More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2463 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2776  putative oxidoreductase  99.03 
 
 		 413 aa  831    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2463  putative oxidoreductase  100 
 
 		 413 aa  836    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2969  putative oxidoreductase  56.72 
 
 		 411 aa  476  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.765819  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1292  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  56.57 
 
 		 398 aa  451  1e-125  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2295  putative oxidoreductase  54.52 
 
 		 412 aa  440  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0257  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  54.32 
 
 		 413 aa  432  1e-120  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000358585  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3412  putative oxidoreductase  51.24 
 
 		 405 aa  411  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000759974  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06470  glutamate synthase (NADPH) small subunit  41.35 
 
 		 476 aa  318  1e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000571005  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0550  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  40.24 
 
 		 463 aa  303  5.000000000000001e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0793  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  41.69 
 
 		 761 aa  302  6.000000000000001e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.272826  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1463  putative oxidoreductase  41.34 
 
 		 468 aa  301  2e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1263  putative oxidoreductase  41.34 
 
 		 468 aa  301  2e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00449905  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0372  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  40.37 
 
 		 464 aa  298  1e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0644  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  40 
 
 		 474 aa  297  3e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000739676  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4566  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.48 
 
 		 438 aa  294  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191225  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3057  putative oxidoreductase  38.68 
 
 		 470 aa  288  1e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0752  putative oxidoreductase  39.3 
 
 		 470 aa  286  5e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000025302  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2545  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  39.03 
 
 		 464 aa  283  5.000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000029955  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0021  putative oxidoreductase  38 
 
 		 469 aa  280  3e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1328  putative oxidoreductase  39.9 
 
 		 455 aa  280  3e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100001  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0651  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  39.35 
 
 		 466 aa  280  3e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.990694  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2411  putative oxidoreductase  38.39 
 
 		 471 aa  280  4e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000146466  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0020  putative oxidoreductase  37.79 
 
 		 469 aa  278  9e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2830  putative oxidoreductase  38.63 
 
 		 469 aa  277  3e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00165731  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1071  putative oxidoreductase  39.19 
 
 		 468 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.188657  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0551  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.66 
 
 		 479 aa  275  2.0000000000000002e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1517  putative oxidoreductase  38.84 
 
 		 463 aa  270  2.9999999999999997e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0317  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  38.06 
 
 		 469 aa  268  1e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000287651  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1163  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.06 
 
 		 457 aa  266  4e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1282  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.83 
 
 		 447 aa  264  2e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0227  putative oxidoreductase  40 
 
 		 469 aa  263  4e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.967797 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1112  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  35.47 
 
 		 446 aa  261  2e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2934  putative oxidoreductase  37.3 
 
 		 459 aa  257  2e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.912851  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0035  putative oxidoreductase  36.3 
 
 		 465 aa  257  3e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0177614  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1151  putative oxidoreductase  37.41 
 
 		 468 aa  256  4e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2796  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  35.46 
 
 		 477 aa  256  4e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_36  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.53 
 
 		 465 aa  256  5e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.800256  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2596  putative oxidoreductase  36.93 
 
 		 469 aa  255  9e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.712045  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0038  putative oxidoreductase  35.83 
 
 		 465 aa  255  9e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.237423  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1304  putative oxidoreductase  37.41 
 
 		 468 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0167  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37 
 
 		 465 aa  255  1.0000000000000001e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.609581  normal  0.315729 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0283  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.7 
 
 		 464 aa  255  1.0000000000000001e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1250  putative oxidoreductase  36.77 
 
 		 476 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3501  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  38.52 
 
 		 463 aa  253  3e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.860483  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0407  putative oxidoreductase  37.13 
 
 		 503 aa  253  4.0000000000000004e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0863164  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0617  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.41 
 
 		 466 aa  251  1e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.268237  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1607  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.67 
 
 		 467 aa  251  1e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1828  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.98 
 
 		 448 aa  251  2e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2150  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.05 
 
 		 480 aa  251  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0766  putative oxidoreductase  35.48 
 
 		 476 aa  251  2e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0956688 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3635  putative oxidoreductase  36.68 
 
 		 476 aa  249  7e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000713283  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2781  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.28 
 
 		 497 aa  249  9e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.662826  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0337  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  38.06 
 
 		 467 aa  247  2e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0820  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.88 
 
 		 466 aa  247  2e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0084  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.3 
 
 		 476 aa  246  4e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1117  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.73 
 
 		 447 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1138  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.44 
 
 		 458 aa  242  7.999999999999999e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1958  glutamate synthase subunit beta  34.4 
 
 		 470 aa  241  2e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0473  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.47 
 
 		 996 aa  240  4e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1693  putative oxidoreductase  34.58 
 
 		 483 aa  239  5e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0824  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.07 
 
 		 1126 aa  239  5e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2748  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  34.74 
 
 		 1005 aa  239  8e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.036886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0436  putative oxidoreductase  34.27 
 
 		 482 aa  238  1e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.259877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0938  putative oxidoreductase  35.6 
 
 		 481 aa  238  2e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0493  putative oxidoreductase  34.88 
 
 		 477 aa  237  2e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0661627  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0489  putative oxidoreductase  34.43 
 
 		 482 aa  238  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2977  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  36.3 
 
 		 1011 aa  236  6e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.118712  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2885  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  36.43 
 
 		 1011 aa  235  8e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2002  putative oxidoreductase  35.31 
 
 		 480 aa  235  9e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.14117  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2791  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  35.84 
 
 		 1008 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0537  putative oxidoreductase  34.19 
 
 		 480 aa  234  3e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1249  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  37.35 
 
 		 1073 aa  233  7.000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0309731 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  34.57 
 
 		 1150 aa  232  9e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2033  glutamate synthase, small subunit  34.34 
 
 		 462 aa  232  1e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000276272 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0262  putative oxidoreductase  36.68 
 
 		 462 aa  231  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1006  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  35.31 
 
 		 994 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1125  glutamate synthase subunit beta  31.7 
 
 		 469 aa  229  5e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1220  glutamate synthase subunit beta  32.4 
 
 		 469 aa  228  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1129  glutamate synthase subunit beta  31.71 
 
 		 472 aa  227  3e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0513615  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5121  glutamate synthase, small subunit  33.18 
 
 		 472 aa  227  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0412  glutamate synthase subunit beta  33.18 
 
 		 472 aa  227  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0529  glutamate synthase subunit beta  31.71 
 
 		 472 aa  227  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66560  glutamate synthase subunit beta  33.33 
 
 		 477 aa  227  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0465  glutamate synthase subunit beta  31.71 
 
 		 472 aa  227  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000235827  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1194  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.23 
 
 		 1487 aa  226  4e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0391  glutamate synthase subunit beta  33.64 
 
 		 472 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1068  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.79 
 
 		 461 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000664223  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1111  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.3 
 
 		 469 aa  226  6e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45200  glutamate synthase subunit beta  32.57 
 
 		 473 aa  226  8e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1012  glutamate synthase subunit beta  31.63 
 
 		 469 aa  226  8e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5772  glutamate synthase subunit beta  33.1 
 
 		 477 aa  226  8e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4948  glutamate synthase subunit beta  33.41 
 
 		 472 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.551106  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5075  glutamate synthase subunit beta  33.41 
 
 		 472 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0414  glutamate synthase subunit beta  32.95 
 
 		 472 aa  224  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4536  glutamate synthase subunit beta  32.41 
 
 		 472 aa  224  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4345  glutamate synthase subunit beta  31.72 
 
 		 472 aa  224  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0056621  hitchhiker  0.00954543 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5125  glutamate synthase subunit beta  33.41 
 
 		 472 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1900  putative bifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta  37.18 
 
 		 747 aa  223  4e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.22072  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1031  glutamate synthase subunit beta  31.24 
 
 		 469 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.473013  normal  0.613387 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3701  glutamate synthase subunit beta  32.18 
 
 		 472 aa  223  6e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>