160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1935 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1935  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  100 
 
 
254 aa  517  1e-146  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2251  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  70.63 
 
 
254 aa  340  1e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2426  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  52.71 
 
 
258 aa  264  1e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00205999  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2100  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  54.05 
 
 
260 aa  255  5e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2109  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  53.7 
 
 
258 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1121  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  52.33 
 
 
286 aa  248  5e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1609  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  48.82 
 
 
268 aa  236  2e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000241948  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0421  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  49.61 
 
 
271 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000154841  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1358  thiazole biosynthesis enzyme  50 
 
 
264 aa  229  4e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000774298  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0859  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  48.84 
 
 
259 aa  224  1e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.841302  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0963  thiazole biosynthesis enzyme  50 
 
 
254 aa  224  1e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0277  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  44.49 
 
 
255 aa  206  2e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.720039 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0663  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  45.06 
 
 
261 aa  205  7e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.397509  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0798  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  44.57 
 
 
263 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0725876  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1052  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  45.78 
 
 
259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.273545  normal  0.78871 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1998  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  45.45 
 
 
273 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.310517  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1555  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  43.78 
 
 
261 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1498  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  44.98 
 
 
275 aa  195  7e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.16629  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0226  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  44.27 
 
 
261 aa  190  2e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1007  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  44.44 
 
 
256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1321  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  44.27 
 
 
261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0597  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  44.27 
 
 
262 aa  188  5.999999999999999e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.469921  normal  0.642946 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1420  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  38.98 
 
 
263 aa  180  2e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.043335 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0142  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  43.6 
 
 
248 aa  176  3e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0140  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  43.2 
 
 
248 aa  175  6e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2221  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  39.61 
 
 
271 aa  173  1.9999999999999998e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000384751 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1411  thiazole biosynthesis enzyme  39.13 
 
 
267 aa  172  5.999999999999999e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1422  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  40.07 
 
 
277 aa  161  1e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0678  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  38.78 
 
 
272 aa  157  1e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1590  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  40.08 
 
 
258 aa  154  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00059443  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0002  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  34.66 
 
 
307 aa  149  3e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1462  thiazole biosynthesis enzyme  33.93 
 
 
310 aa  149  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2419  thiazole biosynthesis enzyme  33.21 
 
 
309 aa  145  6e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2718  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  33.81 
 
 
308 aa  145  7.0000000000000006e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2980  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  32.86 
 
 
309 aa  142  7e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50942  predicted protein  32.41 
 
 
351 aa  130  2.0000000000000002e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.920544 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03928  Putative thiazole synthaseTHI4_ASPOR Thiazole biosynthetic enzyme, mitochondrial ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q76B84]  32.97 
 
 
331 aa  129  4.0000000000000003e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.514294 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1994  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  24.24 
 
 
551 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  26.32 
 
 
445 aa  50.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1260  FAD dependent oxidoreductase  28.08 
 
 
438 aa  50.1  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0671  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.53 
 
 
468 aa  49.7  0.00005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4118  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  23.23 
 
 
554 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.186712  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  27.72 
 
 
455 aa  48.5  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25840  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  23.74 
 
 
551 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0252767  normal  0.104283 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3523  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  23.86 
 
 
550 aa  48.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2208  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  23.74 
 
 
551 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1413  geranylgeranyl reductase  30.66 
 
 
456 aa  47.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.145276  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  30 
 
 
480 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2708  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  23.12 
 
 
554 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.599219 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03043  hypothetical protein  52.5 
 
 
670 aa  47.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002914  2,4-dienoyl-CoA reductase [NADPH]  52.5 
 
 
670 aa  47  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0255137  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  30.67 
 
 
435 aa  47  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15160  electron-transferring-flavoprotein ubiquinone oxido-reductase  26.15 
 
 
550 aa  46.6  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.561576  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4904  hypothetical protein  36.63 
 
 
458 aa  46.6  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5772  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  28.57 
 
 
557 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.412443 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1195  FAD dependent oxidoreductase  27.4 
 
 
438 aa  46.2  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3127  geranylgeranyl reductase  30.15 
 
 
458 aa  46.2  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.541663  normal  0.393865 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0979  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  28.57 
 
 
557 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.438928  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1554  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  27.55 
 
 
557 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935108  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1439  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  28.57 
 
 
557 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1461  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  28.57 
 
 
557 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6275  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  27.55 
 
 
557 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  normal  0.733827 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6767  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  28.57 
 
 
557 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4606  tryptophan halogenase  30.94 
 
 
420 aa  46.2  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  38.98 
 
 
429 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6919  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  28.57 
 
 
556 aa  45.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76503  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  29.1 
 
 
536 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1612  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  24.68 
 
 
551 aa  45.8  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.249988  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  41.82 
 
 
422 aa  45.8  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1346  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  28.06 
 
 
557 aa  45.8  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2084  FAD dependent oxidoreductase  43.14 
 
 
477 aa  45.8  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  28.26 
 
 
537 aa  45.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1959  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  41.1 
 
 
647 aa  45.8  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  39.71 
 
 
470 aa  45.8  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0425  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.26 
 
 
467 aa  45.4  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  27.21 
 
 
552 aa  45.4  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1386  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  28.06 
 
 
557 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4203  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  22.61 
 
 
560 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  25.95 
 
 
444 aa  45.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6873  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  28.57 
 
 
557 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.100379  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4606  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  28.57 
 
 
557 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.142327  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00210  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  38.57 
 
 
612 aa  45.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.301732 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3527  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  23.12 
 
 
554 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1650  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  23.12 
 
 
560 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1310  putative oxidoreductase  38.71 
 
 
413 aa  45.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  26.82 
 
 
455 aa  44.3  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0192  2,4-dienoyl-CoA reductase  35.19 
 
 
677 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.804371  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1936  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  45.16 
 
 
548 aa  43.9  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000473381  normal  0.135998 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02526  2,4-dienoyl-CoA reductase  35.8 
 
 
679 aa  44.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410827  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0995  2,4-dienoyl-CoA reductase  35.19 
 
 
677 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.497103  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0550  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.33 
 
 
467 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00865571  normal  0.262982 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5532  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  28.06 
 
 
557 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1367  FAD/FMN-binding/pyridine nucleotide-disulphide domain-containing oxidoreductase  35.19 
 
 
677 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.428075  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1562  2,4-dienoyl-CoA reductase  35.19 
 
 
677 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2719  FAD/FMN-binding/pyridine nucleotide-disulphide domain-containing oxidoreductase  35.19 
 
 
677 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2575  FAD/FMN-binding/pyridine nucleotide-disulphide domain-containing oxidoreductase  35.19 
 
 
677 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0222  FAD/FMN-binding/pyridine nucleotide-disulphide domain-containing oxidoreductase  35.19 
 
 
677 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.74 
 
 
463 aa  43.9  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3145  FAD dependent oxidoreductase  37.66 
 
 
769 aa  44.3  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0219  putative electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  25.93 
 
 
557 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0829315  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>