70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_50942 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009048  PICST_50942  predicted protein  100 
 
 		 351 aa  725    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.920544 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03928  Putative thiazole synthaseTHI4_ASPOR Thiazole biosynthetic enzyme, mitochondrial ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q76B84]  63.25 
 
 		 331 aa  421  1e-117  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.514294 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2426  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  32.87 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00205999  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0142  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  35.66 
 
 		 248 aa  129  6e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0140  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  35.31 
 
 		 248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0002  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  33.66 
 
 		 307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2718  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  33.11 
 
 		 308 aa  125  8.000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1462  thiazole biosynthesis enzyme  32.78 
 
 		 310 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2419  thiazole biosynthesis enzyme  33.67 
 
 		 309 aa  124  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1411  thiazole biosynthesis enzyme  35.34 
 
 		 267 aa  124  3e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0678  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  31.42 
 
 		 272 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0963  thiazole biosynthesis enzyme  30.88 
 
 		 254 aa  120  3e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0277  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  31.91 
 
 		 255 aa  119  7e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.720039 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2221  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  32.01 
 
 		 271 aa  116  5e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000384751 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2980  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  32.55 
 
 		 309 aa  116  6.9999999999999995e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1609  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  31.19 
 
 		 268 aa  115  7.999999999999999e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000241948  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1420  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  29.49 
 
 		 263 aa  113  6e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.043335 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1422  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  30.9 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1007  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  34.28 
 
 		 256 aa  110  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2251  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  34.38 
 
 		 254 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1935  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  32.64 
 
 		 254 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1358  thiazole biosynthesis enzyme  33.22 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000774298  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0421  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  33.1 
 
 		 271 aa  103  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000154841  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1998  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  30.85 
 
 		 273 aa  103  4e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.310517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1555  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  30.14 
 
 		 261 aa  101  2e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1498  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  30.5 
 
 		 275 aa  101  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.16629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1121  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  33.68 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1052  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  30.14 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.273545  normal  0.78871 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1590  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  30.28 
 
 		 258 aa  95.1  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00059443  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2109  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  30.34 
 
 		 258 aa  93.2  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2100  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  30.04 
 
 		 260 aa  92.4  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0859  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  29.07 
 
 		 259 aa  87.8  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.841302  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0663  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  29.51 
 
 		 261 aa  86.3  8e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.397509  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0597  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  30.56 
 
 		 262 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.469921  normal  0.642946 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1321  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  30.56 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0226  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  30.56 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0798  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  28.98 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0725876  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0682  Putrescine oxidase  53.33 
 
 		 512 aa  54.3  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.016891  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1195  FAD dependent oxidoreductase  57.14 
 
 		 438 aa  53.1  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1260  FAD dependent oxidoreductase  55.1 
 
 		 438 aa  51.2  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2906  FAD dependent oxidoreductase  29.53 
 
 		 474 aa  49.3  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000261915  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2675  FAD dependent oxidoreductase  39.77 
 
 		 468 aa  47  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496606 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19770  hypothetical protein  44.07 
 
 		 468 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1987  FAD dependent oxidoreductase  46.55 
 
 		 465 aa  46.6  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129488  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0905  FAD dependent oxidoreductase  48.08 
 
 		 468 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.358766 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0868  hypothetical protein  42.65 
 
 		 539 aa  46.2  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.210326 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6023  hypothetical protein  45.28 
 
 		 466 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2153  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 475 aa  45.4  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.518095  normal  0.441318 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1885  protoporphyrinogen oxidase  54.05 
 
 		 466 aa  45.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000633111  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0875  FAD dependent oxidoreductase  46.15 
 
 		 476 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.120395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1919  protoporphyrinogen oxidase  54.05 
 
 		 466 aa  45.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206772  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2225  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  37.93 
 
 		 536 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.20285  hitchhiker  0.0000177455 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1702  hypothetical protein  44.07 
 
 		 468 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5086  FAD dependent oxidoreductase  45 
 
 		 456 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.973879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5174  FAD dependent oxidoreductase  45 
 
 		 456 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5464  FAD dependent oxidoreductase  45 
 
 		 456 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4303  FAD dependent oxidoreductase  44.23 
 
 		 468 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0919  FAD dependent oxidoreductase  43.4 
 
 		 475 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108527  normal  0.544612 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2910  hypothetical protein  36.62 
 
 		 493 aa  43.5  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0651  putative flavin-containing monooxygenase  40.62 
 
 		 500 aa  43.5  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4519  FAD dependent oxidoreductase  53.49 
 
 		 506 aa  43.1  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1344  sarcosine oxidase beta subunit family protein  35.21 
 
 		 415 aa  43.1  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0947006  normal  0.025984 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1877  sarcosine oxidase beta subunit family protein  35.21 
 
 		 415 aa  43.1  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0969  sarcosine oxidase beta subunit family protein  29.17 
 
 		 431 aa  43.1  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2686  putative sarcosine oxidase beta subunit  35.21 
 
 		 415 aa  43.1  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0604356  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0622  FAD dependent oxidoreductase  48.15 
 
 		 463 aa  42.7  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3143  FAD dependent oxidoreductase  41.07 
 
 		 491 aa  43.1  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08898  flavin-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02570)  41.94 
 
 		 486 aa  43.1  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0607  2-octaprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase UbiH  41.3 
 
 		 406 aa  42.7  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1999  S6 modification enzyme RimK  38.36 
 
 		 545 aa  42.7  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.329248  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>