277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0158 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1386  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  70.44 
 
 
557 aa  830    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3775  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  59.71 
 
 
554 aa  678    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00995  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  57.32 
 
 
544 aa  662    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00336804  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4827  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  68.72 
 
 
555 aa  805    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1010  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  57.69 
 
 
561 aa  700    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.247657  normal  0.301409 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1015  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  65.13 
 
 
556 aa  779    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.103701  normal  0.772735 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0942  putative electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  69.91 
 
 
557 aa  842    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.367234  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0086  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  53.86 
 
 
549 aa  637    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0288135  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1715  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  69.91 
 
 
581 aa  843    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4203  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  60.43 
 
 
560 aa  683    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1567  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  78.62 
 
 
562 aa  951    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3686  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  55.52 
 
 
553 aa  651    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.708418  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17400  Electron-transferring-flavoprotein ubiquinone oxidoreductase  59.53 
 
 
549 aa  671    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.348263  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4453  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, putative  53.68 
 
 
549 aa  634    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1116  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, putative  69.91 
 
 
557 aa  842    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000360257  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0961  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  57.69 
 
 
561 aa  699    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.162811  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1656  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  64.74 
 
 
545 aa  709    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4310  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  71.55 
 
 
566 aa  843    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.744462  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1994  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.91 
 
 
551 aa  672    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15160  electron-transferring-flavoprotein ubiquinone oxido-reductase  59.28 
 
 
550 aa  662    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.561576  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0228  FAD dependent oxidoreductase:electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  59.86 
 
 
547 aa  676    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1936  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  63.65 
 
 
548 aa  745    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000473381  normal  0.135998 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1262  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  74.69 
 
 
562 aa  896    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.12476  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2765  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  69.91 
 
 
557 aa  820    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.126018  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1869  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  69.91 
 
 
557 aa  842    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0418968  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4118  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  57.42 
 
 
554 aa  659    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.186712  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1192  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  78.23 
 
 
561 aa  924    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6873  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  70.09 
 
 
557 aa  826    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.100379  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4606  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  70.27 
 
 
557 aa  825    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.142327  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6919  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  70.81 
 
 
556 aa  816    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76503  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2069  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  76.11 
 
 
561 aa  890    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00388318 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0265  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  58.41 
 
 
545 aa  651    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0224484  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1567  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  70.44 
 
 
557 aa  838    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1650  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  60.61 
 
 
560 aa  686    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2613  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  69.56 
 
 
557 aa  838    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0282  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.91 
 
 
555 aa  653    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00443387  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1788  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  71.15 
 
 
557 aa  837    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236528  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1781  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.55 
 
 
549 aa  636    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.420074  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2269  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  67.19 
 
 
587 aa  814    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.487157  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3018  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  67.3 
 
 
572 aa  821    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0545377  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4163  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  67.3 
 
 
572 aa  821    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1439  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  70.09 
 
 
557 aa  826    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4100  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  62.09 
 
 
549 aa  651    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0725  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.76 
 
 
549 aa  643    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1895  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  75.04 
 
 
591 aa  883    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5295  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  80.39 
 
 
561 aa  920    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.175772  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1362  electron transferring flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  69.56 
 
 
557 aa  815    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.61271  normal  0.825058 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0378  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  69.54 
 
 
563 aa  820    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2714  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  69.62 
 
 
558 aa  794    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.95062  normal  0.490703 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2208  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  58.45 
 
 
551 aa  661    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0929  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  57.32 
 
 
561 aa  696    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.460207  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1986  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  78.23 
 
 
561 aa  969    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16430  Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  58.99 
 
 
549 aa  669    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0960517  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1146  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  74.87 
 
 
561 aa  903    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0276165  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0990  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  57.5 
 
 
561 aa  697    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3527  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  59.18 
 
 
554 aa  671    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3289  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  69.63 
 
 
567 aa  829    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444122  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0979  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  70.09 
 
 
557 aa  826    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.438928  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1554  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  70.27 
 
 
557 aa  827    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935108  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0158  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  71.3 
 
 
558 aa  823    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1691  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  69.91 
 
 
581 aa  843    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2708  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.78 
 
 
554 aa  650    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.599219 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2188  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.96 
 
 
557 aa  639    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1346  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  70.09 
 
 
557 aa  826    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5772  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  69.73 
 
 
557 aa  824    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.412443 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25840  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  58.63 
 
 
551 aa  665    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0252767  normal  0.104283 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1461  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  70.09 
 
 
557 aa  826    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6275  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  70.27 
 
 
557 aa  827    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  normal  0.733827 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5364  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  70.97 
 
 
557 aa  832    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.798054  normal  0.228806 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0824  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  65.84 
 
 
556 aa  781    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1472  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.17 
 
 
550 aa  674    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00301285  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3139  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  70.68 
 
 
568 aa  841    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.148772  normal  0.669387 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0719  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.18 
 
 
557 aa  663    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136312  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2679  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  75.04 
 
 
561 aa  877    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3283  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  74.69 
 
 
561 aa  872    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.856599 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1950  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  69.81 
 
 
568 aa  854    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.477795 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0158  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  100 
 
 
569 aa  1174    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1558  putative electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  69.91 
 
 
557 aa  842    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000216807  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3981  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  69.88 
 
 
566 aa  828    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0944928 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1656  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  78.23 
 
 
561 aa  967    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.125425  normal  0.0341229 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1443  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  77.17 
 
 
561 aa  890    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.820539  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0219  putative electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  69.91 
 
 
557 aa  842    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0829315  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1751  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  69.98 
 
 
568 aa  837    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6767  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  69.91 
 
 
557 aa  825    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5532  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  70.27 
 
 
557 aa  828    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4403  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  53.32 
 
 
549 aa  632  1e-180  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273823 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3523  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.2 
 
 
550 aa  632  1e-180  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2147  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.32 
 
 
549 aa  629  1e-179  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.962634  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0272  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  53.86 
 
 
549 aa  631  1e-179  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000698819 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3749  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  53.86 
 
 
549 aa  631  1e-179  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.986729  normal  0.0743978 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0273  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  53.86 
 
 
549 aa  631  1e-179  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.134326  hitchhiker  0.000000385441 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0388  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  52.78 
 
 
549 aa  626  1e-178  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.817996  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4794  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  52.96 
 
 
549 aa  625  1e-178  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0795464  hitchhiker  0.00000316317 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1612  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.82 
 
 
551 aa  626  1e-178  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.249988  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2167  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  58.84 
 
 
557 aa  627  1e-178  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.068758  normal  0.0582717 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2259  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  52.17 
 
 
549 aa  622  1e-177  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.581035 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1999  S6 modification enzyme RimK  55.2 
 
 
545 aa  622  1e-177  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.329248  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0276  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  52.78 
 
 
549 aa  623  1e-177  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0100  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  53.86 
 
 
548 aa  623  1e-177  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000799115  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0283  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  52.78 
 
 
549 aa  623  1e-177  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.440242  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>