187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5510 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5510  tryptophan halogenase  100 
 
 		 587 aa  1173    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  31.69 
 
 		 470 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  31 
 
 		 413 aa  172  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  32.31 
 
 		 495 aa  167  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  33.24 
 
 		 449 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  31.17 
 
 		 444 aa  164  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  30.81 
 
 		 444 aa  161  3e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  31.93 
 
 		 439 aa  158  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  31.93 
 
 		 439 aa  158  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  32.7 
 
 		 455 aa  154  5e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  30.98 
 
 		 480 aa  154  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  32.39 
 
 		 491 aa  151  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3311  tryptophan halogenase  32.7 
 
 		 449 aa  150  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  32.52 
 
 		 507 aa  150  5e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  32.37 
 
 		 445 aa  150  8e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  31.71 
 
 		 455 aa  149  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  29.19 
 
 		 506 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1005  FAD binding domain-containing protein  31.65 
 
 		 480 aa  141  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0347975  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2240  alkylhalidase  31.65 
 
 		 480 aa  141  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345155  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2103  putative tryptophan halogenase  31.65 
 
 		 480 aa  141  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0674783  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2048  putative tryptophan halogenase  31.39 
 
 		 480 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826968  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10884  conserved hypothetical protein  28.76 
 
 		 647 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  30.75 
 
 		 444 aa  129  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  28.93 
 
 		 441 aa  126  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  29.35 
 
 		 461 aa  124  6e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3116  tryptophan halogenase  29.94 
 
 		 417 aa  123  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3898  tryptophan halogenase  29.54 
 
 		 429 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3158  tryptophan halogenase  26.15 
 
 		 584 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000257719 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1615  dehydrogenase  28.81 
 
 		 405 aa  117  6.9999999999999995e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  28.93 
 
 		 422 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  25.38 
 
 		 455 aa  115  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  31.49 
 
 		 419 aa  113  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  31.49 
 
 		 419 aa  113  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3913  monooxygenase FAD-binding  29.25 
 
 		 416 aa  113  9e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2756  tryptophan halogenase  27.13 
 
 		 618 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1497  tryptophan halogenase  28.93 
 
 		 406 aa  112  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.756039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2065  tryptophan halogenase  26.16 
 
 		 439 aa  110  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2108  FAD dependent oxidoreductase  25.25 
 
 		 413 aa  108  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4606  tryptophan halogenase  28.69 
 
 		 420 aa  109  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0428  FAD dependent oxidoreductase  29.86 
 
 		 410 aa  107  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25324  normal  0.196339 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  28.93 
 
 		 435 aa  107  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0428  monooxygenase, FAD-binding  28.18 
 
 		 415 aa  107  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00208516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  28.37 
 
 		 435 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004059  FAD-binding protein inferred for ABFAE pathway  28.89 
 
 		 414 aa  105  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  30.73 
 
 		 409 aa  105  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0315  tryptophan halogenase  27.91 
 
 		 420 aa  105  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4378  FAD-binding protein  29.13 
 
 		 436 aa  104  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  30.08 
 
 		 416 aa  104  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0331  monooxygenase, FAD-binding  28.65 
 
 		 435 aa  104  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  26.09 
 
 		 409 aa  103  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2003  tryptophan halogenase  26.05 
 
 		 415 aa  103  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.923769 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2756  FAD dependent oxidoreductase  30.92 
 
 		 417 aa  102  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.471979  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  27.05 
 
 		 429 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  27.05 
 
 		 429 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  26.87 
 
 		 429 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  27.05 
 
 		 429 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  27.63 
 
 		 424 aa  101  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3521  tryptophan halogenase  29.7 
 
 		 424 aa  101  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.956189  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  27.9 
 
 		 415 aa  100  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00759  putative oxidoreductase protein  30.08 
 
 		 419 aa  98.2  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  0.0681702 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1863  tryptophan halogenase  27.3 
 
 		 415 aa  97.8  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01623  conserved hypothetical protein  26.61 
 
 		 476 aa  95.1  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.282796 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4091  tryptophan halogenase  28.73 
 
 		 415 aa  95.1  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3616  tryptophan halogenase  27.9 
 
 		 415 aa  94.4  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.190224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2822  flavoprotein/dehydrogenase  26.2 
 
 		 413 aa  94  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  25.91 
 
 		 429 aa  92.8  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5621  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  29.58 
 
 		 409 aa  90.9  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0135  tryptophan halogenase  24.43 
 
 		 417 aa  88.2  4e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0318  dehydrogenases (flavoproteins)-like  22.37 
 
 		 482 aa  84.7  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.331589 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02880  halogenase  27.27 
 
 		 540 aa  81.6  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03920  Monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:Tryptophanhalogenase  24.29 
 
 		 415 aa  81.6  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.117201  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3046  tryptophan halogenase  28.73 
 
 		 414 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354433  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0945  putative oxidoreductase  28.73 
 
 		 414 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.183705  normal  0.443912 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  23.37 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2083  FAD dependent oxidoreductase  26.22 
 
 		 344 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1110  tryptophan halogenase  22.64 
 
 		 416 aa  70.5  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1021  FAD dependent oxidoreductase  27.9 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  26.64 
 
 		 424 aa  70.5  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  26.24 
 
 		 411 aa  68.6  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  23.31 
 
 		 384 aa  66.6  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2072  FAD dependent oxidoreductase  27.41 
 
 		 511 aa  63.9  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0993  FAD dependent oxidoreductase  24.06 
 
 		 696 aa  62.4  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5928  FAD dependent oxidoreductase  24.03 
 
 		 515 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00202441  hitchhiker  0.00883605 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0291  FAD dependent oxidoreductase  25.45 
 
 		 361 aa  62.8  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  27.47 
 
 		 398 aa  62.4  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  26.51 
 
 		 434 aa  62  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  26.98 
 
 		 425 aa  62  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  26.45 
 
 		 378 aa  61.6  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  21.85 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0437  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 		 549 aa  60.1  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2626  monooxygenase FAD-binding  22.82 
 
 		 356 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  25.06 
 
 		 445 aa  59.7  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  24.35 
 
 		 409 aa  59.3  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  25.17 
 
 		 430 aa  58.9  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  29.34 
 
 		 419 aa  58.5  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  24.29 
 
 		 425 aa  57.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4493  monooxygenase FAD-binding  23.31 
 
 		 488 aa  57.8  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575117  normal  0.0380746 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 457 aa  57.4  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  23.7 
 
 		 434 aa  56.6  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6353  FAD dependent oxidoreductase  23.37 
 
 		 606 aa  56.6  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000576963 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>