More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3702 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS00759  putative oxidoreductase protein  84.48 
 
 		 419 aa  700    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  0.0681702 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3046  tryptophan halogenase  78.24 
 
 		 414 aa  653    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354433  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0945  putative oxidoreductase  79.55 
 
 		 414 aa  653    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.183705  normal  0.443912 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  80 
 
 		 416 aa  676    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 		 419 aa  860    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 		 419 aa  860    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4091  tryptophan halogenase  72.17 
 
 		 415 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3616  tryptophan halogenase  72.41 
 
 		 415 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.190224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  61.82 
 
 		 409 aa  509  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5621  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  59.11 
 
 		 409 aa  486  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  53.64 
 
 		 429 aa  475  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0331  monooxygenase, FAD-binding  54.48 
 
 		 435 aa  476  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  53.64 
 
 		 429 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  53.64 
 
 		 429 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  53.16 
 
 		 429 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  54 
 
 		 435 aa  471  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  54 
 
 		 435 aa  473  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3913  monooxygenase FAD-binding  56.34 
 
 		 416 aa  472  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445041  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4378  FAD-binding protein  54.46 
 
 		 436 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  52.64 
 
 		 429 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3898  tryptophan halogenase  53.51 
 
 		 429 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  54.73 
 
 		 424 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  53.53 
 
 		 422 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3521  tryptophan halogenase  52.12 
 
 		 424 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.956189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  53.48 
 
 		 409 aa  452  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4606  tryptophan halogenase  51.82 
 
 		 420 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0428  monooxygenase, FAD-binding  54.77 
 
 		 415 aa  451  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00208516  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  53.68 
 
 		 415 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0315  tryptophan halogenase  50.12 
 
 		 420 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1497  tryptophan halogenase  55.72 
 
 		 406 aa  438  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.756039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2108  FAD dependent oxidoreductase  52.87 
 
 		 413 aa  437  1e-121  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0428  FAD dependent oxidoreductase  54.7 
 
 		 410 aa  430  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25324  normal  0.196339 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004059  FAD-binding protein inferred for ABFAE pathway  51.34 
 
 		 414 aa  429  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1615  dehydrogenase  52.12 
 
 		 405 aa  402  1e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2756  FAD dependent oxidoreductase  54.69 
 
 		 417 aa  400  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.471979  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2822  flavoprotein/dehydrogenase  42.44 
 
 		 413 aa  341  1e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1863  tryptophan halogenase  41.07 
 
 		 415 aa  332  5e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03920  Monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:Tryptophanhalogenase  39.51 
 
 		 415 aa  317  2e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.117201  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2003  tryptophan halogenase  38.24 
 
 		 415 aa  315  7e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.923769 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0135  tryptophan halogenase  38.79 
 
 		 417 aa  303  3.0000000000000004e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1110  tryptophan halogenase  36.73 
 
 		 416 aa  281  2e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  32.77 
 
 		 461 aa  182  9.000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  32.73 
 
 		 455 aa  181  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  32.92 
 
 		 444 aa  178  1e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  31.77 
 
 		 439 aa  176  6e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  31.77 
 
 		 439 aa  176  6e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  30.69 
 
 		 444 aa  172  7.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3311  tryptophan halogenase  33.91 
 
 		 449 aa  170  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  32.04 
 
 		 441 aa  165  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  31.76 
 
 		 445 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  31.46 
 
 		 449 aa  162  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  31.06 
 
 		 455 aa  157  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  29.72 
 
 		 444 aa  156  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  33.24 
 
 		 491 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  30.41 
 
 		 495 aa  140  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  26.96 
 
 		 455 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  30.56 
 
 		 413 aa  136  7.000000000000001e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  33.54 
 
 		 507 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  32.55 
 
 		 470 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  30.9 
 
 		 480 aa  133  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3116  tryptophan halogenase  32.33 
 
 		 417 aa  127  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  29.2 
 
 		 506 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1005  FAD binding domain-containing protein  31.28 
 
 		 480 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0347975  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2240  alkylhalidase  31.28 
 
 		 480 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345155  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2103  putative tryptophan halogenase  31.28 
 
 		 480 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0674783  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2048  putative tryptophan halogenase  31.01 
 
 		 480 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826968  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2065  tryptophan halogenase  31.86 
 
 		 439 aa  116  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5510  tryptophan halogenase  31.49 
 
 		 587 aa  113  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  26.81 
 
 		 398 aa  91.7  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10884  conserved hypothetical protein  26.51 
 
 		 647 aa  90.1  6e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6353  FAD dependent oxidoreductase  26.17 
 
 		 606 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000576963 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2756  tryptophan halogenase  27.39 
 
 		 618 aa  87.4  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3158  tryptophan halogenase  26.52 
 
 		 584 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000257719 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3185  monooxygenase FAD-binding  30.55 
 
 		 442 aa  81.3  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304651  hitchhiker  0.000303065 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1725  monooxygenase, FAD-binding  30.37 
 
 		 442 aa  79.7  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.847315  normal  0.600174 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  24.73 
 
 		 384 aa  79  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5928  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 		 515 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00202441  hitchhiker  0.00883605 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6985  FAD dependent oxidoreductase  25.43 
 
 		 566 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176502  normal  0.543352 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2072  FAD dependent oxidoreductase  28.35 
 
 		 511 aa  75.1  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2641  monooxygenase, FAD-binding  27.88 
 
 		 401 aa  74.7  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5266  FAD dependent oxidoreductase  25.5 
 
 		 566 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1117  PrnC  25.5 
 
 		 566 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2887  halogenase PrnC  25.5 
 
 		 566 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.939862  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6708  FAD dependent oxidoreductase  25.5 
 
 		 566 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  28.35 
 
 		 423 aa  73.6  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4728  FAD dependent oxidoreductase  25.25 
 
 		 566 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2735  halogenase PrnC  25.25 
 
 		 566 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4493  monooxygenase FAD-binding  26.59 
 
 		 488 aa  72  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575117  normal  0.0380746 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  26.52 
 
 		 457 aa  70.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  27.2 
 
 		 423 aa  70.9  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4239  monooxygenase FAD-binding  26.8 
 
 		 407 aa  70.5  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  24.85 
 
 		 382 aa  70.9  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  24.71 
 
 		 426 aa  70.1  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  30.21 
 
 		 375 aa  69.7  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  26.28 
 
 		 418 aa  69.3  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3109  monooxygenase FAD-binding  25.85 
 
 		 444 aa  69.7  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  25.29 
 
 		 413 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1150  monooxygenase FAD-binding protein  24.31 
 
 		 397 aa  68.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.862466  normal  0.995827 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02880  halogenase  24.72 
 
 		 540 aa  68.6  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0260  monooxygenase FAD-binding  26.14 
 
 		 568 aa  67.8  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.958147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>