More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0423 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007644  Moth_1949  putative selenate reductase subunit YgfK  39.61 
 
 
1016 aa  636    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00511971 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0423  selenate reductase YgfK  100 
 
 
1075 aa  2196    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3011  putative selenate reductase subunit YgfK  38.3 
 
 
1032 aa  635    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4168  putative selenate reductase subunit YgfK  38.4 
 
 
1032 aa  635    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02711  predicted oxidoreductase, Fe-S subunit  38.4 
 
 
1032 aa  635  1e-180  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3204  putative selenate reductase subunit YgfK  39.84 
 
 
1032 aa  635  1e-180  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0814  selenate reductase YgfK  38.4 
 
 
1032 aa  635  1e-180  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3038  putative selenate reductase subunit YgfK  38.4 
 
 
1032 aa  635  1e-180  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0830  putative selenate reductase subunit YgfK  38.31 
 
 
1032 aa  633  1e-180  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02673  hypothetical protein  38.4 
 
 
1032 aa  635  1e-180  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1671  selenate reductase YgfK  37.07 
 
 
1009 aa  620  1e-176  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0237  putative selenate reductase subunit YgfK  37.78 
 
 
997 aa  621  1e-176  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2656  selenate reductase YgfK  35.87 
 
 
991 aa  572  1.0000000000000001e-162  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1428  selenate reductase YgfK  35.02 
 
 
854 aa  381  1e-104  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2603  hypothetical protein  41.39 
 
 
698 aa  317  9.999999999999999e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.661586  normal  0.233906 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1495  hypothetical protein  34.55 
 
 
560 aa  293  1e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  38.96 
 
 
1150 aa  280  8e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3004  ferredoxin  42.16 
 
 
493 aa  279  2e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0455  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  37.95 
 
 
653 aa  265  3e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.374087  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0658  glutamate synthase beta chain-related oxidoreductase, containing 2Fe-2S and 4Fe-4S clusters  38.25 
 
 
688 aa  261  4e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1194  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.75 
 
 
1487 aa  260  1e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0824  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.4 
 
 
1126 aa  248  4e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0937  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.38 
 
 
1426 aa  247  9e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.137872  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0167  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  40.19 
 
 
465 aa  246  1.9999999999999999e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.609581  normal  0.315729 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2986  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  35.95 
 
 
552 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144587 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06362  oxidoreductase  34.58 
 
 
1412 aa  245  3e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06470  glutamate synthase (NADPH) small subunit  38.59 
 
 
476 aa  244  6e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000571005  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0473  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.81 
 
 
996 aa  243  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0770  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  35.46 
 
 
546 aa  242  2.9999999999999997e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25290  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  34.97 
 
 
612 aa  242  2.9999999999999997e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.126958 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1737  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  35.67 
 
 
654 aa  241  5.999999999999999e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0256396 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0344  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  35.63 
 
 
658 aa  241  5.999999999999999e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0752  putative oxidoreductase  39.81 
 
 
470 aa  241  6.999999999999999e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000025302  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2314  respiratory-chain NADH dehydrogenase, 51 kDa subunit  37.92 
 
 
707 aa  240  9e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0653639  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16540  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  35.64 
 
 
612 aa  239  3e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000430303  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0977  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  33.67 
 
 
1105 aa  238  4e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.00000028046  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001399  formate dehydrogenase-O major subunit  33.89 
 
 
1387 aa  238  4e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0988  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.3 
 
 
1428 aa  238  5.0000000000000005e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0418  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  37.34 
 
 
653 aa  238  6e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2825  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  34.8 
 
 
699 aa  238  7e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2184  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  34.89 
 
 
541 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.544077  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0825  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.2 
 
 
1432 aa  237  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00541451 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.14 
 
 
1406 aa  237  1.0000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00210  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  35.18 
 
 
612 aa  236  2.0000000000000002e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.301732 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0809  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.55 
 
 
1410 aa  235  3e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0838  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.56 
 
 
1440 aa  234  5e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1594  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  33.05 
 
 
609 aa  234  6e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3198  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.2 
 
 
1432 aa  234  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.554904 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2274  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  33.54 
 
 
542 aa  234  9e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0531449  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0651  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.68 
 
 
466 aa  233  1e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.990694  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1828  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  38.9 
 
 
448 aa  233  2e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2152  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  34.75 
 
 
571 aa  232  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000764519 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0550  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.62 
 
 
463 aa  232  3e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1263  putative oxidoreductase  37.38 
 
 
468 aa  231  4e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00449905  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1249  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  36.61 
 
 
1073 aa  230  8e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0309731 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0372  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  36.96 
 
 
464 aa  230  1e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1151  putative oxidoreductase  38.22 
 
 
468 aa  229  2e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1181  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.78 
 
 
555 aa  229  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.590347 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0283  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.95 
 
 
464 aa  229  3e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3501  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  38.9 
 
 
463 aa  228  3e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.860483  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2545  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  38.65 
 
 
464 aa  229  3e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000029955  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1855  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.66 
 
 
579 aa  228  4e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0230589  normal  0.0943361 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1463  putative oxidoreductase  37.14 
 
 
468 aa  228  4e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0084  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.5 
 
 
476 aa  228  4e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1006  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  38.16 
 
 
994 aa  228  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2830  putative oxidoreductase  37.98 
 
 
469 aa  228  5.0000000000000005e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00165731  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0580  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  36.06 
 
 
653 aa  228  6e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000307705  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3298  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.28 
 
 
1432 aa  228  6e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4108  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  36.54 
 
 
543 aa  228  6e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00112813  normal  0.10156 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0644  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.58 
 
 
474 aa  227  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000739676  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1350  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.79 
 
 
1480 aa  227  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.933284 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1138  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.09 
 
 
458 aa  225  3e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1517  putative oxidoreductase  38.07 
 
 
463 aa  225  3e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0447  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  38.11 
 
 
656 aa  225  3e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.595012  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2796  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  35.8 
 
 
477 aa  225  4e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144083  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1304  putative oxidoreductase  38.22 
 
 
468 aa  224  6e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2800  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.69 
 
 
608 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.563471  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4866  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  36.21 
 
 
559 aa  223  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4955  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  36.21 
 
 
559 aa  223  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3051  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.39 
 
 
1424 aa  223  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0227  putative oxidoreductase  38.11 
 
 
469 aa  222  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.967797 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2250  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  36.65 
 
 
617 aa  222  3.9999999999999997e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2596  putative oxidoreductase  37.23 
 
 
469 aa  221  7e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.712045  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5234  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  36.01 
 
 
558 aa  220  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.542472  normal  0.83486 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0703  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  38.17 
 
 
543 aa  219  1e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.72 
 
 
1440 aa  219  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0793  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.74 
 
 
761 aa  219  2e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.272826  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1607  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.44 
 
 
467 aa  219  2e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1163  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.45 
 
 
457 aa  219  2e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1932  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.09 
 
 
895 aa  218  5e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0418716  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6307  putative 2-ketoglutarate  31.5 
 
 
599 aa  218  5e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.747625  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3057  putative oxidoreductase  37.77 
 
 
470 aa  217  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2212  putative oxidoreductase  35.12 
 
 
465 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2109  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  37.68 
 
 
445 aa  217  9.999999999999999e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0745  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  37.92 
 
 
994 aa  217  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.375637  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3235  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.45 
 
 
596 aa  216  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.19985 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0398  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  32.08 
 
 
1385 aa  216  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.48 
 
 
1481 aa  215  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1328  putative oxidoreductase  35.52 
 
 
455 aa  215  3.9999999999999995e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100001  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3493  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.18 
 
 
1425 aa  215  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>