200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3158 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3158  tryptophan halogenase  100 
 
 		 584 aa  1207    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000257719 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2756  tryptophan halogenase  54.81 
 
 		 618 aa  629  1e-179  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  36.36 
 
 		 449 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  34.96 
 
 		 455 aa  152  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  34.93 
 
 		 444 aa  152  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  30.47 
 
 		 470 aa  150  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  33.52 
 
 		 455 aa  144  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  29.7 
 
 		 506 aa  143  9e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  31.54 
 
 		 413 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  31.17 
 
 		 491 aa  141  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  32.19 
 
 		 507 aa  140  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  35.06 
 
 		 445 aa  140  8.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  33.42 
 
 		 461 aa  138  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  31.99 
 
 		 444 aa  137  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  32.61 
 
 		 439 aa  136  9e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  32.61 
 
 		 439 aa  136  9e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  29.81 
 
 		 495 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  31.59 
 
 		 444 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10884  conserved hypothetical protein  31.27 
 
 		 647 aa  120  6e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  29.75 
 
 		 480 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5510  tryptophan halogenase  26.15 
 
 		 587 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3311  tryptophan halogenase  35.67 
 
 		 449 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  28.29 
 
 		 441 aa  110  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1005  FAD binding domain-containing protein  28.78 
 
 		 480 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0347975  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2240  alkylhalidase  28.78 
 
 		 480 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345155  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2048  putative tryptophan halogenase  28.78 
 
 		 480 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826968  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2103  putative tryptophan halogenase  28.78 
 
 		 480 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0674783  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4378  FAD-binding protein  29.02 
 
 		 436 aa  105  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4606  tryptophan halogenase  27.89 
 
 		 420 aa  105  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0331  monooxygenase, FAD-binding  28.22 
 
 		 435 aa  102  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  27.74 
 
 		 435 aa  102  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  28.76 
 
 		 435 aa  101  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3521  tryptophan halogenase  29.32 
 
 		 424 aa  101  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.956189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0315  tryptophan halogenase  26.35 
 
 		 420 aa  102  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  27.44 
 
 		 429 aa  99.8  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3116  tryptophan halogenase  30.19 
 
 		 417 aa  97.8  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3898  tryptophan halogenase  28.06 
 
 		 429 aa  98.2  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0428  monooxygenase, FAD-binding  29.33 
 
 		 415 aa  97.8  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00208516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2065  tryptophan halogenase  27.3 
 
 		 439 aa  97.4  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1615  dehydrogenase  26.7 
 
 		 405 aa  96.3  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  27.3 
 
 		 429 aa  95.5  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  27.63 
 
 		 424 aa  93.2  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  27.03 
 
 		 429 aa  92.8  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  27.03 
 
 		 429 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03920  Monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:Tryptophanhalogenase  28.08 
 
 		 415 aa  92.8  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.117201  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  27.03 
 
 		 429 aa  92.8  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0135  tryptophan halogenase  26.42 
 
 		 417 aa  92.4  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  25.32 
 
 		 409 aa  92.4  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01623  conserved hypothetical protein  28.26 
 
 		 476 aa  90.9  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.282796 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5621  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  28.76 
 
 		 409 aa  91.3  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  26.56 
 
 		 422 aa  90.5  7e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004059  FAD-binding protein inferred for ABFAE pathway  27.58 
 
 		 414 aa  90.5  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  28.91 
 
 		 415 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1863  tryptophan halogenase  26.58 
 
 		 415 aa  89.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0428  FAD dependent oxidoreductase  28.04 
 
 		 410 aa  89  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25324  normal  0.196339 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5266  FAD dependent oxidoreductase  26.4 
 
 		 566 aa  89.4  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5035  FAD dependent oxidoreductase  23.39 
 
 		 374 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.378834 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2003  tryptophan halogenase  26.99 
 
 		 415 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.923769 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4728  FAD dependent oxidoreductase  26.12 
 
 		 566 aa  88.6  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  26.77 
 
 		 416 aa  87.8  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  25.85 
 
 		 384 aa  87  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4091  tryptophan halogenase  26.72 
 
 		 415 aa  87  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  27.42 
 
 		 409 aa  87  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3616  tryptophan halogenase  25.68 
 
 		 415 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.190224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6708  FAD dependent oxidoreductase  25.85 
 
 		 566 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6985  FAD dependent oxidoreductase  25.85 
 
 		 566 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176502  normal  0.543352 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  26.52 
 
 		 419 aa  85.1  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3913  monooxygenase FAD-binding  26.58 
 
 		 416 aa  85.1  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  26.52 
 
 		 419 aa  85.1  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6189  FAD dependent oxidoreductase  29.43 
 
 		 549 aa  83.6  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.386656  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2887  halogenase PrnC  26.02 
 
 		 566 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.939862  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1117  PrnC  25.56 
 
 		 566 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2735  halogenase PrnC  25.56 
 
 		 566 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00759  putative oxidoreductase protein  28.12 
 
 		 419 aa  80.5  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  0.0681702 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1497  tryptophan halogenase  26.92 
 
 		 406 aa  80.5  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.756039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3552  FAD dependent oxidoreductase  26.3 
 
 		 563 aa  79.7  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2108  FAD dependent oxidoreductase  23.88 
 
 		 413 aa  79.7  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  23.51 
 
 		 455 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0437  FAD dependent oxidoreductase  28.1 
 
 		 549 aa  79  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2822  flavoprotein/dehydrogenase  24.5 
 
 		 413 aa  76.6  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3720  FAD dependent oxidoreductase  24.26 
 
 		 372 aa  77  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288954 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0318  dehydrogenases (flavoproteins)-like  24.7 
 
 		 482 aa  76.3  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.331589 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  23.73 
 
 		 377 aa  73.2  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1201  halogenase PrnC  26.04 
 
 		 552 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14853  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0165  halogenase PrnC  26.04 
 
 		 552 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.537532  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0442  halogenase PrnC  26.04 
 
 		 573 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.669839  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1135  halogenase PrnC  26.04 
 
 		 552 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  24.71 
 
 		 445 aa  70.1  0.00000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0003  halogenase PrnC  25.76 
 
 		 552 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.567897  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1397  putative halogenase  25.76 
 
 		 552 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.666039  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1482  putative halogenase  25.76 
 
 		 552 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133442  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1110  tryptophan halogenase  26.02 
 
 		 416 aa  69.3  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4493  monooxygenase FAD-binding  23.62 
 
 		 488 aa  67  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575117  normal  0.0380746 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3185  monooxygenase FAD-binding protein  21.81 
 
 		 375 aa  66.6  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.388588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2756  FAD dependent oxidoreductase  26.94 
 
 		 417 aa  65.5  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.471979  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6353  FAD dependent oxidoreductase  24.3 
 
 		 606 aa  65.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000576963 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3046  tryptophan halogenase  27.84 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354433  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0945  putative oxidoreductase  27.34 
 
 		 414 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.183705  normal  0.443912 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3477  dehydrogenase (flavoprotein)  23.75 
 
 		 356 aa  63.9  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00015718  normal  0.0486362 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0260  monooxygenase FAD-binding  25.71 
 
 		 568 aa  63.5  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.958147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>