293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1999 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_4121  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  66.91 
 
 		 549 aa  773    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1439  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  60.4 
 
 		 557 aa  665    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1788  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  60.58 
 
 		 557 aa  667    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0282  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  61.64 
 
 		 555 aa  736    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00443387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4794  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  67.27 
 
 		 549 aa  782    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0795464  hitchhiker  0.00000316317 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0276  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  67.45 
 
 		 549 aa  784    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5364  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  60.22 
 
 		 557 aa  661    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.798054  normal  0.228806 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1988  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.64 
 
 		 545 aa  639    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.964915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0086  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  67.64 
 
 		 549 aa  784    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0288135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0942  putative electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  59.12 
 
 		 557 aa  667    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.367234  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1715  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  59.12 
 
 		 581 aa  668    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4203  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  70.4 
 
 		 560 aa  796    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3686  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  66.61 
 
 		 553 aa  781    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.708418  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3527  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  70.22 
 
 		 554 aa  793    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4453  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, putative  67.64 
 
 		 549 aa  786    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1116  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, putative  59.12 
 
 		 557 aa  667    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000360257  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0280  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  67.45 
 
 		 549 aa  785    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4310  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  58.35 
 
 		 566 aa  634    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.744462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1994  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  69.75 
 
 		 551 aa  790    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1956  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  60.73 
 
 		 610 aa  716    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0228  FAD dependent oxidoreductase:electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  57.74 
 
 		 547 aa  639    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1936  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  59.71 
 
 		 548 aa  689    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000473381  normal  0.135998 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1262  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  58.78 
 
 		 562 aa  646    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.12476  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000406  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  61.03 
 
 		 540 aa  703    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.453642  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1869  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  59.12 
 
 		 557 aa  667    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0418968  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4118  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  69.13 
 
 		 554 aa  785    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.186712  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5532  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  60.04 
 
 		 557 aa  663    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6873  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  59.67 
 
 		 557 aa  659    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.100379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4606  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  59.49 
 
 		 557 aa  657    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.142327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05546  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  58.63 
 
 		 554 aa  665    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15160  electron-transferring-flavoprotein ubiquinone oxido-reductase  70.05 
 
 		 550 aa  785    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.561576  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2208  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  71.38 
 
 		 551 aa  785    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1650  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  70.22 
 
 		 560 aa  795    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2613  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  58.94 
 
 		 557 aa  665    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2259  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  63.14 
 
 		 549 aa  728    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.581035 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1015  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.22 
 
 		 556 aa  636    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.103701  normal  0.772735 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1781  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  58.68 
 
 		 549 aa  637    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.420074  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3775  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  70.58 
 
 		 554 aa  797    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4827  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.74 
 
 		 555 aa  656    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2765  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  58.83 
 
 		 557 aa  651    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.126018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1999  S6 modification enzyme RimK  100 
 
 		 545 aa  1135    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.329248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00995  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  66.85 
 
 		 544 aa  763    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00336804  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0725  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.53 
 
 		 549 aa  637    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1386  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  60.4 
 
 		 557 aa  666    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1362  electron transferring flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  58.47 
 
 		 557 aa  649    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.61271  normal  0.825058 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0378  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  58.47 
 
 		 563 aa  648    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0719  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  60.83 
 
 		 557 aa  685    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2714  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.71 
 
 		 558 aa  642    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.95062  normal  0.490703 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0100  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  67.64 
 
 		 548 aa  768    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000799115  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6767  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  60.58 
 
 		 557 aa  667    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1612  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  65.88 
 
 		 551 aa  742    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.249988  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2251  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  60.37 
 
 		 545 aa  699    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.196943  normal  0.137655 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2172  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  61.38 
 
 		 548 aa  714    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0824  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  58.68 
 
 		 556 aa  649    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1750  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  59.27 
 
 		 533 aa  666    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.109424 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0979  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  60.4 
 
 		 557 aa  665    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.438928  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1554  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  60.4 
 
 		 557 aa  666    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935108  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2147  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  65.1 
 
 		 549 aa  747    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.962634  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1567  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  59.02 
 
 		 557 aa  660    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0283  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  67.45 
 
 		 549 aa  784    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.440242  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0272  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  67.27 
 
 		 549 aa  783    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000698819 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3749  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  67.27 
 
 		 549 aa  783    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.986729  normal  0.0743978 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0081  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  66.55 
 
 		 549 aa  766    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001581  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  61.51 
 
 		 553 aa  709    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1346  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  60.04 
 
 		 557 aa  663    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5772  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  60.58 
 
 		 557 aa  669    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.412443 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25840  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  71.01 
 
 		 551 aa  786    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0252767  normal  0.104283 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1461  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  60.4 
 
 		 557 aa  665    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6275  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  60.4 
 
 		 557 aa  666    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  normal  0.733827 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0388  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  67.09 
 
 		 549 aa  783    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.817996  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4403  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  66.18 
 
 		 549 aa  772    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273823 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0273  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  67.45 
 
 		 549 aa  784    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.134326  hitchhiker  0.000000385441 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6919  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  60.22 
 
 		 556 aa  665    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1691  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  59.12 
 
 		 581 aa  668    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3523  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  69.64 
 
 		 550 aa  798    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2708  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  69.31 
 
 		 554 aa  772    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.599219 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1472  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  69.51 
 
 		 550 aa  816    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00301285  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3139  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  58.86 
 
 		 568 aa  641    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.148772  normal  0.669387 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16430  Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  64.12 
 
 		 549 aa  736    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0960517  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17400  Electron-transferring-flavoprotein ubiquinone oxidoreductase  64.85 
 
 		 549 aa  741    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.348263  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1950  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.78 
 
 		 568 aa  652    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.477795 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1558  putative electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  59.12 
 
 		 557 aa  667    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000216807  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0284  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  67.45 
 
 		 549 aa  785    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0219  putative electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  59.12 
 
 		 557 aa  667    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0829315  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1146  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  57.55 
 
 		 561 aa  634  1e-180  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0276165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1185  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.89 
 
 		 551 aa  632  1e-180  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.068389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0265  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.36 
 
 		 545 aa  629  1e-179  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0224484  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1751  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.78 
 
 		 568 aa  631  1e-179  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3289  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.71 
 
 		 567 aa  630  1e-179  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444122  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2069  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.87 
 
 		 561 aa  627  1e-178  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00388318 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1656  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.56 
 
 		 545 aa  622  1e-177  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1317  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.27 
 
 		 541 aa  621  1e-177  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.233544  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0158  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.2 
 
 		 569 aa  622  1e-177  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1895  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.97 
 
 		 591 aa  622  1e-177  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1567  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  55.8 
 
 		 562 aa  616  1e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3218  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.31 
 
 		 580 aa  616  1e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2188  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.68 
 
 		 557 aa  617  1e-175  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0158  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.99 
 
 		 558 aa  617  1e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1192  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.34 
 
 		 561 aa  611  9.999999999999999e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2167  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  58.02 
 
 		 557 aa  613  9.999999999999999e-175  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.068758  normal  0.0582717 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>