More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3116 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3116  tryptophan halogenase  100 
 
 		 417 aa  861    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  38.67 
 
 		 413 aa  244  3e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  34.56 
 
 		 444 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  34.36 
 
 		 441 aa  210  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  37.64 
 
 		 470 aa  205  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  36.86 
 
 		 455 aa  203  5e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  34.95 
 
 		 444 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  36.45 
 
 		 445 aa  200  3e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  33.96 
 
 		 506 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  36.56 
 
 		 444 aa  196  6e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  35.67 
 
 		 439 aa  192  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  35.67 
 
 		 439 aa  192  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  35.78 
 
 		 491 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  33.16 
 
 		 455 aa  187  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  34.05 
 
 		 461 aa  187  4e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  35.47 
 
 		 449 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  32.29 
 
 		 480 aa  182  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  36.84 
 
 		 507 aa  179  8e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  33 
 
 		 429 aa  176  8e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2003  tryptophan halogenase  32.79 
 
 		 415 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.923769 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  33.17 
 
 		 429 aa  173  5e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  33.33 
 
 		 429 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  33.08 
 
 		 429 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  33.78 
 
 		 495 aa  171  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  30.16 
 
 		 422 aa  171  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  33.33 
 
 		 429 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2065  tryptophan halogenase  34.63 
 
 		 439 aa  171  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3311  tryptophan halogenase  32.23 
 
 		 449 aa  170  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  33.75 
 
 		 435 aa  170  4e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0331  monooxygenase, FAD-binding  33.75 
 
 		 435 aa  170  4e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2048  putative tryptophan halogenase  33.66 
 
 		 480 aa  169  9e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826968  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  33.25 
 
 		 435 aa  169  9e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  31.33 
 
 		 415 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2240  alkylhalidase  33.41 
 
 		 480 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345155  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1005  FAD binding domain-containing protein  33.41 
 
 		 480 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0347975  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2103  putative tryptophan halogenase  33.41 
 
 		 480 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0674783  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  32.05 
 
 		 424 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0428  monooxygenase, FAD-binding  31.07 
 
 		 415 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00208516  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4378  FAD-binding protein  33.59 
 
 		 436 aa  162  7e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1863  tryptophan halogenase  30.77 
 
 		 415 aa  162  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4606  tryptophan halogenase  30.46 
 
 		 420 aa  160  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3913  monooxygenase FAD-binding  31.38 
 
 		 416 aa  159  6e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  32.17 
 
 		 409 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3898  tryptophan halogenase  28.91 
 
 		 429 aa  155  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004059  FAD-binding protein inferred for ABFAE pathway  30.38 
 
 		 414 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1497  tryptophan halogenase  30.98 
 
 		 406 aa  154  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.756039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1110  tryptophan halogenase  31.25 
 
 		 416 aa  152  8.999999999999999e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2822  flavoprotein/dehydrogenase  30.1 
 
 		 413 aa  152  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  33.96 
 
 		 419 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  33.96 
 
 		 419 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0135  tryptophan halogenase  29.54 
 
 		 417 aa  150  3e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0315  tryptophan halogenase  30.31 
 
 		 420 aa  150  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  31.34 
 
 		 416 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  26.1 
 
 		 455 aa  145  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  29.86 
 
 		 409 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3521  tryptophan halogenase  29.82 
 
 		 424 aa  144  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.956189  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03920  Monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:Tryptophanhalogenase  30.48 
 
 		 415 aa  144  4e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.117201  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5621  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  30.1 
 
 		 409 aa  143  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0428  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 		 410 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25324  normal  0.196339 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2108  FAD dependent oxidoreductase  27.88 
 
 		 413 aa  140  4.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5510  tryptophan halogenase  30.64 
 
 		 587 aa  137  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1615  dehydrogenase  29.92 
 
 		 405 aa  137  4e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10884  conserved hypothetical protein  30.12 
 
 		 647 aa  135  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_003296  RS00759  putative oxidoreductase protein  31.32 
 
 		 419 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  0.0681702 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4091  tryptophan halogenase  32.18 
 
 		 415 aa  126  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3616  tryptophan halogenase  31.37 
 
 		 415 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.190224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3046  tryptophan halogenase  31.7 
 
 		 414 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354433  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0945  putative oxidoreductase  31.12 
 
 		 414 aa  122  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.183705  normal  0.443912 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2756  FAD dependent oxidoreductase  29.11 
 
 		 417 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.471979  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2756  tryptophan halogenase  30.82 
 
 		 618 aa  117  5e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3158  tryptophan halogenase  31.49 
 
 		 584 aa  116  6e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000257719 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01623  conserved hypothetical protein  28.06 
 
 		 476 aa  109  8.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.282796 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  27.63 
 
 		 435 aa  102  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3552  FAD dependent oxidoreductase  27.06 
 
 		 563 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  26.14 
 
 		 431 aa  100  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  27.03 
 
 		 434 aa  98.2  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  25.89 
 
 		 398 aa  98.2  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  25.72 
 
 		 423 aa  97.1  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  26.01 
 
 		 384 aa  96.7  7e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  28.22 
 
 		 431 aa  95.9  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  28.03 
 
 		 445 aa  94.4  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3959  monooxygenase FAD-binding  29.09 
 
 		 411 aa  92  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  26.12 
 
 		 418 aa  91.3  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3185  monooxygenase FAD-binding  28.45 
 
 		 442 aa  88.6  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304651  hitchhiker  0.000303065 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  27.11 
 
 		 424 aa  88.6  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  25.9 
 
 		 430 aa  88.2  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  25.73 
 
 		 376 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02880  halogenase  28.32 
 
 		 540 aa  85.9  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  25.8 
 
 		 425 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1725  monooxygenase, FAD-binding  28.11 
 
 		 442 aa  84  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.847315  normal  0.600174 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2826  geranylgeranyl reductase  28.68 
 
 		 443 aa  84  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0858816 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  28.48 
 
 		 398 aa  83.6  0.000000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  28.24 
 
 		 426 aa  83.2  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2934  monooxygenase, FAD-binding  28.92 
 
 		 402 aa  83.2  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1150  monooxygenase FAD-binding protein  28.34 
 
 		 397 aa  82  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.862466  normal  0.995827 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2294  monooxygenase, FAD-binding  28.49 
 
 		 407 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.539275  hitchhiker  0.00707471 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  24.94 
 
 		 398 aa  81.6  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3109  monooxygenase FAD-binding  27.35 
 
 		 444 aa  80.9  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0668  geranylgeranyl reductase  24.02 
 
 		 458 aa  79.7  0.00000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.159483  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2083  FAD dependent oxidoreductase  30.16 
 
 		 344 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>