa  614  9.999999999999999e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3874  glutamate synthase subunit beta  61.51 
 
 
472 aa  610  1e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134009 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3175  glutamate synthase (NADH) small subunit  64.98 
 
 
477 aa  608  1e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1137  glutamate synthase subunit beta  61.32 
 
 
484 aa  609  1e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0331749  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0760  glutamate synthase subunit beta  61 
 
 
485 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.423731  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0876  glutamate synthase subunit beta  60 
 
 
484 aa  599  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.490935 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2954  glutamate synthase subunit beta  59.04 
 
 
484 aa  594  1e-168  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4530  glutamate synthase subunit beta  59.8 
 
 
484 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0960  glutamate synthase subunit beta  60 
 
 
484 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.538211  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1616  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  59.08 
 
 
488 aa  583  1.0000000000000001e-165  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1963  glutamate synthase subunit beta  60.49 
 
 
473 aa  570  1e-161  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1370  glutamate synthase subunit beta  59.72 
 
 
482 aa  565  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3679  glutamate synthase (NADH) small subunit  56.11 
 
 
471 aa  548  1e-155  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.15931  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0037  glutamate synthase subunit beta  56.65 
 
 
477 aa  549  1e-155  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359975  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3777  glutamate synthase subunit beta  55.36 
 
 
500 aa  550  1e-155  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3591  glutamate synthase subunit beta  56.36 
 
 
477 aa  545  1e-154  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.118629  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0731  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  56.36 
 
 
491 aa  546  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000132905 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2320  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  55.67 
 
 
496 aa  548  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106456  normal  0.283017 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3267  glutamate synthase subunit beta  56.36 
 
 
477 aa  545  1e-154  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.534293 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3465  glutamate synthase subunit beta  55.33 
 
 
477 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.590112  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5478  glutamate synthase subunit beta  56.15 
 
 
502 aa  536  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2160  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  52.94 
 
 
484 aa  532  1e-150  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0707  glutamate synthase (NADH) small subunit  54.67 
 
 
482 aa  534  1e-150  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.153272 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1811  glutamate synthase subunit beta  58.3 
 
 
476 aa  532  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228111  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1172  glutamate synthase subunit beta  56.77 
 
 
477 aa  527  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.203047  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1115  glutamate synthase subunit beta  55.62 
 
 
491 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal  0.334154 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1261  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  53.41 
 
 
492 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2865  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  53.04 
 
 
487 aa  513  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000168893  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2132  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  53.02 
 
 
488 aa  513  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.550582  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1953  glutamate synthase subunit beta  52.72 
 
 
489 aa  513  1e-144  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2339  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  51.2 
 
 
482 aa  508  1e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0476  glutamate synthase subunit beta  58.1 
 
 
473 aa  510  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.638304  normal  0.914259 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00927  glutamate synthase subunit beta  52.42 
 
 
489 aa  509  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3165  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  54.08 
 
 
484 aa  510  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00040465  normal  0.173868 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5065  glutamate synthase subunit beta  55.15 
 
 
489 aa  508  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2743  glutamate synthase subunit beta  53.89 
 
 
484 aa  510  1e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.664254  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004467  glutamate synthase [NADPH] small chain  52.42 
 
 
489 aa  509  1e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3615  glutamate synthase subunit beta  52.2 
 
 
491 aa  510  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.28988  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3316  glutamate synthase subunit beta  52.2 
 
 
491 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5153  glutamate synthase subunit beta  55.15 
 
 
489 aa  508  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.973427 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0119  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  53.58 
 
 
484 aa  508  9.999999999999999e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1174  glutamate synthase (NADH) small subunit  53.47 
 
 
485 aa  508  9.999999999999999e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5444  glutamate synthase subunit beta  54.82 
 
 
492 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0342  glutamate synthase (NADH) small subunit  53.86 
 
 
475 aa  506  9.999999999999999e-143  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5697  glutamate synthase subunit beta  54.05 
 
 
488 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.159886 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1936  glutamate synthase subunit beta  53.58 
 
 
481 aa  502  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.336215  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13894  glutamate synthase subunit beta  54.25 
 
 
488 aa  499  1e-140  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0108  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  51.82 
 
 
488 aa  498  1e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808183  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2563  glutamate synthase subunit beta  51.01 
 
 
490 aa  498  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2950  glutamate synthase (NADH) small subunit  52.63 
 
 
492 aa  495  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.227052  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3012  glutamate synthase subunit beta  53.78 
 
 
480 aa  493  9.999999999999999e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.183003 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2710  glutamate synthase subunit beta  53.09 
 
 
485 aa  493  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.405041  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1459  glutamate synthase, NADH/NADPH small subunit  52.02 
 
 
494 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.1665  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6713  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  51.99 
 
 
495 aa  488  1e-137  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3212  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  50.9 
 
 
495 aa  489  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1692  glutamate synthase subunit beta  50.61 
 
 
485 aa  490  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0179657  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3021  glutamate synthase subunit beta  52.61 
 
 
493 aa  491  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0349235  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05134  Glutamate synthase Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y8F4]  50.99 
 
 
2126 aa  486  1e-136  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5701  glutamate synthase subunit beta  52.43 
 
 
486 aa  488  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>