126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0318 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0318  dehydrogenases (flavoproteins)-like  100 
 
 		 482 aa  1006    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.331589 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2626  monooxygenase FAD-binding  34.32 
 
 		 356 aa  206  9e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3477  dehydrogenase (flavoprotein)  34.32 
 
 		 356 aa  203  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00015718  normal  0.0486362 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0291  FAD dependent oxidoreductase  28.76 
 
 		 361 aa  150  5e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3529  monooxygenase FAD-binding  28.1 
 
 		 409 aa  141  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174105  decreased coverage  0.00232713 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4289  monooxygenase FAD-binding  27.22 
 
 		 372 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2641  monooxygenase, FAD-binding  28.28 
 
 		 401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3720  FAD dependent oxidoreductase  27.03 
 
 		 372 aa  130  8.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288954 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1021  FAD dependent oxidoreductase  28.17 
 
 		 392 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0828  FAD dependent oxidoreductase  27.06 
 
 		 356 aa  116  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.491479  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4493  monooxygenase FAD-binding  23.43 
 
 		 488 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575117  normal  0.0380746 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6678  tryptophan halogenase  23.61 
 
 		 506 aa  92.8  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  28.09 
 
 		 413 aa  87.8  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5262  hypothetical protein  23.93 
 
 		 366 aa  85.1  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5510  tryptophan halogenase  22.37 
 
 		 587 aa  84.7  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  23.08 
 
 		 441 aa  84.3  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  25.46 
 
 		 506 aa  81.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2750  Dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  23.21 
 
 		 366 aa  79  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.589907  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  24.29 
 
 		 470 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3158  tryptophan halogenase  24.7 
 
 		 584 aa  76.3  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000257719 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  25.08 
 
 		 491 aa  75.1  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2756  tryptophan halogenase  25.93 
 
 		 618 aa  72.4  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2065  tryptophan halogenase  20.99 
 
 		 439 aa  71.6  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1705  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 366 aa  71.2  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  22.77 
 
 		 444 aa  70.1  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  21.45 
 
 		 398 aa  68.2  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1615  dehydrogenase  22.47 
 
 		 405 aa  67.8  0.0000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2083  FAD dependent oxidoreductase  22.54 
 
 		 344 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  21.24 
 
 		 422 aa  65.9  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  25 
 
 		 455 aa  64.7  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  22.29 
 
 		 444 aa  64.3  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0759  hypothetical protein  21.74 
 
 		 447 aa  63.9  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  24.8 
 
 		 444 aa  63.9  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2979  aromatic-ring hydroxylase  29.57 
 
 		 434 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  22.87 
 
 		 455 aa  62.4  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  22.84 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  21.19 
 
 		 416 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1497  tryptophan halogenase  21.81 
 
 		 406 aa  61.2  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.756039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3521  tryptophan halogenase  21.5 
 
 		 424 aa  60.8  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.956189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2948  monooxygenase FAD-binding  22.43 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284077  normal  0.479686 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  23.62 
 
 		 445 aa  60.1  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0135  tryptophan halogenase  22.25 
 
 		 417 aa  60.1  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  24.15 
 
 		 449 aa  60.1  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2003  tryptophan halogenase  22.16 
 
 		 415 aa  59.7  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.923769 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  21.83 
 
 		 480 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4091  tryptophan halogenase  21.88 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0428  monooxygenase, FAD-binding  23.15 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00208516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  22.28 
 
 		 461 aa  58.5  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  20.98 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05461  NAD binding site  22.49 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  20.98 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3616  tryptophan halogenase  21.32 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.190224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  22.56 
 
 		 439 aa  56.6  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  22.56 
 
 		 439 aa  56.6  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  23.75 
 
 		 384 aa  56.6  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4606  tryptophan halogenase  23.08 
 
 		 420 aa  56.2  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05761  NAD binding site  21.45 
 
 		 377 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.680324  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2304  FAD dependent oxidoreductase  22.59 
 
 		 430 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.721165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  22.74 
 
 		 455 aa  55.5  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10884  conserved hypothetical protein  24.71 
 
 		 647 aa  55.1  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5621  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  21.56 
 
 		 409 aa  54.7  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  23.1 
 
 		 408 aa  55.1  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3898  tryptophan halogenase  21.21 
 
 		 429 aa  53.9  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004059  FAD-binding protein inferred for ABFAE pathway  20.24 
 
 		 414 aa  53.9  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2240  alkylhalidase  21.25 
 
 		 480 aa  53.5  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345155  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0428  FAD dependent oxidoreductase  21.94 
 
 		 410 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25324  normal  0.196339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  18.94 
 
 		 425 aa  53.5  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2048  putative tryptophan halogenase  20.94 
 
 		 480 aa  53.5  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826968  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1005  FAD binding domain-containing protein  21.25 
 
 		 480 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0347975  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  20.31 
 
 		 409 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2103  putative tryptophan halogenase  21.25 
 
 		 480 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0674783  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  23.01 
 
 		 415 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2822  flavoprotein/dehydrogenase  22.16 
 
 		 413 aa  52.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  22.11 
 
 		 395 aa  52  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  21.73 
 
 		 424 aa  52.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  21.54 
 
 		 429 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  21.88 
 
 		 429 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2472  monooxygenase FAD-binding  23.16 
 
 		 430 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3913  monooxygenase FAD-binding  22.02 
 
 		 416 aa  52.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  21.88 
 
 		 429 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03920  Monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:Tryptophanhalogenase  20.11 
 
 		 415 aa  52  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.117201  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  21.47 
 
 		 429 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5969  geranylgeranyl reductase  23.28 
 
 		 409 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.365894  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3796  oxidoreductase  23.63 
 
 		 377 aa  50.1  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.204918 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  21.05 
 
 		 435 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  21.36 
 
 		 435 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  21.73 
 
 		 507 aa  49.7  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2108  FAD dependent oxidoreductase  20.98 
 
 		 413 aa  49.7  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  22.03 
 
 		 431 aa  49.7  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  21.78 
 
 		 413 aa  48.9  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05841  NAD binding site  22.31 
 
 		 377 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4378  FAD-binding protein  20.24 
 
 		 436 aa  48.5  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  21.83 
 
 		 368 aa  48.5  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  20.1 
 
 		 429 aa  47.8  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  24.56 
 
 		 384 aa  47.8  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4075  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  33.64 
 
 		 557 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.556531  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6299  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  40.32 
 
 		 549 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00759  putative oxidoreductase protein  22.6 
 
 		 419 aa  47.4  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  0.0681702 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  19.57 
 
 		 409 aa  47.4  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  21.74 
 
 		 445 aa  47.4  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>