215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1110 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1110  tryptophan halogenase  100 
 
 		 416 aa  858    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0135  tryptophan halogenase  68.46 
 
 		 417 aa  594  1e-169  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03920  Monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:Tryptophanhalogenase  56.51 
 
 		 415 aa  489  1e-137  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.117201  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2822  flavoprotein/dehydrogenase  48.31 
 
 		 413 aa  430  1e-119  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2003  tryptophan halogenase  48.18 
 
 		 415 aa  401  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.923769 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1863  tryptophan halogenase  45.23 
 
 		 415 aa  392  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0331  monooxygenase, FAD-binding  40.82 
 
 		 435 aa  316  5e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  40.58 
 
 		 435 aa  316  6e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  41.06 
 
 		 435 aa  315  7e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2108  FAD dependent oxidoreductase  39.95 
 
 		 413 aa  315  9.999999999999999e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3521  tryptophan halogenase  41.54 
 
 		 424 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.956189  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4378  FAD-binding protein  40.79 
 
 		 436 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  39.81 
 
 		 429 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  40.19 
 
 		 429 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  39.81 
 
 		 429 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  39.81 
 
 		 429 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5621  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  39.65 
 
 		 409 aa  311  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  39.56 
 
 		 429 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  39.8 
 
 		 409 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004059  FAD-binding protein inferred for ABFAE pathway  39.66 
 
 		 414 aa  307  2.0000000000000002e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  39.02 
 
 		 415 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3913  monooxygenase FAD-binding  39.34 
 
 		 416 aa  302  6.000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0428  monooxygenase, FAD-binding  37.62 
 
 		 415 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00208516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3898  tryptophan halogenase  39.75 
 
 		 429 aa  300  4e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4606  tryptophan halogenase  38.99 
 
 		 420 aa  298  8e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  38.42 
 
 		 416 aa  297  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1615  dehydrogenase  41.54 
 
 		 405 aa  297  3e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  39.54 
 
 		 424 aa  297  3e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  37.65 
 
 		 422 aa  293  3e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0315  tryptophan halogenase  39.1 
 
 		 420 aa  293  4e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  40.51 
 
 		 409 aa  292  9e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  36.73 
 
 		 419 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0428  FAD dependent oxidoreductase  38.97 
 
 		 410 aa  291  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25324  normal  0.196339 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  36.73 
 
 		 419 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1497  tryptophan halogenase  38.01 
 
 		 406 aa  288  2e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.756039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4091  tryptophan halogenase  36.43 
 
 		 415 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3616  tryptophan halogenase  36.43 
 
 		 415 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.190224  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00759  putative oxidoreductase protein  37.4 
 
 		 419 aa  271  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  0.0681702 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2756  FAD dependent oxidoreductase  36.79 
 
 		 417 aa  263  3e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.471979  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0945  putative oxidoreductase  37.22 
 
 		 414 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.183705  normal  0.443912 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3046  tryptophan halogenase  36.64 
 
 		 414 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354433  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  27.07 
 
 		 461 aa  153  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  26.04 
 
 		 455 aa  151  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  28.54 
 
 		 444 aa  145  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3116  tryptophan halogenase  30.79 
 
 		 417 aa  142  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  27.23 
 
 		 444 aa  140  4.999999999999999e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  27.32 
 
 		 439 aa  139  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  27.32 
 
 		 439 aa  139  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  26.45 
 
 		 455 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3311  tryptophan halogenase  27.74 
 
 		 449 aa  130  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  26.03 
 
 		 445 aa  126  7e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  25.32 
 
 		 444 aa  123  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  28.44 
 
 		 470 aa  123  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  29.41 
 
 		 480 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  25.38 
 
 		 449 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  28.48 
 
 		 491 aa  119  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  25.43 
 
 		 441 aa  117  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  25.8 
 
 		 455 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  27 
 
 		 506 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2065  tryptophan halogenase  29.81 
 
 		 439 aa  110  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  26.48 
 
 		 413 aa  109  7.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  27.33 
 
 		 507 aa  103  7e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2048  putative tryptophan halogenase  27.76 
 
 		 480 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826968  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1005  FAD binding domain-containing protein  27.76 
 
 		 480 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0347975  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2240  alkylhalidase  27.76 
 
 		 480 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345155  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2103  putative tryptophan halogenase  27.76 
 
 		 480 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0674783  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  28.1 
 
 		 495 aa  97.4  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10884  conserved hypothetical protein  25.94 
 
 		 647 aa  94.7  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  28.36 
 
 		 384 aa  85.9  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5510  tryptophan halogenase  22.91 
 
 		 587 aa  83.2  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3158  tryptophan halogenase  24.76 
 
 		 584 aa  80.1  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000257719 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  24.18 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02880  halogenase  22.93 
 
 		 540 aa  76.6  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  23.59 
 
 		 435 aa  76.3  0.0000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  23.31 
 
 		 424 aa  76.3  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  25.3 
 
 		 423 aa  73.2  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0260  monooxygenase FAD-binding  23.02 
 
 		 568 aa  72.4  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.958147  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  23.9 
 
 		 423 aa  72.8  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2887  halogenase PrnC  25.63 
 
 		 566 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.939862  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1117  PrnC  25.63 
 
 		 566 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  25.71 
 
 		 382 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2735  halogenase PrnC  25.63 
 
 		 566 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5266  FAD dependent oxidoreductase  26.04 
 
 		 566 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  21.95 
 
 		 413 aa  70.1  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  21.71 
 
 		 425 aa  69.7  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4728  FAD dependent oxidoreductase  25.69 
 
 		 566 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  24.16 
 
 		 434 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6985  FAD dependent oxidoreductase  26.24 
 
 		 566 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176502  normal  0.543352 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5928  FAD dependent oxidoreductase  23.58 
 
 		 515 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00202441  hitchhiker  0.00883605 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  21.9 
 
 		 445 aa  69.7  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6708  FAD dependent oxidoreductase  25.63 
 
 		 566 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3552  FAD dependent oxidoreductase  24.03 
 
 		 563 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  20.19 
 
 		 398 aa  66.6  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  23.26 
 
 		 395 aa  65.1  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2756  tryptophan halogenase  23.51 
 
 		 618 aa  64.3  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  22.71 
 
 		 398 aa  62.8  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  22.69 
 
 		 398 aa  62.4  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1260  FAD dependent oxidoreductase  28.09 
 
 		 438 aa  62.8  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  23.65 
 
 		 457 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  21.43 
 
 		 431 aa  61.2  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>