133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1590 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1590  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  100 
 
 		 258 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00059443  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1422  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  59.77 
 
 		 277 aa  294  8e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0142  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  59.13 
 
 		 248 aa  285  5e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0140  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  58.73 
 
 		 248 aa  284  8e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0277  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  47.83 
 
 		 255 aa  239  5e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.720039 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0963  thiazole biosynthesis enzyme  46.25 
 
 		 254 aa  217  1e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1007  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  47.62 
 
 		 256 aa  218  1e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2426  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  44.09 
 
 		 258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00205999  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1358  thiazole biosynthesis enzyme  45.63 
 
 		 264 aa  205  5e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000774298  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2109  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  46.64 
 
 		 258 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2100  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  44.8 
 
 		 260 aa  194  8.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0859  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  42.06 
 
 		 259 aa  193  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.841302  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1609  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  41.8 
 
 		 268 aa  192  5e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000241948  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0421  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  43.2 
 
 		 271 aa  187  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000154841  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0663  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  44.14 
 
 		 261 aa  184  9e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.397509  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1121  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  41.47 
 
 		 286 aa  183  3e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0798  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  43.82 
 
 		 263 aa  170  2e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0725876  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0597  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  43.14 
 
 		 262 aa  167  1e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.469921  normal  0.642946 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2251  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  40.08 
 
 		 254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1321  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  43.14 
 
 		 261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0226  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  42.75 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2221  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  37.5 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000384751 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1935  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  39.92 
 
 		 254 aa  160  3e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1411  thiazole biosynthesis enzyme  37.65 
 
 		 267 aa  159  6e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1555  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  38.19 
 
 		 261 aa  156  3e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1498  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  37.21 
 
 		 275 aa  154  1e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.16629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1998  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  38.22 
 
 		 273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.310517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1420  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  35.04 
 
 		 263 aa  149  4e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.043335 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1052  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  36.36 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.273545  normal  0.78871 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0678  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  34.25 
 
 		 272 aa  144  1e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2980  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  33.21 
 
 		 309 aa  128  8.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0002  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  34.41 
 
 		 307 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1462  thiazole biosynthesis enzyme  31.91 
 
 		 310 aa  121  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2419  thiazole biosynthesis enzyme  31.45 
 
 		 309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50942  predicted protein  30.28 
 
 		 351 aa  119  3.9999999999999996e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.920544 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2718  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  32.27 
 
 		 308 aa  118  9e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03928  Putative thiazole synthaseTHI4_ASPOR Thiazole biosynthetic enzyme, mitochondrial ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q76B84]  31.7 
 
 		 331 aa  115  5e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.514294 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  25.13 
 
 		 506 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0885  putative oxidoreductase  48.89 
 
 		 612 aa  50.1  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2167  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  34.29 
 
 		 914 aa  47.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0237  putative selenate reductase subunit YgfK  52.63 
 
 		 997 aa  47.8  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1260  FAD dependent oxidoreductase  43.75 
 
 		 438 aa  47.8  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0418  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  45 
 
 		 653 aa  47  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  51.22 
 
 		 776 aa  46.2  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.98211  hitchhiker  0.000275945 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0129  FAD dependent oxidoreductase  27.01 
 
 		 436 aa  46.2  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0423  selenate reductase YgfK  50 
 
 		 1075 aa  45.8  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0866  hydrogenase subunit, putative  35.23 
 
 		 461 aa  45.8  0.0007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  50 
 
 		 462 aa  45.8  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1181  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  54.29 
 
 		 555 aa  45.4  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.590347 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_769  hydrogenase subunit  35.23 
 
 		 461 aa  45.4  0.0008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2250  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  54.29 
 
 		 617 aa  45.4  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  30.86 
 
 		 426 aa  44.7  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5691  monooxygenase FAD-binding  38.78 
 
 		 376 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  30.86 
 
 		 426 aa  44.7  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  30.86 
 
 		 426 aa  44.7  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  46.94 
 
 		 511 aa  44.7  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2463  putative oxidoreductase  46.15 
 
 		 413 aa  44.7  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  30.86 
 
 		 426 aa  45.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1027  FAD dependent oxidoreductase  24.46 
 
 		 430 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2880  hypothetical protein  55.26 
 
 		 511 aa  45.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436694 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1222  putative oxidoreductase  52.63 
 
 		 616 aa  44.7  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  30.86 
 
 		 426 aa  44.7  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  30.86 
 
 		 426 aa  44.7  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2533  putative oxidoreductase  38.81 
 
 		 413 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0200812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3527  FAD dependent oxidoreductase  31.52 
 
 		 508 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  30.86 
 
 		 426 aa  44.7  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1601  putative oxidoreductase  34.92 
 
 		 615 aa  45.4  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  30.86 
 
 		 426 aa  45.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1249  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  37.8 
 
 		 1073 aa  44.7  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0309731 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2376  putative oxidoreductase  38.81 
 
 		 413 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2421  putative oxidoreductase  38.81 
 
 		 413 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.70845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2332  putative oxidoreductase  38.81 
 
 		 413 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06470  glutamate synthase (NADPH) small subunit  39.19 
 
 		 476 aa  44.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000571005  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0109  glutamate synthase subunit beta  48.78 
 
 		 487 aa  44.3  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1566  putative oxidoreductase  46.51 
 
 		 363 aa  43.9  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000646977  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2295  putative oxidoreductase  50 
 
 		 412 aa  43.9  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1737  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  45.71 
 
 		 654 aa  44.3  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0256396 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2776  putative oxidoreductase  46.15 
 
 		 413 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0413  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  30.84 
 
 		 659 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.933547  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2823  monooxygenase, FAD-binding  40.48 
 
 		 371 aa  43.9  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.091542  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1564  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.34 
 
 		 891 aa  44.3  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1195  FAD dependent oxidoreductase  41.67 
 
 		 438 aa  44.3  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  47.73 
 
 		 463 aa  44.3  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0344  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  32.91 
 
 		 658 aa  44.3  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2425  putative oxidoreductase  38.81 
 
 		 413 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  24.5 
 
 		 592 aa  43.9  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0838  thioredoxin-disulfide reductase  48.65 
 
 		 312 aa  43.5  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1140  thioredoxin-disulfide reductase  48.65 
 
 		 312 aa  43.5  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1932  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.11 
 
 		 895 aa  43.9  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0418716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  29.63 
 
 		 426 aa  43.5  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3004  ferredoxin  35.94 
 
 		 493 aa  43.5  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  25.95 
 
 		 409 aa  43.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0142  thioredoxin-disulfide reductase  51.35 
 
 		 312 aa  42.7  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0580  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  42.37 
 
 		 653 aa  42.7  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000307705  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0161  thioredoxin-disulfide reductase  51.35 
 
 		 312 aa  42.7  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1736  putative oxidoreductase  51.43 
 
 		 615 aa  43.1  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06362  oxidoreductase  42.5 
 
 		 1412 aa  43.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0044  glutamate synthase subunit beta  25.83 
 
 		 472 aa  42.7  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5666  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.95 
 
 		 369 aa  43.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0188847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0473  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  54.29 
 
 		 996 aa  43.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>