More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0119 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3212  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  67.61 
 
 
495 aa  660    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1174  glutamate synthase (NADH) small subunit  68.75 
 
 
485 aa  676    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5444  glutamate synthase subunit beta  78.7 
 
 
492 aa  761    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2865  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  67.15 
 
 
487 aa  674    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000168893  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1936  glutamate synthase subunit beta  71.52 
 
 
481 aa  686    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.336215  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0119  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  100 
 
 
484 aa  992    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3012  glutamate synthase subunit beta  70.69 
 
 
480 aa  667    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.183003 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0108  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  79.96 
 
 
488 aa  794    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808183  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1459  glutamate synthase, NADH/NADPH small subunit  66.4 
 
 
494 aa  649    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.1665  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13894  glutamate synthase subunit beta  75.62 
 
 
488 aa  729    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5065  glutamate synthase subunit beta  79.8 
 
 
489 aa  770    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2950  glutamate synthase (NADH) small subunit  66.46 
 
 
492 aa  652    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.227052  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5153  glutamate synthase subunit beta  79.8 
 
 
489 aa  770    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.973427 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3165  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  68.54 
 
 
484 aa  677    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00040465  normal  0.173868 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5697  glutamate synthase subunit beta  78.32 
 
 
488 aa  764    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.159886 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1115  glutamate synthase subunit beta  76.63 
 
 
491 aa  750    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal  0.334154 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1692  glutamate synthase subunit beta  63.9 
 
 
485 aa  633  1e-180  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0179657  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20700  glutamate synthase (NADH) small subunit  64.14 
 
 
488 aa  630  1e-179  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.176887  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5701  glutamate synthase subunit beta  64.94 
 
 
486 aa  627  1e-178  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1079  glutamate synthase (NADH) small subunit  68.39 
 
 
486 aa  622  1e-177  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3021  glutamate synthase subunit beta  65.92 
 
 
493 aa  624  1e-177  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0349235  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2960  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  63.94 
 
 
485 aa  620  1e-176  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1687  glutamate synthase subunit beta  63.28 
 
 
485 aa  608  1e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000871139 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1981  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  63.14 
 
 
491 aa  605  9.999999999999999e-173  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.376175  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2216  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  60.33 
 
 
488 aa  593  1e-168  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45323  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3679  glutamate synthase (NADH) small subunit  61.97 
 
 
471 aa  585  1e-166  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.15931  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1504  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  59.92 
 
 
488 aa  578  1e-164  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.465203  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3071  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  61.55 
 
 
487 aa  569  1e-161  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000130486  hitchhiker  0.00545228 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1220  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  58.32 
 
 
487 aa  557  1e-157  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.462072  normal  0.673117 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2426  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  62.24 
 
 
494 aa  554  1e-156  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0689344  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2320  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  57.46 
 
 
496 aa  551  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106456  normal  0.283017 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1153  glutamate synthase subunit beta  55.78 
 
 
492 aa  549  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0792  glutamate synthase subunit beta  55.01 
 
 
488 aa  546  1e-154  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.135801  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3777  glutamate synthase subunit beta  54.18 
 
 
500 aa  546  1e-154  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0473  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  58.44 
 
 
489 aa  545  1e-154  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3395  glutamate synthase subunit beta  55.08 
 
 
491 aa  540  9.999999999999999e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0684  glutamate synthase subunit beta  54.6 
 
 
488 aa  540  9.999999999999999e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.874899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0264  glutamate synthase (NADH) small subunit  55.65 
 
 
478 aa  537  1e-151  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153251  normal  0.0665114 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1261  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  57.23 
 
 
492 aa  538  1e-151  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5478  glutamate synthase subunit beta  55.8 
 
 
502 aa  535  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11010  glutamate synthase (NADH) small subunit  57.29 
 
 
486 aa  535  1e-151  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.709567  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1009  glutamate synthase subunit beta  55.38 
 
 
492 aa  535  1e-151  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3102  glutamate synthase subunit beta  55.21 
 
 
488 aa  533  1e-150  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.541547 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3590  glutamate synthase subunit beta  54.08 
 
 
489 aa  531  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.633224  hitchhiker  0.00000356893 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2895  glutamate synthase subunit beta  55.51 
 
 
487 aa  530  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.217171 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3125  glutamate synthase subunit beta  55.62 
 
 
487 aa  528  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.996212  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0366  glutamate synthase subunit beta  53.67 
 
 
489 aa  530  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0342  glutamate synthase (NADH) small subunit  59.17 
 
 
475 aa  529  1e-149  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3032  glutamate synthase subunit beta  55.35 
 
 
472 aa  529  1e-149  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3242  glutamate synthase subunit beta  55.31 
 
 
487 aa  529  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5692  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  57.43 
 
 
500 aa  531  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0331  glutamate synthase subunit beta  53.99 
 
 
488 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.718365  normal  0.62843 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0322  glutamate synthase subunit beta  53.99 
 
 
488 aa  528  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0566  glutamate synthase subunit beta  54.15 
 
 
512 aa  524  1e-147  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5557  glutamate synthase subunit beta  53.86 
 
 
491 aa  525  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536283  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0707  glutamate synthase (NADH) small subunit  53.93 
 
 
482 aa  521  1e-147  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.153272 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0843  glutamate synthase subunit beta  56.85 
 
 
487 aa  518  1e-146  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2934  glutamate synthase subunit beta  52.76 
 
 
488 aa  520  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2396  glutamate synthase subunit beta  53.35 
 
 
492 aa  521  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2040  glutamate synthase subunit beta  53.64 
 
 
479 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.401643  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3262  glutamate synthase subunit beta  53.78 
 
 
487 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6713  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  54.15 
 
 
495 aa  511  1e-144  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1603  glutamate synthase subunit beta  53.54 
 
 
480 aa  514  1e-144  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.879773  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2693  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  52.85 
 
 
489 aa  512  1e-144  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207302  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0731  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  52.66 
 
 
491 aa  508  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000132905 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3592  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  57.14 
 
 
502 aa  509  1e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4693  normal  0.0250321 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3043  glutamate synthase (NADH) small subunit  57.55 
 
 
502 aa  511  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.119225  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3059  glutamate synthase (NADH) small subunit  57.75 
 
 
502 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.519079  normal  0.394132 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2941  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  54.51 
 
 
501 aa  511  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0286232  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3102  glutamate synthase (NADH) small subunit  57.55 
 
 
502 aa  511  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2787  glutamate synthase subunit beta  54.6 
 
 
505 aa  509  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28030  glutamate synthase (NADH) small subunit  56 
 
 
501 aa  506  9.999999999999999e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.328015 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2627  glutamate synthase subunit beta  55.42 
 
 
488 aa  508  9.999999999999999e-143  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2160  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  52.84 
 
 
484 aa  502  1e-141  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2954  glutamate synthase subunit beta  53.88 
 
 
484 aa  502  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2823  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  57.14 
 
 
502 aa  502  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.366322  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0742  glutamate synthase subunit beta  54.36 
 
 
492 aa  504  1e-141  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0648887  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2964  glutamate synthase subunit beta  55.1 
 
 
487 aa  501  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3716  glutamate synthase subunit beta  54.19 
 
 
488 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.912921  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3746  glutamate synthase subunit beta  54.19 
 
 
488 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0710  glutamate synthase subunit beta  54.16 
 
 
492 aa  501  1e-140  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.893657  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3013  glutamate synthase subunit beta  54.19 
 
 
488 aa  500  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0306  glutamate synthase subunit beta  54.4 
 
 
488 aa  501  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3689  glutamate synthase subunit beta  54.19 
 
 
488 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2786  glutamate synthase subunit beta  53.99 
 
 
488 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2735  glutamate synthase subunit beta  53.99 
 
 
488 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1768  glutamate synthase subunit beta  53.99 
 
 
488 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956795  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3500  glutamate synthase subunit beta  53.37 
 
 
488 aa  498  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1137  glutamate synthase subunit beta  53.47 
 
 
484 aa  498  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0331749  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0382  glutamate synthase subunit beta  53.58 
 
 
488 aa  498  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3874  glutamate synthase subunit beta  51.99 
 
 
472 aa  497  1e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134009 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2704  glutamate synthase subunit beta  53.58 
 
 
488 aa  498  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0403  glutamate synthase subunit beta  53.58 
 
 
488 aa  498  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.709199  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0960  glutamate synthase subunit beta  53.37 
 
 
484 aa  495  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.538211  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3217  glutamate synthase subunit beta  53.99 
 
 
506 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3166  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  56.65 
 
 
501 aa  491  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0116079 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0218  glutamate synthase (NADH) small subunit  53.97 
 
 
488 aa  492  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3656  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  52.52 
 
 
494 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1963  glutamate synthase subunit beta  54.76 
 
 
473 aa  494  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00927  glutamate synthase subunit beta  51.24 
 
 
489 aa  489  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>