277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000406 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_3527  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  64.85 
 
 
554 aa  724    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2259  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  60.22 
 
 
549 aa  699    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.581035 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0388  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  61.4 
 
 
549 aa  720    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.817996  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4203  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  64.66 
 
 
560 aa  727    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3686  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  62.59 
 
 
553 aa  724    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.708418  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4453  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, putative  61.03 
 
 
549 aa  723    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3775  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  64.66 
 
 
554 aa  726    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1994  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  64.29 
 
 
551 aa  734    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1956  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  56.7 
 
 
610 aa  657    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1936  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  57.51 
 
 
548 aa  644    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000473381  normal  0.135998 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4118  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  63.93 
 
 
554 aa  726    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.186712  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4403  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  61.76 
 
 
549 aa  718    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273823 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17400  Electron-transferring-flavoprotein ubiquinone oxidoreductase  62.64 
 
 
549 aa  709    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.348263  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0280  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  60.85 
 
 
549 aa  711    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0086  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  61.95 
 
 
549 aa  717    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0288135  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000406  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  100 
 
 
540 aa  1121    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.453642  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001581  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  61.86 
 
 
553 aa  694    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1999  S6 modification enzyme RimK  61.03 
 
 
545 aa  703    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.329248  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4794  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  61.76 
 
 
549 aa  717    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0795464  hitchhiker  0.00000316317 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0100  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  59.38 
 
 
548 aa  682    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000799115  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2208  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  64.65 
 
 
551 aa  717    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1612  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  60.04 
 
 
551 aa  679    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.249988  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2251  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.43 
 
 
545 aa  657    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.196943  normal  0.137655 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2172  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  59.56 
 
 
548 aa  691    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2147  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  62.57 
 
 
549 aa  729    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.962634  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0272  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  61.03 
 
 
549 aa  719    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000698819 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3749  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  61.03 
 
 
549 aa  719    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.986729  normal  0.0743978 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0081  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  60.85 
 
 
549 aa  703    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2708  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  63.93 
 
 
554 aa  718    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.599219 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25840  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  64.29 
 
 
551 aa  717    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0252767  normal  0.104283 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05546  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  62.77 
 
 
554 aa  702    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0273  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  60.85 
 
 
549 aa  717    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.134326  hitchhiker  0.000000385441 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3523  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  61.65 
 
 
550 aa  709    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1650  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  64.48 
 
 
560 aa  725    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1472  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  61.24 
 
 
550 aa  704    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00301285  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0282  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  58.72 
 
 
555 aa  673    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00443387  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15160  electron-transferring-flavoprotein ubiquinone oxido-reductase  64.22 
 
 
550 aa  719    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.561576  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16430  Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  62.39 
 
 
549 aa  711    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0960517  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0284  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  60.48 
 
 
549 aa  708    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00995  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  63.49 
 
 
544 aa  736    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00336804  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4121  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  60.85 
 
 
549 aa  703    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0283  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  60.85 
 
 
549 aa  710    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.440242  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0276  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  60.85 
 
 
549 aa  710    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0824  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.17 
 
 
556 aa  630  1e-179  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1715  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  55.41 
 
 
581 aa  627  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0942  putative electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  55.41 
 
 
557 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.367234  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1116  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, putative  55.41 
 
 
557 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000360257  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1869  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  55.41 
 
 
557 aa  626  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0418968  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1567  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.7 
 
 
557 aa  625  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1558  putative electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  55.41 
 
 
557 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000216807  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0219  putative electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  55.41 
 
 
557 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0829315  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1691  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  55.41 
 
 
581 aa  627  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2613  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  55.05 
 
 
557 aa  622  1e-177  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6767  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.25 
 
 
557 aa  621  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1788  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.88 
 
 
557 aa  619  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236528  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1439  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.88 
 
 
557 aa  618  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0979  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.88 
 
 
557 aa  618  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.438928  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1554  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.07 
 
 
557 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935108  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1461  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.88 
 
 
557 aa  618  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6275  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.07 
 
 
557 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  normal  0.733827 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6919  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.07 
 
 
556 aa  618  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76503  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5532  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.88 
 
 
557 aa  617  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1015  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.51 
 
 
556 aa  615  1e-175  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.103701  normal  0.772735 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6873  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.88 
 
 
557 aa  616  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.100379  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4606  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.88 
 
 
557 aa  615  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.142327  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0265  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.86 
 
 
545 aa  616  1e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0224484  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0725  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.51 
 
 
549 aa  617  1e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1386  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.88 
 
 
557 aa  616  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5772  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.88 
 
 
557 aa  615  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.412443 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1750  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.64 
 
 
533 aa  617  1e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.109424 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5364  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.7 
 
 
557 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.798054  normal  0.228806 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4827  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  53.68 
 
 
555 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1346  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.51 
 
 
557 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1262  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.18 
 
 
562 aa  610  1e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.12476  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0719  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.3 
 
 
557 aa  608  1e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136312  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2765  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.96 
 
 
557 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.126018  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1146  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  56.1 
 
 
561 aa  604  1.0000000000000001e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0276165  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1950  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.01 
 
 
568 aa  604  1.0000000000000001e-171  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.477795 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1362  electron transferring flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  54.04 
 
 
557 aa  598  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.61271  normal  0.825058 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0378  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.23 
 
 
563 aa  599  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0228  FAD dependent oxidoreductase:electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  55.68 
 
 
547 aa  595  1e-169  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2714  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.41 
 
 
558 aa  595  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.95062  normal  0.490703 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1239  hypothetical protein  54.03 
 
 
543 aa  595  1e-168  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1239  hypothetical protein  54.03 
 
 
543 aa  593  1e-168  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1010  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  52.27 
 
 
561 aa  591  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.247657  normal  0.301409 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0961  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  52.27 
 
 
561 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.162811  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0158  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  53.02 
 
 
558 aa  588  1e-167  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1988  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  53.05 
 
 
545 aa  590  1e-167  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.964915  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0929  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  52.27 
 
 
561 aa  589  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.460207  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0990  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  52.27 
 
 
561 aa  589  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2069  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.3 
 
 
561 aa  588  1e-167  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00388318 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1751  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.19 
 
 
568 aa  587  1e-166  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3139  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.09 
 
 
568 aa  588  1e-166  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.148772  normal  0.669387 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2167  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.01 
 
 
557 aa  585  1e-166  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.068758  normal  0.0582717 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3981  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  51.16 
 
 
566 aa  586  1e-166  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0944928 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1567  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  52.74 
 
 
562 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1266  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  52.4 
 
 
541 aa  582  1.0000000000000001e-165  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.863142  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1986  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  52.47 
 
 
561 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0158  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  51.91 
 
 
569 aa  582  1.0000000000000001e-165  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1656  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.88 
 
 
545 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>