More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2724 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  100 
 
 		 506 aa  1030    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  41.33 
 
 		 470 aa  356  5.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  40.85 
 
 		 480 aa  346  7e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2240  alkylhalidase  41.65 
 
 		 480 aa  332  8e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345155  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2103  putative tryptophan halogenase  41.65 
 
 		 480 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0674783  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1005  FAD binding domain-containing protein  41.65 
 
 		 480 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0347975  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2048  putative tryptophan halogenase  41.65 
 
 		 480 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826968  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  38.62 
 
 		 491 aa  314  2.9999999999999996e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  40.05 
 
 		 507 aa  234  3e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  36.79 
 
 		 495 aa  233  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10884  conserved hypothetical protein  34.38 
 
 		 647 aa  216  7e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  36.09 
 
 		 413 aa  204  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  35.75 
 
 		 441 aa  196  8.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01623  conserved hypothetical protein  30.31 
 
 		 476 aa  177  5e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.282796 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3116  tryptophan halogenase  33.96 
 
 		 417 aa  170  6e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  33.33 
 
 		 449 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2065  tryptophan halogenase  34.97 
 
 		 439 aa  160  6e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  32.72 
 
 		 455 aa  158  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  31.12 
 
 		 461 aa  151  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  30.92 
 
 		 444 aa  151  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  28.23 
 
 		 444 aa  150  7e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  28.66 
 
 		 439 aa  149  8e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  28.66 
 
 		 439 aa  149  8e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  31.17 
 
 		 445 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  30.77 
 
 		 455 aa  147  3e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3311  tryptophan halogenase  32.48 
 
 		 449 aa  148  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3158  tryptophan halogenase  29.7 
 
 		 584 aa  143  8e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000257719 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5510  tryptophan halogenase  29.19 
 
 		 587 aa  142  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0428  FAD dependent oxidoreductase  32.38 
 
 		 410 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25324  normal  0.196339 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3913  monooxygenase FAD-binding  34.01 
 
 		 416 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  30.53 
 
 		 455 aa  139  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0428  monooxygenase, FAD-binding  32.22 
 
 		 415 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00208516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  29.94 
 
 		 435 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  29.94 
 
 		 435 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  31.79 
 
 		 415 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5621  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  31.32 
 
 		 409 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  31.91 
 
 		 409 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  28.99 
 
 		 444 aa  131  3e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0331  monooxygenase, FAD-binding  29.73 
 
 		 435 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  28.21 
 
 		 409 aa  130  8.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2822  flavoprotein/dehydrogenase  29.72 
 
 		 413 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4378  FAD-binding protein  29.64 
 
 		 436 aa  128  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  30 
 
 		 424 aa  125  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1863  tryptophan halogenase  28.78 
 
 		 415 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004059  FAD-binding protein inferred for ABFAE pathway  29 
 
 		 414 aa  124  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2756  tryptophan halogenase  30.88 
 
 		 618 aa  124  4e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  27.54 
 
 		 422 aa  124  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  28.28 
 
 		 429 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1497  tryptophan halogenase  31.98 
 
 		 406 aa  121  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.756039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  29.97 
 
 		 416 aa  121  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1615  dehydrogenase  29.81 
 
 		 405 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3898  tryptophan halogenase  25.67 
 
 		 429 aa  120  7e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  28.27 
 
 		 429 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  29.2 
 
 		 419 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3521  tryptophan halogenase  29.5 
 
 		 424 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.956189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4606  tryptophan halogenase  26.05 
 
 		 420 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  29.2 
 
 		 419 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4493  monooxygenase FAD-binding  29.13 
 
 		 488 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575117  normal  0.0380746 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2108  FAD dependent oxidoreductase  26.3 
 
 		 413 aa  117  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  27.89 
 
 		 429 aa  117  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  27.89 
 
 		 429 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  27.89 
 
 		 429 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0315  tryptophan halogenase  27.16 
 
 		 420 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0135  tryptophan halogenase  29.18 
 
 		 417 aa  113  6e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03920  Monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:Tryptophanhalogenase  27.49 
 
 		 415 aa  110  7.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.117201  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2003  tryptophan halogenase  27.52 
 
 		 415 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.923769 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3046  tryptophan halogenase  31.4 
 
 		 414 aa  107  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354433  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  32.85 
 
 		 445 aa  106  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0945  putative oxidoreductase  30.86 
 
 		 414 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.183705  normal  0.443912 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4091  tryptophan halogenase  30.28 
 
 		 415 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  31.81 
 
 		 424 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3616  tryptophan halogenase  29.14 
 
 		 415 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.190224  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00759  putative oxidoreductase protein  29.36 
 
 		 419 aa  98.2  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  0.0681702 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  30.37 
 
 		 418 aa  96.7  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1110  tryptophan halogenase  27 
 
 		 416 aa  96.7  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2756  FAD dependent oxidoreductase  28.82 
 
 		 417 aa  93.2  9e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.471979  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  27.88 
 
 		 435 aa  91.3  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  30.24 
 
 		 423 aa  89.7  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  29.31 
 
 		 457 aa  88.6  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  27.71 
 
 		 425 aa  87.8  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  29.46 
 
 		 423 aa  87.4  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3720  FAD dependent oxidoreductase  25.84 
 
 		 372 aa  87  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288954 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2083  FAD dependent oxidoreductase  26.06 
 
 		 344 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6678  tryptophan halogenase  28.65 
 
 		 506 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  28.81 
 
 		 382 aa  85.9  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  28.88 
 
 		 431 aa  85.9  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  26.29 
 
 		 434 aa  84.3  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  25.14 
 
 		 384 aa  84  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  39.29 
 
 		 424 aa  83.2  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  28.32 
 
 		 434 aa  82.4  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  25.91 
 
 		 398 aa  81.6  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0318  dehydrogenases (flavoproteins)-like  25.46 
 
 		 482 aa  81.3  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.331589 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2626  monooxygenase FAD-binding  26.52 
 
 		 356 aa  80.5  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6353  FAD dependent oxidoreductase  23.4 
 
 		 606 aa  80.5  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000576963 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  24.65 
 
 		 370 aa  80.1  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0681  geranylgeranyl reductase  24.18 
 
 		 453 aa  77.8  0.0000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00166018  hitchhiker  0.00000684168 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  28.72 
 
 		 430 aa  78.2  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  30.24 
 
 		 440 aa  77.4  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02880  halogenase  25.65 
 
 		 540 aa  77  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0993  FAD dependent oxidoreductase  25.65 
 
 		 696 aa  76.3  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>