More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1671 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02711  predicted oxidoreductase, Fe-S subunit  42.72 
 
 
1032 aa  794    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1671  selenate reductase YgfK  100 
 
 
1009 aa  2086    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0237  putative selenate reductase subunit YgfK  48.52 
 
 
997 aa  956    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0814  selenate reductase YgfK  42.82 
 
 
1032 aa  795    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3038  putative selenate reductase subunit YgfK  42.72 
 
 
1032 aa  794    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4168  putative selenate reductase subunit YgfK  42.62 
 
 
1032 aa  797    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2656  selenate reductase YgfK  50.05 
 
 
991 aa  983    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1949  putative selenate reductase subunit YgfK  49.09 
 
 
1016 aa  939    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00511971 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0830  putative selenate reductase subunit YgfK  42.72 
 
 
1032 aa  793    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3011  putative selenate reductase subunit YgfK  42.43 
 
 
1032 aa  794    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1428  selenate reductase YgfK  50.24 
 
 
854 aa  639    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3204  putative selenate reductase subunit YgfK  42.72 
 
 
1032 aa  797    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02673  hypothetical protein  42.72 
 
 
1032 aa  794    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0423  selenate reductase YgfK  37.03 
 
 
1075 aa  622  1e-176  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1495  hypothetical protein  53.35 
 
 
560 aa  462  9.999999999999999e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2603  hypothetical protein  36.84 
 
 
698 aa  257  1.0000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.661586  normal  0.233906 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  36.79 
 
 
1150 aa  226  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3004  ferredoxin  34.44 
 
 
493 aa  216  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0809  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.9 
 
 
1410 aa  213  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0473  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.09 
 
 
996 aa  211  7e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0752  putative oxidoreductase  34.13 
 
 
470 aa  207  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000025302  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.72 
 
 
1406 aa  206  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25290  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  33.5 
 
 
612 aa  204  5e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.126958 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0398  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  32.38 
 
 
1385 aa  202  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00210  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  30.15 
 
 
612 aa  203  1.9999999999999998e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.301732 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0455  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  34.24 
 
 
653 aa  202  3e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.374087  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1151  putative oxidoreductase  33.89 
 
 
468 aa  201  7e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001399  formate dehydrogenase-O major subunit  32.69 
 
 
1387 aa  200  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0344  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  31.59 
 
 
658 aa  200  1.0000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3493  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.72 
 
 
1425 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3057  putative oxidoreductase  33.25 
 
 
470 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0871  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.95 
 
 
1425 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.510403  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06362  oxidoreductase  32.53 
 
 
1412 aa  198  3e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0838  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.9 
 
 
1440 aa  199  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0937  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.33 
 
 
1426 aa  199  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.137872  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3421  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.95 
 
 
1425 aa  198  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.36 
 
 
1440 aa  197  6e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3051  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.47 
 
 
1424 aa  197  9e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0580  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  31.09 
 
 
653 aa  197  1e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000307705  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0824  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.84 
 
 
1126 aa  197  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0977  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  33.54 
 
 
1105 aa  196  2e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.00000028046  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3616  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.26 
 
 
1421 aa  196  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0651  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.1 
 
 
466 aa  196  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.990694  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1163  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  31.88 
 
 
457 aa  196  2e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3298  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.02 
 
 
1432 aa  196  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2184  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  30.28 
 
 
541 aa  195  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.544077  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1304  putative oxidoreductase  32.94 
 
 
468 aa  196  3e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3198  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.71 
 
 
1432 aa  195  4e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.554904 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0658  glutamate synthase beta chain-related oxidoreductase, containing 2Fe-2S and 4Fe-4S clusters  31.16 
 
 
688 aa  195  4e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0958  putative bifunctional glutamate synthase subunit beta/2-polyprenylphenol hydroxylase  33.25 
 
 
944 aa  195  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2274  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  28.73 
 
 
542 aa  194  7e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0531449  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0988  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.79 
 
 
1428 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16540  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  30.8 
 
 
612 aa  192  2.9999999999999997e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000430303  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3635  putative oxidoreductase  33.49 
 
 
476 aa  191  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000713283  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0825  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.48 
 
 
1432 aa  192  4e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00541451 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0372  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  32.46 
 
 
464 aa  191  5.999999999999999e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0850  putative bifunctional glutamate synthase subunit beta/2-polyprenylphenol hydroxylase  32.55 
 
 
942 aa  190  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0770  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  31.34 
 
 
546 aa  189  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1071  putative oxidoreductase  35.68 
 
 
468 aa  189  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.188657  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2545  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  32.31 
 
 
464 aa  187  7e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000029955  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1607  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  32.32 
 
 
467 aa  187  1.0000000000000001e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5234  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  28.87 
 
 
558 aa  186  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.542472  normal  0.83486 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4955  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  28.49 
 
 
559 aa  186  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0703  putative bifunctional glutamate synthase subunit beta/2-polyprenylphenol hydroxylase  33.49 
 
 
944 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4866  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  28.49 
 
 
559 aa  186  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2830  putative oxidoreductase  32.37 
 
 
469 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00165731  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1594  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  29.48 
 
 
609 aa  186  3e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5203  putative bifunctional glutamate synthase subunit beta/2-polyprenylphenol hydroxylase  32.08 
 
 
944 aa  185  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0035  putative oxidoreductase  31.85 
 
 
465 aa  184  5.0000000000000004e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0177614  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2825  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  32.46 
 
 
699 aa  184  7e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1250  putative oxidoreductase  32.56 
 
 
476 aa  184  8.000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1138  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  31.27 
 
 
458 aa  183  1e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4108  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  27.59 
 
 
543 aa  183  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00112813  normal  0.10156 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0550  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  31.57 
 
 
463 aa  182  2e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0038  putative oxidoreductase  31.4 
 
 
465 aa  182  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.237423  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1737  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  32.04 
 
 
654 aa  182  2.9999999999999997e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0256396 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0167  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  30.99 
 
 
465 aa  182  2.9999999999999997e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.609581  normal  0.315729 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2411  putative oxidoreductase  33.49 
 
 
471 aa  181  8e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000146466  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2150  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  30.92 
 
 
480 aa  181  8e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60175  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06470  glutamate synthase (NADPH) small subunit  31.32 
 
 
476 aa  181  9e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000571005  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2748  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  30.69 
 
 
1005 aa  180  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.036886  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0551  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  31.99 
 
 
479 aa  180  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0021  putative oxidoreductase  34.14 
 
 
469 aa  180  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1194  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.43 
 
 
1487 aa  180  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_36  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  30.96 
 
 
465 aa  180  1e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.800256  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0020  putative oxidoreductase  34.14 
 
 
469 aa  179  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0418  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  34.07 
 
 
653 aa  179  2e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0283  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  31.18 
 
 
464 aa  179  2e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1068  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.37 
 
 
461 aa  178  5e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000664223  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1181  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.11 
 
 
555 aa  177  8e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.590347 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2002  putative oxidoreductase  33.1 
 
 
480 aa  177  9e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.14117  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0938  putative oxidoreductase  32.41 
 
 
481 aa  177  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0766  putative oxidoreductase  32.62 
 
 
476 aa  177  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0956688 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2986  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  26.59 
 
 
552 aa  177  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144587 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1175  glutamate synthase subunit beta  30.81 
 
 
461 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0820  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.77 
 
 
466 aa  176  1.9999999999999998e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3208  putative bifunctional glutamate synthase subunit beta/2-polyprenylphenol hydroxylase  30.86 
 
 
947 aa  175  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.950859  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2682  glutamate synthase subunit beta  33.18 
 
 
483 aa  176  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.287891 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1517  putative oxidoreductase  33.02 
 
 
463 aa  175  5e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1486  glutamate synthase, small subunit  31.42 
 
 
452 aa  175  5e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.622168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>