284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1439 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0284  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.84 
 
 
549 aa  649    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1650  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  62.32 
 
 
560 aa  705    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0824  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  75.04 
 
 
556 aa  882    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2708  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  62.5 
 
 
554 aa  698    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.599219 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0158  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  70.09 
 
 
569 aa  843    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1439  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  100 
 
 
557 aa  1155    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0086  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  58.39 
 
 
549 aa  673    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0288135  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0942  putative electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  93.54 
 
 
557 aa  1095    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.367234  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0282  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  61.93 
 
 
555 aa  708    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00443387  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4203  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  62.5 
 
 
560 aa  707    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1567  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  70.46 
 
 
562 aa  823    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3686  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  59.24 
 
 
553 aa  691    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.708418  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6767  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  98.56 
 
 
557 aa  1142    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4453  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, putative  57.12 
 
 
549 aa  666    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1116  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, putative  93.54 
 
 
557 aa  1095    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000360257  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1239  hypothetical protein  57.51 
 
 
543 aa  656    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1239  hypothetical protein  57.4 
 
 
543 aa  655    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1015  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  74.87 
 
 
556 aa  879    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.103701  normal  0.772735 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1994  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  61.57 
 
 
551 aa  705    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1956  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  60.43 
 
 
610 aa  693    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0228  FAD dependent oxidoreductase:electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  62.75 
 
 
547 aa  728    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1936  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  70.7 
 
 
548 aa  838    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000473381  normal  0.135998 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1262  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  77.58 
 
 
562 aa  915    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.12476  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4827  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  87.16 
 
 
555 aa  1008    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1869  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  93.54 
 
 
557 aa  1095    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0418968  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4118  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  61.23 
 
 
554 aa  699    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.186712  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5532  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  97.31 
 
 
557 aa  1103    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6873  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  97.31 
 
 
557 aa  1105    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.100379  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4606  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  98.2 
 
 
557 aa  1137    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.142327  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0158  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  72.41 
 
 
558 aa  799    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6919  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  99.09 
 
 
556 aa  1127    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76503  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0265  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  63.19 
 
 
545 aa  733    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0224484  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1986  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  70.59 
 
 
561 aa  840    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5364  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  96.41 
 
 
557 aa  1097    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.798054  normal  0.228806 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2208  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  63.75 
 
 
551 aa  714    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2613  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  93.36 
 
 
557 aa  1095    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4100  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  64.78 
 
 
549 aa  678    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1750  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  62.09 
 
 
533 aa  712    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.109424 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1781  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  61.27 
 
 
549 aa  684    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.420074  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4794  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.75 
 
 
549 aa  654    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0795464  hitchhiker  0.00000316317 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2269  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  70.69 
 
 
587 aa  838    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.487157  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3018  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  70.69 
 
 
572 aa  841    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0545377  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4163  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  70.69 
 
 
572 aa  841    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1999  S6 modification enzyme RimK  60.4 
 
 
545 aa  678    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.329248  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1386  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  98.56 
 
 
557 aa  1140    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1057  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  59.59 
 
 
544 aa  644    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0725  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  59.12 
 
 
549 aa  667    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1895  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  73.26 
 
 
591 aa  848    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5295  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  73.08 
 
 
561 aa  825    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.175772  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1362  electron transferring flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  88.33 
 
 
557 aa  1019    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.61271  normal  0.825058 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0378  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  88.15 
 
 
563 aa  1019    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0276  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.39 
 
 
549 aa  655    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2714  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  86.31 
 
 
558 aa  989    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.95062  normal  0.490703 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0100  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.39 
 
 
548 aa  644    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000799115  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3527  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  61.23 
 
 
554 aa  692    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2069  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  72.55 
 
 
561 aa  841    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00388318 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1612  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.43 
 
 
551 aa  637    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.249988  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2765  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  89.59 
 
 
557 aa  1031    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.126018  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2251  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  60.99 
 
 
545 aa  683    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.196943  normal  0.137655 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1146  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  76.47 
 
 
561 aa  907    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0276165  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2172  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  59.17 
 
 
548 aa  672    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3775  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  62.14 
 
 
554 aa  705    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1185  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  61.2 
 
 
551 aa  662    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.068389  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0979  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  100 
 
 
557 aa  1155    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.438928  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1554  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  98.74 
 
 
557 aa  1144    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935108  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2147  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  59.27 
 
 
549 aa  675    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.962634  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2167  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  61.34 
 
 
557 aa  643    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.068758  normal  0.0582717 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1715  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  93.54 
 
 
581 aa  1097    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0272  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.39 
 
 
549 aa  659    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000698819 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3749  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.39 
 
 
549 aa  659    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.986729  normal  0.0743978 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0081  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.02 
 
 
549 aa  638    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0388  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.39 
 
 
549 aa  661    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.817996  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2188  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  59.89 
 
 
557 aa  667    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1346  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  98.03 
 
 
557 aa  1133    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5772  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  97.49 
 
 
557 aa  1103    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.412443 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25840  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  64.12 
 
 
551 aa  717    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0252767  normal  0.104283 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1461  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  100 
 
 
557 aa  1155    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6275  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  98.74 
 
 
557 aa  1144    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  normal  0.733827 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2259  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.86 
 
 
549 aa  647    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.581035 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4403  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.12 
 
 
549 aa  664    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273823 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0273  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  56.57 
 
 
549 aa  659    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.134326  hitchhiker  0.000000385441 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4310  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  73.67 
 
 
566 aa  859    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.744462  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1691  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  93.54 
 
 
581 aa  1097    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3523  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  58.83 
 
 
550 aa  670    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1567  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  90.13 
 
 
557 aa  1058    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1472  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  61.93 
 
 
550 aa  712    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00301285  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3139  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  73.94 
 
 
568 aa  870    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.148772  normal  0.669387 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0719  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  62.11 
 
 
557 aa  712    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136312  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2679  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  75.22 
 
 
561 aa  853    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3283  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  75.4 
 
 
561 aa  852    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.856599 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1950  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  72.71 
 
 
568 aa  877    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.477795 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1266  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.45 
 
 
541 aa  635    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.863142  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1558  putative electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  93.54 
 
 
557 aa  1095    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000216807  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3981  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  69.79 
 
 
566 aa  836    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0944928 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1788  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  97.49 
 
 
557 aa  1112    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236528  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1443  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  72.91 
 
 
561 aa  832    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.820539  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0219  putative electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  93.54 
 
 
557 aa  1095    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0829315  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4121  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.57 
 
 
549 aa  655    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1192  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  73.08 
 
 
561 aa  848    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0283  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.39 
 
 
549 aa  655    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.440242  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>