78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0277 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0277  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  100 
 
 		 255 aa  521  1e-147  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.720039 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2426  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  52.76 
 
 		 258 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00205999  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1007  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  54.51 
 
 		 256 aa  257  2e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0963  thiazole biosynthesis enzyme  53.36 
 
 		 254 aa  243  1.9999999999999999e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0142  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  48.03 
 
 		 248 aa  227  2e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0140  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  47.64 
 
 		 248 aa  226  4e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1358  thiazole biosynthesis enzyme  47.22 
 
 		 264 aa  216  2e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000774298  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1422  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  46.36 
 
 		 277 aa  216  2.9999999999999998e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0859  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  50.2 
 
 		 259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.841302  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1590  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  47.83 
 
 		 258 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00059443  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1609  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  46.37 
 
 		 268 aa  206  3e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000241948  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0421  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  48.22 
 
 		 271 aa  203  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000154841  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2100  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  47.08 
 
 		 260 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2109  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  45.95 
 
 		 258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1121  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  43.31 
 
 		 286 aa  191  9e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2251  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  45.67 
 
 		 254 aa  185  7e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1935  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  44.88 
 
 		 254 aa  182  6e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0798  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  45.63 
 
 		 263 aa  175  5e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0725876  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2221  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  41.25 
 
 		 271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000384751 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1498  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  40.86 
 
 		 275 aa  166  4e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.16629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1555  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  40.08 
 
 		 261 aa  163  3e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0663  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  42.19 
 
 		 261 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.397509  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1998  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  41.8 
 
 		 273 aa  160  1e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.310517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1321  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  42.02 
 
 		 261 aa  159  5e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1411  thiazole biosynthesis enzyme  42.29 
 
 		 267 aa  157  1e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0226  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  41.63 
 
 		 261 aa  155  4e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1052  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  39.06 
 
 		 259 aa  156  4e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.273545  normal  0.78871 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0597  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  41.63 
 
 		 262 aa  156  4e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.469921  normal  0.642946 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1420  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  37.4 
 
 		 263 aa  152  7e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.043335 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0678  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  35.41 
 
 		 272 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0002  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  36.59 
 
 		 307 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2980  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  35.61 
 
 		 309 aa  135  4e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2419  thiazole biosynthesis enzyme  35.25 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1462  thiazole biosynthesis enzyme  34.41 
 
 		 310 aa  133  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2718  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  34.91 
 
 		 308 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50942  predicted protein  31.91 
 
 		 351 aa  119  3.9999999999999996e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.920544 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03928  Putative thiazole synthaseTHI4_ASPOR Thiazole biosynthetic enzyme, mitochondrial ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q76B84]  32.83 
 
 		 331 aa  116  3.9999999999999997e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.514294 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3127  geranylgeranyl reductase  30.65 
 
 		 458 aa  50.1  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.541663  normal  0.393865 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3246  FAD dependent oxidoreductase  55 
 
 		 515 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0672  HI0933 family protein  26.8 
 
 		 436 aa  45.4  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  31.36 
 
 		 309 aa  45.4  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4566  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  51.28 
 
 		 438 aa  45.4  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191225  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6713  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  42.11 
 
 		 495 aa  43.9  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2205  putative oxidoreductase  29.73 
 
 		 598 aa  44.3  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204646  normal  0.261416 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1194  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  51.28 
 
 		 1487 aa  43.9  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  27.5 
 
 		 435 aa  44.3  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0455  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  38.98 
 
 		 653 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.374087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0423  selenate reductase YgfK  55.56 
 
 		 1075 aa  43.5  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2778  geranylgeranyl reductase  27.46 
 
 		 471 aa  43.5  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2128  phytoene desaturase  42.62 
 
 		 504 aa  43.9  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.423753  decreased coverage  0.0000406201 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  51.35 
 
 		 510 aa  43.5  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  51.22 
 
 		 560 aa  43.9  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2293  putative oxidoreductase  44.19 
 
 		 412 aa  43.5  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262467 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02034  hypothetical protein  44.19 
 
 		 412 aa  43.1  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1994  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  26.24 
 
 		 551 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2280  putative oxidoreductase  44.19 
 
 		 412 aa  43.1  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1502  putative oxidoreductase  44.19 
 
 		 412 aa  43.1  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0825  putative oxidoreductase  44.19 
 
 		 412 aa  43.1  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0968  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.5 
 
 		 644 aa  43.1  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.132179  normal  0.162387 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1512  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.19 
 
 		 412 aa  43.1  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02075  predicted oxidoreductase  44.19 
 
 		 412 aa  43.1  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3278  putative oxidoreductase  44.19 
 
 		 412 aa  43.1  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.598108 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  25.98 
 
 		 425 aa  43.1  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0668  geranylgeranyl reductase  25.42 
 
 		 458 aa  42.7  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.159483  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4456  nopaline dehydrogenase, putative  47.5 
 
 		 464 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.733359  hitchhiker  0.00000723906 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4519  FAD dependent oxidoreductase  55.26 
 
 		 506 aa  42.4  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 		 563 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1222  putative oxidoreductase  58.97 
 
 		 616 aa  42.4  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0214  FAD dependent oxidoreductase  44.23 
 
 		 568 aa  42.4  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.646521  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2774  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  30.56 
 
 		 430 aa  42.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.372841  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4203  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  26.73 
 
 		 560 aa  42  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0366  glutamate synthase subunit beta  42.11 
 
 		 489 aa  42  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1650  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  26.73 
 
 		 560 aa  42  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2425  putative oxidoreductase  44.19 
 
 		 413 aa  42  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07230  cellobiose dehydrogenase (AFU_orthologue; AFUA_2G17620)  42.55 
 
 		 780 aa  42  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.267409  normal  0.372324 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2376  putative oxidoreductase  31.31 
 
 		 413 aa  42  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2533  putative oxidoreductase  44.19 
 
 		 413 aa  42  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0200812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2332  putative oxidoreductase  31.31 
 
 		 413 aa  42  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>