More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3184 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  100 
 
 		 441 aa  889    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2065  tryptophan halogenase  50 
 
 		 439 aa  371  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  37.57 
 
 		 413 aa  219  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  34.01 
 
 		 461 aa  202  8e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  35.75 
 
 		 506 aa  196  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  34.29 
 
 		 480 aa  194  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  35.36 
 
 		 495 aa  192  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  31.75 
 
 		 444 aa  191  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  36.24 
 
 		 470 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3116  tryptophan halogenase  33.06 
 
 		 417 aa  186  1.0000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  34.93 
 
 		 455 aa  185  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2048  putative tryptophan halogenase  33.24 
 
 		 480 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826968  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  35.52 
 
 		 491 aa  179  8e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  31.38 
 
 		 439 aa  179  9e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  31.38 
 
 		 439 aa  179  9e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  34.92 
 
 		 449 aa  179  9e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1005  FAD binding domain-containing protein  33.24 
 
 		 480 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0347975  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2240  alkylhalidase  33.24 
 
 		 480 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345155  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2103  putative tryptophan halogenase  33.24 
 
 		 480 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0674783  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  32.68 
 
 		 455 aa  177  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  34.66 
 
 		 507 aa  178  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  34.17 
 
 		 445 aa  176  9.999999999999999e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4606  tryptophan halogenase  29.3 
 
 		 420 aa  171  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  30.77 
 
 		 415 aa  170  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3311  tryptophan halogenase  34.45 
 
 		 449 aa  169  9e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  31.67 
 
 		 409 aa  169  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  32.13 
 
 		 444 aa  168  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  32.04 
 
 		 419 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  32.04 
 
 		 419 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  35.12 
 
 		 416 aa  164  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  29.95 
 
 		 429 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  30.12 
 
 		 424 aa  163  6e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  32.6 
 
 		 444 aa  163  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0428  monooxygenase, FAD-binding  30.02 
 
 		 415 aa  162  9e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00208516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  29.95 
 
 		 429 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  29.95 
 
 		 429 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  29.95 
 
 		 429 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3521  tryptophan halogenase  30.24 
 
 		 424 aa  160  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.956189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  28.64 
 
 		 429 aa  159  8e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  28.33 
 
 		 422 aa  159  8e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4378  FAD-binding protein  28.64 
 
 		 436 aa  157  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0331  monooxygenase, FAD-binding  28.54 
 
 		 435 aa  157  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  28.54 
 
 		 435 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  28.54 
 
 		 435 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3898  tryptophan halogenase  27.14 
 
 		 429 aa  155  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0428  FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 		 410 aa  152  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25324  normal  0.196339 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2003  tryptophan halogenase  28.89 
 
 		 415 aa  150  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.923769 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0315  tryptophan halogenase  27.94 
 
 		 420 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3913  monooxygenase FAD-binding  30.17 
 
 		 416 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  30.46 
 
 		 409 aa  146  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  26.33 
 
 		 455 aa  143  7e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5621  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  28.29 
 
 		 409 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2822  flavoprotein/dehydrogenase  27.86 
 
 		 413 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1863  tryptophan halogenase  29.24 
 
 		 415 aa  140  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1497  tryptophan halogenase  30.3 
 
 		 406 aa  140  6e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.756039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1615  dehydrogenase  26.68 
 
 		 405 aa  140  6e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00759  putative oxidoreductase protein  30.28 
 
 		 419 aa  137  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  0.0681702 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0945  putative oxidoreductase  31.4 
 
 		 414 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.183705  normal  0.443912 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3046  tryptophan halogenase  32.05 
 
 		 414 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354433  normal  0.187901 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10884  conserved hypothetical protein  30.56 
 
 		 647 aa  133  7.999999999999999e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2756  FAD dependent oxidoreductase  29.16 
 
 		 417 aa  133  7.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.471979  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3616  tryptophan halogenase  31.17 
 
 		 415 aa  132  9e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.190224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4091  tryptophan halogenase  30.17 
 
 		 415 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004059  FAD-binding protein inferred for ABFAE pathway  26.52 
 
 		 414 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5510  tryptophan halogenase  28.93 
 
 		 587 aa  126  9e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03920  Monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:Tryptophanhalogenase  25.69 
 
 		 415 aa  124  3e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.117201  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2108  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 413 aa  123  5e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2756  tryptophan halogenase  31.29 
 
 		 618 aa  114  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0135  tryptophan halogenase  25.62 
 
 		 417 aa  113  6e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01623  conserved hypothetical protein  27.25 
 
 		 476 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.282796 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3158  tryptophan halogenase  28.29 
 
 		 584 aa  110  7.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000257719 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1150  monooxygenase FAD-binding protein  29.33 
 
 		 397 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.862466  normal  0.995827 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1110  tryptophan halogenase  25.43 
 
 		 416 aa  107  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3109  monooxygenase FAD-binding  32.6 
 
 		 444 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0828  FAD dependent oxidoreductase  27.64 
 
 		 356 aa  93.6  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.491479  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2083  FAD dependent oxidoreductase  28.3 
 
 		 344 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4487  monooxygenase FAD-binding  32.08 
 
 		 385 aa  90.5  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6353  FAD dependent oxidoreductase  25.77 
 
 		 606 aa  90.5  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000576963 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2641  monooxygenase, FAD-binding  28.31 
 
 		 401 aa  89.7  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  27.25 
 
 		 425 aa  89  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3959  monooxygenase FAD-binding  30.79 
 
 		 411 aa  89  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  28.04 
 
 		 418 aa  88.2  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3185  monooxygenase FAD-binding  30.59 
 
 		 442 aa  86.7  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304651  hitchhiker  0.000303065 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  29.71 
 
 		 423 aa  86.3  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3720  FAD dependent oxidoreductase  24.46 
 
 		 372 aa  84.7  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288954 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0318  dehydrogenases (flavoproteins)-like  23.08 
 
 		 482 aa  84.3  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.331589 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  27.33 
 
 		 398 aa  84.3  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  29.71 
 
 		 423 aa  83.6  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02880  halogenase  26.28 
 
 		 540 aa  83.2  0.000000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1725  monooxygenase, FAD-binding  30.48 
 
 		 442 aa  82.4  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.847315  normal  0.600174 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  26.97 
 
 		 431 aa  81.3  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2626  monooxygenase FAD-binding  23.68 
 
 		 356 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  28.19 
 
 		 424 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  29.92 
 
 		 430 aa  80.1  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6189  FAD dependent oxidoreductase  25.77 
 
 		 549 aa  80.1  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.386656  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  24.23 
 
 		 395 aa  79  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  25.5 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  24.15 
 
 		 368 aa  79  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  28.95 
 
 		 425 aa  77  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3477  dehydrogenase (flavoprotein)  23.12 
 
 		 356 aa  77  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00015718  normal  0.0486362 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>