146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1021 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1021  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 392 aa  780    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3720  FAD dependent oxidoreductase  32.43 
 
 		 372 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288954 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2626  monooxygenase FAD-binding  30.45 
 
 		 356 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3477  dehydrogenase (flavoprotein)  30.66 
 
 		 356 aa  146  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00015718  normal  0.0486362 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0318  dehydrogenases (flavoproteins)-like  28.02 
 
 		 482 aa  145  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.331589 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3529  monooxygenase FAD-binding  32.05 
 
 		 409 aa  121  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174105  decreased coverage  0.00232713 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2641  monooxygenase, FAD-binding  30.73 
 
 		 401 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0291  FAD dependent oxidoreductase  28.93 
 
 		 361 aa  110  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5262  hypothetical protein  30.77 
 
 		 366 aa  99.8  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4289  monooxygenase FAD-binding  25.74 
 
 		 372 aa  92  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  25.91 
 
 		 470 aa  86.7  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0828  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 		 356 aa  85.9  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.491479  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5510  tryptophan halogenase  27.36 
 
 		 587 aa  85.5  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2750  Dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  33.04 
 
 		 366 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.589907  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4493  monooxygenase FAD-binding  25.47 
 
 		 488 aa  80.5  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575117  normal  0.0380746 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1705  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 366 aa  73.6  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  27.65 
 
 		 455 aa  73.6  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  26.37 
 
 		 416 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  25.7 
 
 		 480 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3898  tryptophan halogenase  24.53 
 
 		 429 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  26.75 
 
 		 419 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  26.01 
 
 		 413 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  26.75 
 
 		 419 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  26.27 
 
 		 461 aa  69.3  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  24.42 
 
 		 444 aa  67.8  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2048  putative tryptophan halogenase  29.26 
 
 		 480 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826968  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  27.62 
 
 		 444 aa  67.4  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1005  FAD binding domain-containing protein  28.82 
 
 		 480 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0347975  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2240  alkylhalidase  28.82 
 
 		 480 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345155  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2103  putative tryptophan halogenase  28.82 
 
 		 480 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0674783  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  26.57 
 
 		 449 aa  66.2  0.0000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  24.81 
 
 		 429 aa  65.9  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  26.49 
 
 		 441 aa  64.3  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  24.34 
 
 		 507 aa  64.7  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  27.05 
 
 		 455 aa  64.3  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  28.31 
 
 		 445 aa  64.3  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  25.47 
 
 		 429 aa  63.2  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  25.47 
 
 		 429 aa  62.8  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  25.54 
 
 		 429 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4091  tryptophan halogenase  27.15 
 
 		 415 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  27.06 
 
 		 491 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  25.47 
 
 		 429 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0315  tryptophan halogenase  23.48 
 
 		 420 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0331  monooxygenase, FAD-binding  24.94 
 
 		 435 aa  60.5  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  24.59 
 
 		 422 aa  59.7  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3616  tryptophan halogenase  26.89 
 
 		 415 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.190224  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4378  FAD-binding protein  24.87 
 
 		 436 aa  58.9  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  25.75 
 
 		 506 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  26.93 
 
 		 444 aa  59.7  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  28.06 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  24.68 
 
 		 435 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  22.41 
 
 		 409 aa  58.9  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3158  tryptophan halogenase  23.23 
 
 		 584 aa  57.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000257719 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2756  tryptophan halogenase  23.58 
 
 		 618 aa  57  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  24.42 
 
 		 435 aa  57.4  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  23.98 
 
 		 439 aa  56.6  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  24.59 
 
 		 424 aa  57  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  23.98 
 
 		 439 aa  56.6  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0945  putative oxidoreductase  25.33 
 
 		 414 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.183705  normal  0.443912 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3046  tryptophan halogenase  25.59 
 
 		 414 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354433  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  25.12 
 
 		 495 aa  56.2  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  24.82 
 
 		 398 aa  55.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3521  tryptophan halogenase  24.3 
 
 		 424 aa  55.1  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.956189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4606  tryptophan halogenase  28.68 
 
 		 420 aa  55.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1090  bacteriochlorophyll synthase 43 kDa subunit  24 
 
 		 385 aa  54.7  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2003  tryptophan halogenase  25.28 
 
 		 415 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.923769 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4276  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  32.78 
 
 		 434 aa  53.9  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0428  FAD dependent oxidoreductase  26.38 
 
 		 410 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25324  normal  0.196339 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6678  tryptophan halogenase  25.65 
 
 		 506 aa  53.5  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05841  NAD binding site  21.15 
 
 		 377 aa  53.1  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2948  monooxygenase FAD-binding  27.01 
 
 		 430 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284077  normal  0.479686 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3913  monooxygenase FAD-binding  25.15 
 
 		 416 aa  52.8  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445041  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03920  Monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:Tryptophanhalogenase  22.54 
 
 		 415 aa  52.8  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.117201  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004059  FAD-binding protein inferred for ABFAE pathway  21.89 
 
 		 414 aa  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3311  tryptophan halogenase  27.55 
 
 		 449 aa  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  24.48 
 
 		 455 aa  51.6  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3185  monooxygenase FAD-binding  25.25 
 
 		 442 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304651  hitchhiker  0.000303065 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  28.57 
 
 		 380 aa  51.6  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1512  FAD dependent oxidoreductase  29.44 
 
 		 365 aa  51.2  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.193117  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1725  monooxygenase, FAD-binding  26.45 
 
 		 442 aa  51.2  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.847315  normal  0.600174 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  29.17 
 
 		 379 aa  50.4  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0636  glucose-inhibited division protein A  22.22 
 
 		 395 aa  50.1  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.779451  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1863  tryptophan halogenase  21.45 
 
 		 415 aa  50.1  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0428  monooxygenase, FAD-binding  22.87 
 
 		 415 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00208516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2979  aromatic-ring hydroxylase  25.82 
 
 		 434 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  24.69 
 
 		 384 aa  49.7  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  28.34 
 
 		 384 aa  49.7  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2304  FAD dependent oxidoreductase  26.64 
 
 		 430 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.721165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1615  dehydrogenase  23.05 
 
 		 405 aa  48.9  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4211  monooxygenase FAD-binding  32.76 
 
 		 429 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747744  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  23.17 
 
 		 415 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  27 
 
 		 380 aa  48.9  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0574  FAD dependent oxidoreductase  30.53 
 
 		 429 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0590  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.39 
 
 		 407 aa  48.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00186747  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0759  hypothetical protein  26.72 
 
 		 447 aa  48.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  28.74 
 
 		 409 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  23.14 
 
 		 409 aa  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  32.57 
 
 		 386 aa  48.1  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  25.6 
 
 		 376 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1110  tryptophan halogenase  21.75 
 
 		 416 aa  47.8  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>