More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0237 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02711  predicted oxidoreductase, Fe-S subunit  44.41 
 
 		 1032 aa  791    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0814  selenate reductase YgfK  44.51 
 
 		 1032 aa  792    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2656  selenate reductase YgfK  54.7 
 
 		 991 aa  1096    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3204  putative selenate reductase subunit YgfK  44.7 
 
 		 1032 aa  793    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02673  hypothetical protein  44.41 
 
 		 1032 aa  791    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3011  putative selenate reductase subunit YgfK  44.7 
 
 		 1032 aa  794    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1949  putative selenate reductase subunit YgfK  47.89 
 
 		 1016 aa  896    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00511971 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0830  putative selenate reductase subunit YgfK  44.32 
 
 		 1032 aa  788    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3038  putative selenate reductase subunit YgfK  44.41 
 
 		 1032 aa  791    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1671  selenate reductase YgfK  48.52 
 
 		 1009 aa  947    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0237  putative selenate reductase subunit YgfK  100 
 
 		 997 aa  2068    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4168  putative selenate reductase subunit YgfK  44.7 
 
 		 1032 aa  793    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0423  selenate reductase YgfK  37.78 
 
 		 1075 aa  621  1e-176  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1428  selenate reductase YgfK  42.11 
 
 		 854 aa  520  1e-146  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1495  hypothetical protein  50.23 
 
 		 560 aa  459  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2603  hypothetical protein  39.24 
 
 		 698 aa  263  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.661586  normal  0.233906 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0824  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.86 
 
 		 1126 aa  235  3e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3004  ferredoxin  37.76 
 
 		 493 aa  231  6e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  35.71 
 
 		 1150 aa  226  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0473  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.27 
 
 		 996 aa  221  3.9999999999999997e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0344  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  33.74 
 
 		 658 aa  211  4e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1737  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  34.43 
 
 		 654 aa  209  3e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0256396 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001399  formate dehydrogenase-O major subunit  33.64 
 
 		 1387 aa  207  6e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0658  glutamate synthase beta chain-related oxidoreductase, containing 2Fe-2S and 4Fe-4S clusters  31.8 
 
 		 688 aa  207  7e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2748  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  35.24 
 
 		 1005 aa  207  8e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.036886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.63 
 
 		 1440 aa  206  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0455  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  36.3 
 
 		 653 aa  204  5e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.374087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0084  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.49 
 
 		 476 aa  204  5e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06362  oxidoreductase  32.86 
 
 		 1412 aa  204  6e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.29 
 
 		 1406 aa  204  6e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0770  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  30.27 
 
 		 546 aa  204  9e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0398  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  32.35 
 
 		 1385 aa  202  3e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2411  putative oxidoreductase  34.71 
 
 		 471 aa  202  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000146466  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2825  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  32.25 
 
 		 699 aa  200  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0372  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  33.65 
 
 		 464 aa  200  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0937  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.12 
 
 		 1426 aa  196  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.137872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0838  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.36 
 
 		 1440 aa  196  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1031  glutamate synthase subunit beta  32.65 
 
 		 469 aa  196  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.473013  normal  0.613387 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06470  glutamate synthase (NADPH) small subunit  33.49 
 
 		 476 aa  195  4e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000571005  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2830  putative oxidoreductase  33.26 
 
 		 469 aa  195  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00165731  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3057  putative oxidoreductase  34.93 
 
 		 470 aa  194  5e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2791  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  32.56 
 
 		 1008 aa  194  7e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0809  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.5 
 
 		 1410 aa  194  8e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2033  glutamate synthase, small subunit  32.62 
 
 		 462 aa  192  2e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000276272 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2977  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  33.26 
 
 		 1011 aa  192  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.118712  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2274  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  29.89 
 
 		 542 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0531449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2463  putative oxidoreductase  33.5 
 
 		 413 aa  192  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0977  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  32.49 
 
 		 1105 aa  192  4e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.00000028046  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0580  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  33.49 
 
 		 653 aa  191  5e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000307705  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2776  putative oxidoreductase  33.25 
 
 		 413 aa  191  5.999999999999999e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2885  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  33.26 
 
 		 1011 aa  191  7e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3051  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.66 
 
 		 1424 aa  191  8e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3493  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.73 
 
 		 1425 aa  191  8e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2545  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  32.69 
 
 		 464 aa  191  8e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000029955  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1594  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  32.85 
 
 		 609 aa  190  1e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0752  putative oxidoreductase  34.68 
 
 		 470 aa  190  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000025302  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0958  putative bifunctional glutamate synthase subunit beta/2-polyprenylphenol hydroxylase  27.59 
 
 		 944 aa  190  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0871  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.35 
 
 		 1425 aa  190  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.510403  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1151  putative oxidoreductase  34.51 
 
 		 468 aa  190  1e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3616  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.35 
 
 		 1421 aa  189  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25290  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  31.48 
 
 		 612 aa  189  2e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.126958 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2212  putative oxidoreductase  35.63 
 
 		 465 aa  189  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3198  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.43 
 
 		 1432 aa  189  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.554904 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0988  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.89 
 
 		 1428 aa  189  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0651  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.01 
 
 		 466 aa  189  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.990694  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1304  putative oxidoreductase  34.51 
 
 		 468 aa  189  3e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3421  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.73 
 
 		 1425 aa  188  5e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0825  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.43 
 
 		 1432 aa  188  5e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541451 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3208  putative bifunctional glutamate synthase subunit beta/2-polyprenylphenol hydroxylase  32.43 
 
 		 947 aa  187  6e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.950859  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3298  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.43 
 
 		 1432 aa  187  6e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0021  putative oxidoreductase  32.95 
 
 		 469 aa  187  9e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0850  putative bifunctional glutamate synthase subunit beta/2-polyprenylphenol hydroxylase  27.05 
 
 		 942 aa  187  9e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0644  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.33 
 
 		 474 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000739676  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1249  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  32.71 
 
 		 1073 aa  186  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0309731 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1607  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  32.31 
 
 		 467 aa  186  2.0000000000000003e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0418  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  33.74 
 
 		 653 aa  186  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2796  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  33.41 
 
 		 477 aa  186  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0793  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.2 
 
 		 761 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.272826  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0493  putative oxidoreductase  34.66 
 
 		 477 aa  185  3e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0661627  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1486  glutamate synthase, small subunit  34.04 
 
 		 452 aa  185  3e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.622168  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4108  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  30.37 
 
 		 543 aa  186  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00112813  normal  0.10156 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1328  putative oxidoreductase  32.86 
 
 		 455 aa  185  4.0000000000000006e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100001  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0703  putative bifunctional glutamate synthase subunit beta/2-polyprenylphenol hydroxylase  31.79 
 
 		 944 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2138  putative oxidoreductase  33.04 
 
 		 480 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4866  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  31.06 
 
 		 559 aa  184  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0167  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.2 
 
 		 465 aa  184  5.0000000000000004e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.609581  normal  0.315729 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4955  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  31.06 
 
 		 559 aa  184  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0550  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.25 
 
 		 463 aa  184  6e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1693  putative oxidoreductase  32.87 
 
 		 483 aa  184  6e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1006  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  32.71 
 
 		 994 aa  184  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16540  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  33.33 
 
 		 612 aa  184  9.000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000430303  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2109  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  34.39 
 
 		 445 aa  183  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0407  putative oxidoreductase  33.33 
 
 		 503 aa  183  1e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0863164  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1828  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.09 
 
 		 448 aa  183  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1517  putative oxidoreductase  34.12 
 
 		 463 aa  183  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1138  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  32.43 
 
 		 458 aa  183  1e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0489  putative oxidoreductase  34.8 
 
 		 482 aa  183  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0020  putative oxidoreductase  32.71 
 
 		 469 aa  183  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0413  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  32.17 
 
 		 659 aa  182  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.933547  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2358  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  31.52 
 
 		 544 aa  183  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>