262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0708 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS00759  putative oxidoreductase protein  80.3 
 
 		 419 aa  663    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  0.0681702 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  80 
 
 		 419 aa  676    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 		 416 aa  855    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0945  putative oxidoreductase  82.37 
 
 		 414 aa  688    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.183705  normal  0.443912 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3046  tryptophan halogenase  83.82 
 
 		 414 aa  696    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354433  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  80 
 
 		 419 aa  676    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4091  tryptophan halogenase  73.61 
 
 		 415 aa  617  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3616  tryptophan halogenase  73.12 
 
 		 415 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.190224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  61.88 
 
 		 409 aa  499  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3913  monooxygenase FAD-binding  59.81 
 
 		 416 aa  498  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5621  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  59.31 
 
 		 409 aa  486  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  55.15 
 
 		 422 aa  479  1e-134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  55.77 
 
 		 429 aa  476  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  55.42 
 
 		 429 aa  475  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  55.42 
 
 		 429 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  55.42 
 
 		 429 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  55.61 
 
 		 435 aa  474  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  55.17 
 
 		 429 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0331  monooxygenase, FAD-binding  55.61 
 
 		 435 aa  473  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4378  FAD-binding protein  55.37 
 
 		 436 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  55.12 
 
 		 435 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  55.15 
 
 		 424 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  53.17 
 
 		 409 aa  462  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4606  tryptophan halogenase  54.15 
 
 		 420 aa  463  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  56.22 
 
 		 415 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0428  monooxygenase, FAD-binding  56.05 
 
 		 415 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00208516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3898  tryptophan halogenase  52.77 
 
 		 429 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3521  tryptophan halogenase  53.27 
 
 		 424 aa  449  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.956189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0315  tryptophan halogenase  52.91 
 
 		 420 aa  450  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1497  tryptophan halogenase  56.68 
 
 		 406 aa  447  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.756039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0428  FAD dependent oxidoreductase  55.47 
 
 		 410 aa  443  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25324  normal  0.196339 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004059  FAD-binding protein inferred for ABFAE pathway  53.58 
 
 		 414 aa  436  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2108  FAD dependent oxidoreductase  51.71 
 
 		 413 aa  435  1e-121  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2756  FAD dependent oxidoreductase  57.25 
 
 		 417 aa  427  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.471979  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1615  dehydrogenase  52.36 
 
 		 405 aa  414  1e-114  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1863  tryptophan halogenase  41.65 
 
 		 415 aa  330  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2822  flavoprotein/dehydrogenase  42.26 
 
 		 413 aa  330  3e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2003  tryptophan halogenase  39.07 
 
 		 415 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.923769 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03920  Monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:Tryptophanhalogenase  39.41 
 
 		 415 aa  314  1.9999999999999998e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.117201  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0135  tryptophan halogenase  38.46 
 
 		 417 aa  298  2e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1110  tryptophan halogenase  38.42 
 
 		 416 aa  286  5e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  32.23 
 
 		 455 aa  182  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  32.82 
 
 		 461 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  30.69 
 
 		 444 aa  169  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  30.89 
 
 		 444 aa  169  7e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  29.92 
 
 		 444 aa  167  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3311  tryptophan halogenase  31.04 
 
 		 449 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  35.12 
 
 		 441 aa  164  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  30.75 
 
 		 439 aa  162  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  30.75 
 
 		 439 aa  162  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  31.19 
 
 		 449 aa  159  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  30.2 
 
 		 445 aa  154  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  28.97 
 
 		 455 aa  151  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  31.46 
 
 		 480 aa  143  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  30.41 
 
 		 495 aa  139  7e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  27.14 
 
 		 455 aa  139  7e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  32.46 
 
 		 470 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  33.65 
 
 		 491 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  30.91 
 
 		 413 aa  129  6e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1005  FAD binding domain-containing protein  31.68 
 
 		 480 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0347975  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  30.98 
 
 		 507 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2103  putative tryptophan halogenase  31.68 
 
 		 480 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0674783  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2240  alkylhalidase  31.68 
 
 		 480 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345155  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3116  tryptophan halogenase  29.77 
 
 		 417 aa  124  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2048  putative tryptophan halogenase  31.41 
 
 		 480 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826968  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  29.97 
 
 		 506 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2065  tryptophan halogenase  33.52 
 
 		 439 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5510  tryptophan halogenase  30.08 
 
 		 587 aa  104  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.211989 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10884  conserved hypothetical protein  28.1 
 
 		 647 aa  94.7  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3158  tryptophan halogenase  26.77 
 
 		 584 aa  87.8  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000257719 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6353  FAD dependent oxidoreductase  26.85 
 
 		 606 aa  87.4  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000576963 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  27.27 
 
 		 398 aa  86.7  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3109  monooxygenase FAD-binding  27.32 
 
 		 444 aa  84  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  23.72 
 
 		 384 aa  81.3  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2756  tryptophan halogenase  29.25 
 
 		 618 aa  80.1  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2641  monooxygenase, FAD-binding  28.61 
 
 		 401 aa  79.7  0.00000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02880  halogenase  26.11 
 
 		 540 aa  79.7  0.00000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2072  FAD dependent oxidoreductase  30.17 
 
 		 511 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4239  monooxygenase FAD-binding  26.48 
 
 		 407 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1725  monooxygenase, FAD-binding  27.71 
 
 		 442 aa  78.2  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.847315  normal  0.600174 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3185  monooxygenase FAD-binding  27.3 
 
 		 442 aa  77.4  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304651  hitchhiker  0.000303065 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  25.22 
 
 		 426 aa  73.9  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  25.98 
 
 		 423 aa  72.8  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6985  FAD dependent oxidoreductase  24.86 
 
 		 566 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176502  normal  0.543352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3552  FAD dependent oxidoreductase  22.77 
 
 		 563 aa  70.1  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  28.53 
 
 		 375 aa  68.2  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6708  FAD dependent oxidoreductase  25.48 
 
 		 566 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0993  FAD dependent oxidoreductase  25.36 
 
 		 696 aa  67.8  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3720  FAD dependent oxidoreductase  26.22 
 
 		 372 aa  67.4  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288954 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  27.82 
 
 		 424 aa  67  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  23.34 
 
 		 382 aa  67  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0260  monooxygenase FAD-binding  26.93 
 
 		 568 aa  66.6  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.958147  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2934  monooxygenase, FAD-binding  25.67 
 
 		 402 aa  66.6  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4487  monooxygenase FAD-binding  25.6 
 
 		 385 aa  66.2  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3959  monooxygenase FAD-binding  25.38 
 
 		 411 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5928  FAD dependent oxidoreductase  24.62 
 
 		 515 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00202441  hitchhiker  0.00883605 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1117  PrnC  24.73 
 
 		 566 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2887  halogenase PrnC  24.73 
 
 		 566 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.939862  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5266  FAD dependent oxidoreductase  25.21 
 
 		 566 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1150  monooxygenase FAD-binding protein  22.22 
 
 		 397 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.862466  normal  0.995827 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>