290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2003 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2003  tryptophan halogenase  100 
 
 		 415 aa  860    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.923769 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2822  flavoprotein/dehydrogenase  53.17 
 
 		 413 aa  444  1e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1863  tryptophan halogenase  49.75 
 
 		 415 aa  412  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0135  tryptophan halogenase  48.77 
 
 		 417 aa  404  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03920  Monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:Tryptophanhalogenase  48.15 
 
 		 415 aa  396  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.117201  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1110  tryptophan halogenase  48.18 
 
 		 416 aa  390  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  42.72 
 
 		 422 aa  349  5e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5621  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  41.75 
 
 		 409 aa  349  7e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  41.99 
 
 		 429 aa  345  6e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  41.99 
 
 		 429 aa  345  7e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  41.99 
 
 		 429 aa  345  1e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  41.35 
 
 		 415 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2108  FAD dependent oxidoreductase  41.63 
 
 		 413 aa  343  4e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  41.83 
 
 		 429 aa  342  5e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0428  monooxygenase, FAD-binding  41.35 
 
 		 415 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00208516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  41.09 
 
 		 429 aa  335  1e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  42.79 
 
 		 409 aa  333  5e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004059  FAD-binding protein inferred for ABFAE pathway  39.56 
 
 		 414 aa  333  5e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  41.13 
 
 		 435 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3898  tryptophan halogenase  42.64 
 
 		 429 aa  331  1e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4606  tryptophan halogenase  40.2 
 
 		 420 aa  331  1e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  40.1 
 
 		 409 aa  331  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0331  monooxygenase, FAD-binding  41.06 
 
 		 435 aa  330  2e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4378  FAD-binding protein  40.99 
 
 		 436 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  40.58 
 
 		 435 aa  329  6e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3521  tryptophan halogenase  39.56 
 
 		 424 aa  323  2e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.956189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  40.25 
 
 		 424 aa  322  5e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0428  FAD dependent oxidoreductase  39.36 
 
 		 410 aa  318  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25324  normal  0.196339 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  38.24 
 
 		 419 aa  315  7e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  38.24 
 
 		 419 aa  315  7e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0315  tryptophan halogenase  38.44 
 
 		 420 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  39.07 
 
 		 416 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3913  monooxygenase FAD-binding  39.95 
 
 		 416 aa  313  4.999999999999999e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1615  dehydrogenase  41.15 
 
 		 405 aa  310  4e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4091  tryptophan halogenase  39.75 
 
 		 415 aa  305  7e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1497  tryptophan halogenase  38.82 
 
 		 406 aa  305  1.0000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.756039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3616  tryptophan halogenase  39.75 
 
 		 415 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.190224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0945  putative oxidoreductase  41.65 
 
 		 414 aa  296  6e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.183705  normal  0.443912 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3046  tryptophan halogenase  41.65 
 
 		 414 aa  294  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354433  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_003296  RS00759  putative oxidoreductase protein  38.73 
 
 		 419 aa  293  6e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  0.0681702 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2756  FAD dependent oxidoreductase  38.27 
 
 		 417 aa  288  1e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.471979  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  29.48 
 
 		 439 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  29.48 
 
 		 439 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  28.87 
 
 		 455 aa  160  3e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  30.2 
 
 		 444 aa  157  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  34.32 
 
 		 470 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  29.31 
 
 		 461 aa  156  6e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  29.41 
 
 		 445 aa  156  7e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  29.66 
 
 		 444 aa  154  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3116  tryptophan halogenase  32.79 
 
 		 417 aa  151  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  28.89 
 
 		 441 aa  150  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  28.79 
 
 		 449 aa  147  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  29.7 
 
 		 480 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  28.42 
 
 		 444 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  30.75 
 
 		 413 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  33.54 
 
 		 491 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  26.99 
 
 		 455 aa  141  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  30.9 
 
 		 495 aa  140  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  32.52 
 
 		 507 aa  139  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3311  tryptophan halogenase  26.72 
 
 		 449 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2048  putative tryptophan halogenase  30.2 
 
 		 480 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826968  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1005  FAD binding domain-containing protein  30.2 
 
 		 480 aa  130  6e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0347975  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2240  alkylhalidase  30.2 
 
 		 480 aa  130  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345155  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2103  putative tryptophan halogenase  30.2 
 
 		 480 aa  130  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0674783  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2065  tryptophan halogenase  28.97 
 
 		 439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  27.52 
 
 		 506 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10884  conserved hypothetical protein  26.51 
 
 		 647 aa  108  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5510  tryptophan halogenase  26.05 
 
 		 587 aa  103  8e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  25.25 
 
 		 455 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02880  halogenase  24.32 
 
 		 540 aa  89.4  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3158  tryptophan halogenase  26.99 
 
 		 584 aa  89  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000257719 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  27.55 
 
 		 384 aa  83.2  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0260  monooxygenase FAD-binding  26.17 
 
 		 568 aa  82.8  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.958147  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  24.87 
 
 		 430 aa  79.7  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  23.91 
 
 		 435 aa  78.2  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  25.83 
 
 		 424 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  22.77 
 
 		 398 aa  77.4  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  28.11 
 
 		 424 aa  74.7  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0291  FAD dependent oxidoreductase  24.32 
 
 		 361 aa  74.7  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  23.63 
 
 		 457 aa  73.6  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2756  tryptophan halogenase  26.29 
 
 		 618 aa  73.6  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  23.04 
 
 		 423 aa  73.2  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5266  FAD dependent oxidoreductase  22.98 
 
 		 566 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  23.76 
 
 		 384 aa  72  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4728  FAD dependent oxidoreductase  22.72 
 
 		 566 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  24.56 
 
 		 426 aa  70.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  22.71 
 
 		 425 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  23.51 
 
 		 423 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  23.35 
 
 		 431 aa  68.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  24.27 
 
 		 431 aa  67.8  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1117  PrnC  22.11 
 
 		 566 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6708  FAD dependent oxidoreductase  22.45 
 
 		 566 aa  67  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2887  halogenase PrnC  22.11 
 
 		 566 aa  67  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.939862  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  23.03 
 
 		 423 aa  67.4  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2735  halogenase PrnC  22.11 
 
 		 566 aa  67  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6353  FAD dependent oxidoreductase  23.51 
 
 		 606 aa  67  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000576963 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5928  FAD dependent oxidoreductase  24.32 
 
 		 515 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00202441  hitchhiker  0.00883605 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  20.83 
 
 		 413 aa  66.6  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  23.24 
 
 		 445 aa  65.9  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3131  geranylgeranyl reductase  29.58 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>