135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6708 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1117  PrnC  93.46 
 
 
566 aa  1119    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6708  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
566 aa  1188    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4728  FAD dependent oxidoreductase  93.64 
 
 
566 aa  1119    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2887  halogenase PrnC  93.29 
 
 
566 aa  1119    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.939862  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2735  halogenase PrnC  93.64 
 
 
566 aa  1120    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6985  FAD dependent oxidoreductase  95.05 
 
 
566 aa  1136    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176502  normal  0.543352 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5266  FAD dependent oxidoreductase  93.64 
 
 
566 aa  1120    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0437  FAD dependent oxidoreductase  43.26 
 
 
549 aa  472  1e-132  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6189  FAD dependent oxidoreductase  41.33 
 
 
549 aa  455  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.386656  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1201  halogenase PrnC  45.72 
 
 
552 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14853  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0165  halogenase PrnC  45.72 
 
 
552 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.537532  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0442  halogenase PrnC  44.99 
 
 
573 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.669839  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1482  putative halogenase  45.72 
 
 
552 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133442  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1135  halogenase PrnC  45.72 
 
 
552 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0003  halogenase PrnC  45.54 
 
 
552 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.567897  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1397  putative halogenase  45.54 
 
 
552 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.666039  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3552  FAD dependent oxidoreductase  40.74 
 
 
563 aa  440  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6353  FAD dependent oxidoreductase  37.74 
 
 
606 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000576963 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  26.76 
 
 
449 aa  110  9.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2072  FAD dependent oxidoreductase  27.03 
 
 
511 aa  108  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  26.42 
 
 
455 aa  104  6e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  27.85 
 
 
455 aa  102  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  26.27 
 
 
444 aa  97.1  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  24.71 
 
 
444 aa  95.1  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  24.19 
 
 
439 aa  93.2  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  24.19 
 
 
439 aa  93.2  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  25.15 
 
 
445 aa  91.7  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  23.88 
 
 
444 aa  87.4  7e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3158  tryptophan halogenase  25.85 
 
 
584 aa  85.9  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000257719 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  25.39 
 
 
461 aa  85.5  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2822  flavoprotein/dehydrogenase  24.29 
 
 
413 aa  84.7  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2756  tryptophan halogenase  25.48 
 
 
618 aa  84.3  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  22.61 
 
 
409 aa  84.3  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  25.67 
 
 
435 aa  84  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  25.71 
 
 
424 aa  83.6  0.000000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  25.2 
 
 
435 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  21.43 
 
 
455 aa  80.5  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4378  FAD-binding protein  24.79 
 
 
436 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0331  monooxygenase, FAD-binding  24.79 
 
 
435 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0135  tryptophan halogenase  26.42 
 
 
417 aa  80.1  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1863  tryptophan halogenase  23.95 
 
 
415 aa  79.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5621  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  25.43 
 
 
409 aa  77.4  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  24.09 
 
 
429 aa  77.4  0.0000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  24.44 
 
 
409 aa  77  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  24.09 
 
 
429 aa  77  0.0000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  24.09 
 
 
429 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  24.09 
 
 
429 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3521  tryptophan halogenase  23.56 
 
 
424 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.956189  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  23.81 
 
 
429 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0315  tryptophan halogenase  23 
 
 
420 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  25.5 
 
 
419 aa  73.6  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  25.5 
 
 
419 aa  73.6  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  26.83 
 
 
441 aa  72.8  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3913  monooxygenase FAD-binding  24.36 
 
 
416 aa  73.6  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445041  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03920  Monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:Tryptophanhalogenase  24.79 
 
 
415 aa  72.8  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.117201  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4606  tryptophan halogenase  21.52 
 
 
420 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1497  tryptophan halogenase  23.45 
 
 
406 aa  71.2  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.756039  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3311  tryptophan halogenase  25.15 
 
 
449 aa  70.9  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  23.6 
 
 
422 aa  70.5  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  26.3 
 
 
470 aa  69.7  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  25.33 
 
 
495 aa  68.6  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2756  FAD dependent oxidoreductase  24.49 
 
 
417 aa  68.6  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.471979  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  26.84 
 
 
507 aa  68.2  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  25.48 
 
 
416 aa  67.8  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2003  tryptophan halogenase  22.45 
 
 
415 aa  67  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.923769 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  22.57 
 
 
384 aa  65.9  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3616  tryptophan halogenase  24.41 
 
 
415 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.190224  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  24.34 
 
 
480 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1615  dehydrogenase  24.51 
 
 
405 aa  63.5  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4091  tryptophan halogenase  23.8 
 
 
415 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0260  monooxygenase FAD-binding  23.06 
 
 
568 aa  62  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.958147  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3898  tryptophan halogenase  23.14 
 
 
429 aa  61.2  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2108  FAD dependent oxidoreductase  23.41 
 
 
413 aa  61.6  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  23.85 
 
 
413 aa  60.8  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  22.85 
 
 
491 aa  60.1  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0428  FAD dependent oxidoreductase  24.19 
 
 
410 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25324  normal  0.196339 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004059  FAD-binding protein inferred for ABFAE pathway  21.43 
 
 
414 aa  59.3  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02880  halogenase  22.19 
 
 
540 aa  57.8  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0428  monooxygenase, FAD-binding  22.25 
 
 
415 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00208516  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0993  FAD dependent oxidoreductase  23.16 
 
 
696 aa  56.2  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2065  tryptophan halogenase  26.26 
 
 
439 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4431  monooxygenase FAD-binding protein  28.22 
 
 
474 aa  56.2  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1110  tryptophan halogenase  25.63 
 
 
416 aa  55.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4669  hypothetical protein  27.72 
 
 
515 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679977  normal  0.120633 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3116  tryptophan halogenase  23.39 
 
 
417 aa  55.1  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2641  monooxygenase, FAD-binding  28.08 
 
 
401 aa  54.3  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  26.18 
 
 
368 aa  53.5  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  22.1 
 
 
507 aa  53.5  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  22.4 
 
 
415 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2048  putative tryptophan halogenase  23.81 
 
 
480 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826968  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1005  FAD binding domain-containing protein  24.6 
 
 
480 aa  52  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0347975  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2240  alkylhalidase  24.6 
 
 
480 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345155  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2103  putative tryptophan halogenase  24.6 
 
 
480 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0674783  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  23.83 
 
 
499 aa  51.6  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0574  FAD dependent oxidoreductase  21.48 
 
 
429 aa  51.2  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  23.54 
 
 
506 aa  51.2  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5510  tryptophan halogenase  23.7 
 
 
587 aa  50.8  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  23.15 
 
 
499 aa  50.4  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3217  monooxygenase FAD-binding protein  26.42 
 
 
488 aa  50.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  hitchhiker  0.0000000987139 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  23.49 
 
 
499 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>