282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1781 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_1715  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  60.18 
 
 
581 aa  672    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3075  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  57.38 
 
 
549 aa  645    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.816418  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5532  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  61.09 
 
 
557 aa  670    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4100  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  72.51 
 
 
549 aa  793    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0620  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  58.42 
 
 
563 aa  638    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2473  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.38 
 
 
551 aa  651    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.163  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0942  putative electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  60.18 
 
 
557 aa  672    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.367234  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1567  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  57.97 
 
 
562 aa  637    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0621  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  58.42 
 
 
563 aa  637    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.994915  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1567  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  61.09 
 
 
557 aa  681    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1116  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, putative  60.18 
 
 
557 aa  672    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000360257  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1439  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  61.27 
 
 
557 aa  671    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0228  FAD dependent oxidoreductase:electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  57.43 
 
 
547 aa  644    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1936  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  58.51 
 
 
548 aa  655    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000473381  normal  0.135998 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1262  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.66 
 
 
562 aa  637    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.12476  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2595  FAD dependent oxidoreductase  57.01 
 
 
553 aa  639    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.399286 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1869  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  60.18 
 
 
557 aa  672    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0418968  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1777  putative electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase precursor  57.01 
 
 
551 aa  655    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.964971  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6873  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  61.27 
 
 
557 aa  671    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.100379  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4606  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  61.45 
 
 
557 aa  673    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.142327  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2765  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  60.18 
 
 
557 aa  665    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.126018  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0265  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.68 
 
 
545 aa  642    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0224484  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0719  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  60.58 
 
 
557 aa  680    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136312  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2613  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  59.82 
 
 
557 aa  670    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1656  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  58.15 
 
 
561 aa  637    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.125425  normal  0.0341229 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1781  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  100 
 
 
549 aa  1139    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.420074  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0942  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  59.82 
 
 
554 aa  666    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.589953  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6299  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  60.58 
 
 
549 aa  657    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1392  electrotransfer ubiquinone oxidoreductase  58.55 
 
 
553 aa  639    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0424  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.83 
 
 
551 aa  654    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.349819  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1999  S6 modification enzyme RimK  58.68 
 
 
545 aa  637    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.329248  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0725  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  58.44 
 
 
549 aa  646    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1362  electron transferring flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  60.55 
 
 
557 aa  664    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.61271  normal  0.825058 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0378  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  60.55 
 
 
563 aa  664    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2658  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  58.42 
 
 
568 aa  635    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2714  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  60.18 
 
 
558 aa  662    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.95062  normal  0.490703 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1788  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  62 
 
 
557 aa  675    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236528  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2346  putative electron transfer flavoprotein dehydrogenase  57.97 
 
 
552 aa  643    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.398943  normal  0.0520477 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3218  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.12 
 
 
580 aa  645    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2167  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  61.55 
 
 
557 aa  663    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.068758  normal  0.0582717 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3745  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.75 
 
 
549 aa  648    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1185  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  70.52 
 
 
551 aa  795    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.068389  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0979  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  61.27 
 
 
557 aa  671    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.438928  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1554  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  61.27 
 
 
557 aa  670    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935108  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0911  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  58 
 
 
568 aa  645    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1691  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  60.18 
 
 
581 aa  672    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0158  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.55 
 
 
569 aa  636    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5364  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  61.64 
 
 
557 aa  669    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.798054  normal  0.228806 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2188  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  59.53 
 
 
557 aa  664    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1346  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  60.73 
 
 
557 aa  664    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5772  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  61.09 
 
 
557 aa  671    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.412443 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6767  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  61.09 
 
 
557 aa  670    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1461  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  61.27 
 
 
557 aa  671    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6275  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  61.27 
 
 
557 aa  670    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  normal  0.733827 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0824  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  58.36 
 
 
556 aa  642    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1091  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  59.64 
 
 
554 aa  644    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.358633 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0425  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  59.27 
 
 
548 aa  653    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1386  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  61.09 
 
 
557 aa  669    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4827  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  60.44 
 
 
555 aa  677    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1950  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.75 
 
 
568 aa  636    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.477795 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1558  putative electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  60.18 
 
 
557 aa  672    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000216807  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0219  putative electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  60.18 
 
 
557 aa  672    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0829315  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6919  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  61.27 
 
 
556 aa  672    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76503  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1986  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.43 
 
 
561 aa  632  1e-180  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2374  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.14 
 
 
557 aa  631  1e-180  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.694979 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1146  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  57.04 
 
 
561 aa  633  1e-180  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0276165  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1015  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.27 
 
 
556 aa  633  1e-180  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.103701  normal  0.772735 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1039  electron transfer flavoprotein-ubiquinone dehydrogenase  55.74 
 
 
553 aa  632  1e-180  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.245059  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1988  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.69 
 
 
545 aa  625  1e-178  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.964915  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0484  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.11 
 
 
548 aa  624  1e-178  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2069  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  58.7 
 
 
561 aa  623  1e-177  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00388318 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3289  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.32 
 
 
567 aa  622  1e-177  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444122  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1229  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.12 
 
 
552 aa  624  1e-177  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1472  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.37 
 
 
550 aa  624  1e-177  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00301285  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1895  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  58.51 
 
 
591 aa  619  1e-176  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3139  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.75 
 
 
568 aa  619  1e-176  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.148772  normal  0.669387 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4203  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.35 
 
 
560 aa  616  1e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1751  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.93 
 
 
568 aa  616  1e-175  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3775  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.25 
 
 
554 aa  615  1e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2259  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.38 
 
 
549 aa  615  1e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.581035 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0282  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.87 
 
 
555 aa  616  1e-175  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00443387  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00995  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  54.18 
 
 
544 aa  616  1e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00336804  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3981  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.99 
 
 
566 aa  616  1e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0944928 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1650  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.17 
 
 
560 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1750  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.58 
 
 
533 aa  614  9.999999999999999e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.109424 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1994  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.4 
 
 
551 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0158  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.22 
 
 
558 aa  614  9.999999999999999e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0649  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  58.18 
 
 
554 aa  613  9.999999999999999e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.480515 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4118  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  55.46 
 
 
554 aa  608  1e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.186712  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3527  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.46 
 
 
554 aa  608  1e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4358  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.3 
 
 
552 aa  608  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0903296  normal  0.0136742 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1211  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.02 
 
 
552 aa  608  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1612  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.38 
 
 
551 aa  608  1e-173  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.249988  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17400  Electron-transferring-flavoprotein ubiquinone oxidoreductase  56.29 
 
 
549 aa  610  1e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.348263  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1192  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.25 
 
 
561 aa  611  1e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4310  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.89 
 
 
566 aa  609  1e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.744462  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1443  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.43 
 
 
561 aa  608  1e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.820539  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25840  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  56.55 
 
 
551 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0252767  normal  0.104283 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2679  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.61 
 
 
561 aa  606  9.999999999999999e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3283  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.61 
 
 
561 aa  605  9.999999999999999e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.856599 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>