285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2108 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2108  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 413 aa  861    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004059  FAD-binding protein inferred for ABFAE pathway  68.56 
 
 		 414 aa  583  1.0000000000000001e-165  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  62.44 
 
 		 429 aa  528  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  62.69 
 
 		 429 aa  529  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  62.69 
 
 		 429 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  60.88 
 
 		 429 aa  526  1e-148  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4378  FAD-binding protein  62.44 
 
 		 436 aa  526  1e-148  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  61.73 
 
 		 435 aa  525  1e-148  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  61.98 
 
 		 435 aa  526  1e-148  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  62.44 
 
 		 429 aa  527  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  61.88 
 
 		 424 aa  524  1e-147  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0331  monooxygenase, FAD-binding  61.48 
 
 		 435 aa  523  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3898  tryptophan halogenase  60.05 
 
 		 429 aa  512  1e-144  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  61.19 
 
 		 422 aa  509  1e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3521  tryptophan halogenase  60.81 
 
 		 424 aa  509  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.956189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0315  tryptophan halogenase  58.51 
 
 		 420 aa  499  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4606  tryptophan halogenase  59.36 
 
 		 420 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5621  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  55.45 
 
 		 409 aa  477  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  55.86 
 
 		 415 aa  472  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  56.44 
 
 		 409 aa  471  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0428  monooxygenase, FAD-binding  55.36 
 
 		 415 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00208516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0428  FAD dependent oxidoreductase  55.94 
 
 		 410 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25324  normal  0.196339 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3913  monooxygenase FAD-binding  54.3 
 
 		 416 aa  450  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1615  dehydrogenase  55.17 
 
 		 405 aa  447  1.0000000000000001e-124  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  53.66 
 
 		 409 aa  447  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  52.87 
 
 		 419 aa  437  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  51.71 
 
 		 416 aa  435  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  52.87 
 
 		 419 aa  437  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4091  tryptophan halogenase  51.24 
 
 		 415 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1497  tryptophan halogenase  51.49 
 
 		 406 aa  414  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.756039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3616  tryptophan halogenase  50.74 
 
 		 415 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.190224  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00759  putative oxidoreductase protein  51.09 
 
 		 419 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  0.0681702 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3046  tryptophan halogenase  50 
 
 		 414 aa  396  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354433  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0945  putative oxidoreductase  50.24 
 
 		 414 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.183705  normal  0.443912 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2756  FAD dependent oxidoreductase  46.93 
 
 		 417 aa  362  7.0000000000000005e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.471979  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2822  flavoprotein/dehydrogenase  41.48 
 
 		 413 aa  351  1e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03920  Monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:Tryptophanhalogenase  43.53 
 
 		 415 aa  346  5e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.117201  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2003  tryptophan halogenase  41.63 
 
 		 415 aa  343  4e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.923769 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1863  tryptophan halogenase  39.85 
 
 		 415 aa  327  3e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0135  tryptophan halogenase  39.45 
 
 		 417 aa  307  3e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1110  tryptophan halogenase  39.95 
 
 		 416 aa  300  3e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  29.38 
 
 		 461 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  26.87 
 
 		 439 aa  143  6e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  26.87 
 
 		 439 aa  143  6e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  27.85 
 
 		 444 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  30.26 
 
 		 480 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  27.62 
 
 		 455 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  31.55 
 
 		 507 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  30 
 
 		 444 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  29.54 
 
 		 491 aa  129  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  27.46 
 
 		 444 aa  129  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  30.3 
 
 		 470 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  26.53 
 
 		 455 aa  127  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1005  FAD binding domain-containing protein  29.47 
 
 		 480 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0347975  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2240  alkylhalidase  29.47 
 
 		 480 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345155  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2048  putative tryptophan halogenase  29.47 
 
 		 480 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826968  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2103  putative tryptophan halogenase  29.47 
 
 		 480 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0674783  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  25 
 
 		 441 aa  123  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  26.62 
 
 		 449 aa  123  7e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3116  tryptophan halogenase  27.05 
 
 		 417 aa  122  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  27.2 
 
 		 445 aa  120  6e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  29.65 
 
 		 495 aa  120  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  26.3 
 
 		 506 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  24.34 
 
 		 455 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3311  tryptophan halogenase  24.72 
 
 		 449 aa  114  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10884  conserved hypothetical protein  27.62 
 
 		 647 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5510  tryptophan halogenase  25.25 
 
 		 587 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  23.73 
 
 		 413 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2065  tryptophan halogenase  25.75 
 
 		 439 aa  96.3  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  26.87 
 
 		 398 aa  93.6  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  24.22 
 
 		 423 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0260  monooxygenase FAD-binding  24.93 
 
 		 568 aa  80.5  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.958147  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3158  tryptophan halogenase  23.88 
 
 		 584 aa  79.7  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000257719 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  24.63 
 
 		 457 aa  79.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2756  tryptophan halogenase  27.52 
 
 		 618 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  23.17 
 
 		 435 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  23.48 
 
 		 424 aa  77.8  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1298  geranylgeranyl reductase  24.57 
 
 		 369 aa  75.5  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  21.94 
 
 		 426 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  22.89 
 
 		 423 aa  73.9  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  24.13 
 
 		 425 aa  73.6  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  23.1 
 
 		 423 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02880  halogenase  24.24 
 
 		 540 aa  71.2  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6353  FAD dependent oxidoreductase  22.17 
 
 		 606 aa  70.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000576963 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5928  FAD dependent oxidoreductase  23.01 
 
 		 515 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00202441  hitchhiker  0.00883605 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  23.03 
 
 		 418 aa  69.7  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  20.77 
 
 		 434 aa  67.8  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6189  FAD dependent oxidoreductase  21.9 
 
 		 549 aa  67.8  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.386656  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  22.64 
 
 		 445 aa  67.8  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  22.73 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  20.8 
 
 		 413 aa  67  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2626  monooxygenase FAD-binding  22.79 
 
 		 356 aa  66.6  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3477  dehydrogenase (flavoprotein)  22.79 
 
 		 356 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00015718  normal  0.0486362 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2641  monooxygenase, FAD-binding  23.6 
 
 		 401 aa  65.9  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0437  FAD dependent oxidoreductase  22 
 
 		 549 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  22.13 
 
 		 411 aa  65.5  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4493  monooxygenase FAD-binding  24.8 
 
 		 488 aa  64.3  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575117  normal  0.0380746 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1901  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  23.84 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.213246 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  21.25 
 
 		 382 aa  63.2  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  23.34 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>