More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2065 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2065  tryptophan halogenase  100 
 
 		 439 aa  902    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  50 
 
 		 441 aa  411  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  35.99 
 
 		 470 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  35.01 
 
 		 413 aa  209  7e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  33.25 
 
 		 461 aa  203  5e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  35.07 
 
 		 506 aa  194  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  35.04 
 
 		 449 aa  188  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  32.56 
 
 		 455 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  33.15 
 
 		 491 aa  184  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3116  tryptophan halogenase  36.49 
 
 		 417 aa  183  7e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  34.25 
 
 		 507 aa  182  7e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  30.75 
 
 		 439 aa  179  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  30.75 
 
 		 439 aa  179  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  32.11 
 
 		 495 aa  176  6e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  29.23 
 
 		 444 aa  176  8e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  30.37 
 
 		 444 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3311  tryptophan halogenase  33.67 
 
 		 449 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  29.85 
 
 		 455 aa  174  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  31.2 
 
 		 445 aa  173  6.999999999999999e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  31.42 
 
 		 444 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  31.84 
 
 		 480 aa  168  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  32.11 
 
 		 429 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2822  flavoprotein/dehydrogenase  29.87 
 
 		 413 aa  156  7e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4606  tryptophan halogenase  31.42 
 
 		 420 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  31.48 
 
 		 435 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3898  tryptophan halogenase  28.57 
 
 		 429 aa  154  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  32.52 
 
 		 409 aa  154  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0315  tryptophan halogenase  31.17 
 
 		 420 aa  153  5e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  32.81 
 
 		 429 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  31.48 
 
 		 435 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1863  tryptophan halogenase  30.62 
 
 		 415 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2048  putative tryptophan halogenase  31.65 
 
 		 480 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826968  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  34.25 
 
 		 416 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  32.37 
 
 		 429 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  32.37 
 
 		 429 aa  150  5e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4378  FAD-binding protein  29.21 
 
 		 436 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0331  monooxygenase, FAD-binding  31.22 
 
 		 435 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10884  conserved hypothetical protein  31.76 
 
 		 647 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1005  FAD binding domain-containing protein  31.37 
 
 		 480 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0347975  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2240  alkylhalidase  31.37 
 
 		 480 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345155  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2103  putative tryptophan halogenase  31.37 
 
 		 480 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0674783  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0135  tryptophan halogenase  30.47 
 
 		 417 aa  148  2.0000000000000003e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  32.51 
 
 		 419 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  32.51 
 
 		 419 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  32.11 
 
 		 429 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  30.62 
 
 		 409 aa  147  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  30.68 
 
 		 422 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  28.24 
 
 		 424 aa  145  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3521  tryptophan halogenase  28.97 
 
 		 424 aa  143  5e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.956189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3913  monooxygenase FAD-binding  30.83 
 
 		 416 aa  142  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2003  tryptophan halogenase  28.97 
 
 		 415 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.923769 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5621  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  31.4 
 
 		 409 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1497  tryptophan halogenase  29.24 
 
 		 406 aa  137  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.756039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0428  monooxygenase, FAD-binding  29.7 
 
 		 415 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00208516  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  29.45 
 
 		 415 aa  136  8e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3616  tryptophan halogenase  31.22 
 
 		 415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.190224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004059  FAD-binding protein inferred for ABFAE pathway  28.13 
 
 		 414 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  26.04 
 
 		 455 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4091  tryptophan halogenase  31.22 
 
 		 415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3046  tryptophan halogenase  35.28 
 
 		 414 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354433  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5510  tryptophan halogenase  27.74 
 
 		 587 aa  131  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03920  Monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:Tryptophanhalogenase  28.57 
 
 		 415 aa  130  5.0000000000000004e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.117201  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1110  tryptophan halogenase  28.73 
 
 		 416 aa  129  8.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0945  putative oxidoreductase  34.83 
 
 		 414 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.183705  normal  0.443912 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0428  FAD dependent oxidoreductase  30.29 
 
 		 410 aa  127  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25324  normal  0.196339 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2756  FAD dependent oxidoreductase  31.87 
 
 		 417 aa  126  6e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.471979  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3158  tryptophan halogenase  28.72 
 
 		 584 aa  126  9e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000257719 
 
 
-
 
NC_003296  RS00759  putative oxidoreductase protein  32.97 
 
 		 419 aa  124  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  0.0681702 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2108  FAD dependent oxidoreductase  27.37 
 
 		 413 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1615  dehydrogenase  27.88 
 
 		 405 aa  117  3e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01623  conserved hypothetical protein  28.99 
 
 		 476 aa  106  8e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.282796 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2756  tryptophan halogenase  27.4 
 
 		 618 aa  102  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 398 aa  94.7  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0318  dehydrogenases (flavoproteins)-like  22.7 
 
 		 482 aa  93.2  8e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.331589 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1150  monooxygenase FAD-binding protein  27.51 
 
 		 397 aa  92.8  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.862466  normal  0.995827 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  27.75 
 
 		 418 aa  90.9  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  24.16 
 
 		 408 aa  87.4  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4493  monooxygenase FAD-binding  25.39 
 
 		 488 aa  86.7  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575117  normal  0.0380746 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  25.21 
 
 		 406 aa  84  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3556  FAD dependent oxidoreductase  28.53 
 
 		 432 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  27.19 
 
 		 411 aa  84.3  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3185  monooxygenase FAD-binding  27.86 
 
 		 442 aa  84  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304651  hitchhiker  0.000303065 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  29.81 
 
 		 425 aa  84  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3720  FAD dependent oxidoreductase  26.22 
 
 		 372 aa  83.2  0.000000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288954 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02880  halogenase  25.89 
 
 		 540 aa  83.2  0.000000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  25.79 
 
 		 395 aa  81.6  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  27.13 
 
 		 424 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  27.93 
 
 		 419 aa  80.9  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4487  monooxygenase FAD-binding  29.75 
 
 		 385 aa  79  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2083  FAD dependent oxidoreductase  26.59 
 
 		 344 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6708  FAD dependent oxidoreductase  26.96 
 
 		 566 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1725  monooxygenase, FAD-binding  27.5 
 
 		 442 aa  79  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.847315  normal  0.600174 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5266  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 		 566 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3477  dehydrogenase (flavoprotein)  25.35 
 
 		 356 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00015718  normal  0.0486362 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2626  monooxygenase FAD-binding  25.07 
 
 		 356 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4728  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 		 566 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2315  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  25.84 
 
 		 436 aa  79  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0377746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  27.12 
 
 		 425 aa  78.2  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2641  monooxygenase, FAD-binding  25.26 
 
 		 401 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  25.71 
 
 		 398 aa  77.8  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>