More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1273 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 457 aa  927    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  73.51 
 
 		 423 aa  631  1e-180  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  72.55 
 
 		 423 aa  627  1e-178  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  61.83 
 
 		 423 aa  541  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  60.64 
 
 		 435 aa  530  1e-149  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  62.47 
 
 		 434 aa  527  1e-148  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  59.86 
 
 		 434 aa  509  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  59.43 
 
 		 418 aa  501  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  60.37 
 
 		 425 aa  500  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  60.47 
 
 		 426 aa  498  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  62.44 
 
 		 440 aa  499  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  60 
 
 		 424 aa  496  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  57.54 
 
 		 445 aa  486  1e-136  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  56.31 
 
 		 431 aa  478  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  58.89 
 
 		 430 aa  476  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  59.95 
 
 		 424 aa  477  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  54.23 
 
 		 430 aa  456  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07370  geranylgeranyl reductase family protein  55.04 
 
 		 431 aa  436  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0284516 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  53 
 
 		 419 aa  429  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  52.13 
 
 		 443 aa  426  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  51.76 
 
 		 431 aa  427  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2826  geranylgeranyl reductase  52 
 
 		 443 aa  406  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0858816 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3131  geranylgeranyl reductase  48.95 
 
 		 444 aa  388  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17730  geranylgeranyl reductase family protein  44.74 
 
 		 466 aa  338  9.999999999999999e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0362  geranylgeranyl reductase  34.53 
 
 		 436 aa  213  5.999999999999999e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.495463  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  34.68 
 
 		 393 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  34.95 
 
 		 393 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  37.66 
 
 		 413 aa  178  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1826  geranylgeranyl reductase  34.01 
 
 		 393 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1873  geranylgeranyl reductase  34.01 
 
 		 393 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5254  geranylgeranyl reductase  31.5 
 
 		 416 aa  160  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1807  geranylgeranyl reductase  33.72 
 
 		 393 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10571  oxidoreductase  30.63 
 
 		 408 aa  159  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.649109  normal  0.274108 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0784  geranylgeranyl reductase  32.68 
 
 		 406 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0765  geranylgeranyl reductase  32.68 
 
 		 406 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.616022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0770  geranylgeranyl reductase  30.55 
 
 		 400 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1099  geranylgeranyl reductase  34.38 
 
 		 435 aa  154  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.997696  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1294  geranylgeranyl reductase  36.09 
 
 		 420 aa  154  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.730528  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0948  geranylgeranyl reductase  32.77 
 
 		 417 aa  153  5e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.3862  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  30.24 
 
 		 384 aa  151  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0991  geranylgeranyl reductase  29.02 
 
 		 418 aa  152  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0714  geranylgeranyl reductase  33.91 
 
 		 415 aa  143  6e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  32.36 
 
 		 411 aa  143  6e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  32.62 
 
 		 398 aa  129  7.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  28.68 
 
 		 376 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  30.57 
 
 		 414 aa  125  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  31.59 
 
 		 425 aa  123  7e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0830  geranylgeranyl reductase  29.35 
 
 		 415 aa  117  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0164  putative electron transfer oxidoreductase  33.33 
 
 		 420 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.762503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  27.3 
 
 		 398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  31.34 
 
 		 375 aa  114  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  30.25 
 
 		 409 aa  111  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5969  geranylgeranyl reductase  30.59 
 
 		 409 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.365894  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  31.08 
 
 		 379 aa  109  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  28.88 
 
 		 387 aa  107  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  30.91 
 
 		 453 aa  106  1e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1161  geranylgeranyl reductase  34.27 
 
 		 429 aa  105  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  29.5 
 
 		 385 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  29.12 
 
 		 382 aa  104  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  26.74 
 
 		 402 aa  102  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  31.14 
 
 		 384 aa  101  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  30.84 
 
 		 406 aa  99.8  9e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  26.05 
 
 		 455 aa  98.2  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  29.63 
 
 		 452 aa  97.1  5e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  26.36 
 
 		 390 aa  96.3  9e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  27.75 
 
 		 408 aa  95.1  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  25.89 
 
 		 398 aa  94.7  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  27.71 
 
 		 403 aa  94.4  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0808  geranylgeranyl reductase  32.69 
 
 		 406 aa  93.6  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.967973  hitchhiker  0.000310699 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2702  geranylgeranyl reductase  31.18 
 
 		 401 aa  92.8  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  26.2 
 
 		 449 aa  92.4  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0862  geranylgeranyl reductase  33.15 
 
 		 387 aa  92  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  27.21 
 
 		 376 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0660  geranylgeranyl reductase  28.85 
 
 		 406 aa  92  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  27.14 
 
 		 389 aa  91.7  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  30.37 
 
 		 403 aa  90.9  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  30.59 
 
 		 378 aa  89  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  28.31 
 
 		 362 aa  89  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  29.31 
 
 		 506 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3806  FAD dependent oxidoreductase  20.87 
 
 		 375 aa  88.2  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749975  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  26.36 
 
 		 370 aa  87  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1514  geranylgeranyl reductase  26.78 
 
 		 485 aa  86.7  8e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00785047 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0982  geranylgeranyl reductase  32.11 
 
 		 384 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0176875  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0084  putative oxidoreductase FixC  29.31 
 
 		 428 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0083  putative oxidoreductase FixC  28.86 
 
 		 428 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0574  FAD dependent oxidoreductase  26.98 
 
 		 429 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0083  putative oxidoreductase FixC  28.86 
 
 		 428 aa  84.7  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.715205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3556  FAD dependent oxidoreductase  29.39 
 
 		 432 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0086  putative oxidoreductase FixC  28.86 
 
 		 428 aa  84.7  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2674  FAD dependent oxidoreductase  27.23 
 
 		 443 aa  84.7  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.680206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2315  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  27.76 
 
 		 436 aa  84.3  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0377746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  26.36 
 
 		 480 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  26.63 
 
 		 390 aa  84  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  27.03 
 
 		 390 aa  83.6  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0087  putative oxidoreductase FixC  28.86 
 
 		 428 aa  83.6  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  29.52 
 
 		 362 aa  83.6  0.000000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1434  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  28.15 
 
 		 436 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000988984  normal  0.0161309 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0313  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  27.57 
 
 		 430 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.800751  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  25.82 
 
 		 390 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1330  geranylgeranyl reductase  29.43 
 
 		 376 aa  82.4  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>