247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0315 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  72.84 
 
 		 429 aa  640    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  72.84 
 
 		 429 aa  640    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0315  tryptophan halogenase  100 
 
 		 420 aa  871    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  72.01 
 
 		 435 aa  636    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  71.53 
 
 		 435 aa  634    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  72.84 
 
 		 429 aa  640    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0331  monooxygenase, FAD-binding  71.77 
 
 		 435 aa  637    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  73.08 
 
 		 429 aa  639    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4606  tryptophan halogenase  79.05 
 
 		 420 aa  707    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3521  tryptophan halogenase  75.12 
 
 		 424 aa  649    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.956189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  72.12 
 
 		 429 aa  632  1e-180  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  70.95 
 
 		 422 aa  631  1e-180  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4378  FAD-binding protein  70.81 
 
 		 436 aa  627  1e-179  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3898  tryptophan halogenase  70.36 
 
 		 429 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  67.38 
 
 		 424 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004059  FAD-binding protein inferred for ABFAE pathway  60.34 
 
 		 414 aa  508  1e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2108  FAD dependent oxidoreductase  58.51 
 
 		 413 aa  499  1e-140  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0428  monooxygenase, FAD-binding  56.05 
 
 		 415 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00208516  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  55.31 
 
 		 415 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  55.04 
 
 		 409 aa  457  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0428  FAD dependent oxidoreductase  57.14 
 
 		 410 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25324  normal  0.196339 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1615  dehydrogenase  55.42 
 
 		 405 aa  452  1.0000000000000001e-126  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  52.91 
 
 		 416 aa  450  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  50.12 
 
 		 419 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  54.05 
 
 		 409 aa  441  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  50.12 
 
 		 419 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5621  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  51.84 
 
 		 409 aa  431  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3046  tryptophan halogenase  51.33 
 
 		 414 aa  428  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354433  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3913  monooxygenase FAD-binding  51.35 
 
 		 416 aa  425  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0945  putative oxidoreductase  51.08 
 
 		 414 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.183705  normal  0.443912 
 
 
-
 
NC_003296  RS00759  putative oxidoreductase protein  51.35 
 
 		 419 aa  422  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  0.0681702 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1497  tryptophan halogenase  52.21 
 
 		 406 aa  422  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.756039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3616  tryptophan halogenase  50.12 
 
 		 415 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.190224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4091  tryptophan halogenase  50.12 
 
 		 415 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2756  FAD dependent oxidoreductase  48.07 
 
 		 417 aa  379  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.471979  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2822  flavoprotein/dehydrogenase  42.96 
 
 		 413 aa  348  1e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1863  tryptophan halogenase  43.96 
 
 		 415 aa  342  9e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0135  tryptophan halogenase  41.46 
 
 		 417 aa  323  5e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2003  tryptophan halogenase  38.44 
 
 		 415 aa  314  9.999999999999999e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.923769 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03920  Monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:Tryptophanhalogenase  39.95 
 
 		 415 aa  311  1e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.117201  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1110  tryptophan halogenase  39.1 
 
 		 416 aa  281  1e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  33.99 
 
 		 461 aa  178  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  28.5 
 
 		 455 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  29.31 
 
 		 444 aa  154  4e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  28.93 
 
 		 444 aa  151  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  28.82 
 
 		 449 aa  150  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3311  tryptophan halogenase  29.6 
 
 		 449 aa  149  6e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  33.43 
 
 		 507 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  27.94 
 
 		 441 aa  148  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  31.13 
 
 		 445 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  28.86 
 
 		 455 aa  147  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  26.74 
 
 		 439 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  26.74 
 
 		 439 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  27.97 
 
 		 444 aa  144  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  28.37 
 
 		 480 aa  137  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  30.75 
 
 		 470 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  28.12 
 
 		 491 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  29.61 
 
 		 495 aa  129  7.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  28.32 
 
 		 413 aa  127  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3116  tryptophan halogenase  28.93 
 
 		 417 aa  127  5e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10884  conserved hypothetical protein  30.03 
 
 		 647 aa  125  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  26.41 
 
 		 455 aa  125  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2065  tryptophan halogenase  31.32 
 
 		 439 aa  124  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2048  putative tryptophan halogenase  29.55 
 
 		 480 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826968  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1005  FAD binding domain-containing protein  29.55 
 
 		 480 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0347975  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2240  alkylhalidase  29.55 
 
 		 480 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345155  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2103  putative tryptophan halogenase  29.55 
 
 		 480 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0674783  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  27.16 
 
 		 506 aa  116  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3552  FAD dependent oxidoreductase  28.16 
 
 		 563 aa  113  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5510  tryptophan halogenase  27.91 
 
 		 587 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3158  tryptophan halogenase  26.35 
 
 		 584 aa  102  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000257719 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2641  monooxygenase, FAD-binding  26.87 
 
 		 401 aa  80.1  0.00000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0003  halogenase PrnC  24.78 
 
 		 552 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.567897  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1397  putative halogenase  24.78 
 
 		 552 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.666039  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0260  monooxygenase FAD-binding  25.27 
 
 		 568 aa  78.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.958147  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2756  tryptophan halogenase  30.28 
 
 		 618 aa  78.2  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1482  putative halogenase  24.78 
 
 		 552 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133442  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4728  FAD dependent oxidoreductase  23.24 
 
 		 566 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1201  halogenase PrnC  25.37 
 
 		 552 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14853  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1135  halogenase PrnC  25.37 
 
 		 552 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0165  halogenase PrnC  25.37 
 
 		 552 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.537532  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0442  halogenase PrnC  25.37 
 
 		 573 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.669839  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5266  FAD dependent oxidoreductase  23.24 
 
 		 566 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6708  FAD dependent oxidoreductase  23 
 
 		 566 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6353  FAD dependent oxidoreductase  22.01 
 
 		 606 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000576963 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0437  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 		 549 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1117  PrnC  23 
 
 		 566 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  21.73 
 
 		 384 aa  71.6  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5928  FAD dependent oxidoreductase  22.42 
 
 		 515 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00202441  hitchhiker  0.00883605 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2887  halogenase PrnC  22.76 
 
 		 566 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.939862  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2735  halogenase PrnC  23 
 
 		 566 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6985  FAD dependent oxidoreductase  22.52 
 
 		 566 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176502  normal  0.543352 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  23.62 
 
 		 376 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02880  halogenase  23.65 
 
 		 540 aa  68.9  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  24.09 
 
 		 414 aa  67  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  25.29 
 
 		 423 aa  65.1  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01623  conserved hypothetical protein  27.08 
 
 		 476 aa  64.3  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.282796 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  22.8 
 
 		 398 aa  64.7  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  26.16 
 
 		 423 aa  64.3  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  33.86 
 
 		 424 aa  63.5  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>