134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3720 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3720  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
372 aa  773    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0288954 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2626  monooxygenase FAD-binding  31.39 
 
 
356 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3477  dehydrogenase (flavoprotein)  31.67 
 
 
356 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00015718  normal  0.0486362 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2641  monooxygenase, FAD-binding  30.36 
 
 
401 aa  143  5e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0828  FAD dependent oxidoreductase  28.37 
 
 
356 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.491479  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0318  dehydrogenases (flavoproteins)-like  27.03 
 
 
482 aa  130  5.0000000000000004e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.331589 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1021  FAD dependent oxidoreductase  32.43 
 
 
392 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0291  FAD dependent oxidoreductase  27.52 
 
 
361 aa  127  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4289  monooxygenase FAD-binding  27.56 
 
 
372 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3529  monooxygenase FAD-binding  26.98 
 
 
409 aa  110  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174105  decreased coverage  0.00232713 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  27.22 
 
 
413 aa  89  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  25.84 
 
 
506 aa  87  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2750  Dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  29.14 
 
 
366 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.589907  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  24.46 
 
 
441 aa  84.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5262  hypothetical protein  23.24 
 
 
366 aa  82.8  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1705  FAD dependent oxidoreductase  25.48 
 
 
366 aa  79.7  0.00000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  26.28 
 
 
455 aa  78.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  26.35 
 
 
491 aa  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3158  tryptophan halogenase  24.26 
 
 
584 aa  77  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000257719 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4493  monooxygenase FAD-binding  23.08 
 
 
488 aa  77  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575117  normal  0.0380746 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  24.47 
 
 
445 aa  76.6  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  24.47 
 
 
439 aa  75.5  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  24.47 
 
 
439 aa  75.5  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  25.42 
 
 
461 aa  74.7  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2948  monooxygenase FAD-binding  25.27 
 
 
430 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284077  normal  0.479686 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  24.22 
 
 
455 aa  73.9  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  26.45 
 
 
470 aa  72.8  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6678  tryptophan halogenase  25.16 
 
 
506 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  23.24 
 
 
444 aa  70.9  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  23.81 
 
 
409 aa  68.9  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2756  tryptophan halogenase  28.07 
 
 
618 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  24.92 
 
 
444 aa  67.8  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  24.46 
 
 
424 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  26.22 
 
 
416 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  21.88 
 
 
495 aa  67  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3521  tryptophan halogenase  25.77 
 
 
424 aa  65.5  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.956189  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  24.38 
 
 
507 aa  65.5  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0759  hypothetical protein  24.51 
 
 
447 aa  65.5  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  24.4 
 
 
444 aa  64.3  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3913  monooxygenase FAD-binding  26.54 
 
 
416 aa  64.7  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445041  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  22.09 
 
 
449 aa  63.5  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0428  monooxygenase, FAD-binding  24.38 
 
 
415 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00208516  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4604  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  24.8 
 
 
432 aa  62  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05461  NAD binding site  22.47 
 
 
377 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0315  tryptophan halogenase  23.3 
 
 
420 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  21.92 
 
 
419 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  21.92 
 
 
419 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05761  NAD binding site  22.5 
 
 
377 aa  60.5  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.680324  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  24.21 
 
 
429 aa  60.1  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4606  tryptophan halogenase  23.31 
 
 
420 aa  60.1  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1027  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 
430 aa  60.1  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  22.93 
 
 
480 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0428  FAD dependent oxidoreductase  29.14 
 
 
410 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25324  normal  0.196339 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  24.02 
 
 
435 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0331  monooxygenase, FAD-binding  23.51 
 
 
435 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004059  FAD-binding protein inferred for ABFAE pathway  21.05 
 
 
414 aa  59.3  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  23.92 
 
 
429 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0926  FAD dependent oxidoreductase  21.41 
 
 
411 aa  58.2  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.609885  hitchhiker  0.00113671 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  23.92 
 
 
429 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  24.21 
 
 
429 aa  58.5  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  23.53 
 
 
429 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3898  tryptophan halogenase  23.14 
 
 
429 aa  57.8  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4378  FAD-binding protein  23.85 
 
 
436 aa  57  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3311  tryptophan halogenase  26.63 
 
 
449 aa  57  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  22.77 
 
 
435 aa  57  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  24.17 
 
 
409 aa  56.2  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  25.23 
 
 
415 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5621  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  24.35 
 
 
409 aa  55.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  22.29 
 
 
422 aa  55.5  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  21.98 
 
 
413 aa  55.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2472  monooxygenase FAD-binding  25.57 
 
 
430 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  21.66 
 
 
398 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2304  FAD dependent oxidoreductase  24.43 
 
 
430 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.721165  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2065  tryptophan halogenase  25.07 
 
 
439 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5510  tryptophan halogenase  21.11 
 
 
587 aa  53.5  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  23.56 
 
 
408 aa  53.5  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  23.92 
 
 
382 aa  51.6  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0313  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  22.78 
 
 
430 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.800751  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2108  FAD dependent oxidoreductase  25.9 
 
 
413 aa  51.6  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  24.03 
 
 
379 aa  50.8  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2979  aromatic-ring hydroxylase  24.09 
 
 
434 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1615  dehydrogenase  22.67 
 
 
405 aa  50.4  0.00005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3806  FAD dependent oxidoreductase  21.12 
 
 
375 aa  50.4  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749975  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2822  flavoprotein/dehydrogenase  22.67 
 
 
413 aa  50.1  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  21.7 
 
 
434 aa  50.1  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2083  FAD dependent oxidoreductase  24.92 
 
 
344 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  22.35 
 
 
455 aa  49.3  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3091  FAD dependent oxidoreductase  20.31 
 
 
410 aa  48.1  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.275239  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  24.29 
 
 
379 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3616  tryptophan halogenase  22.22 
 
 
415 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.190224  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  22.91 
 
 
385 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2206  FAD dependent oxidoreductase  22.75 
 
 
410 aa  48.5  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.685598 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1696  geranylgeranyl reductase  25.23 
 
 
459 aa  48.1  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4091  tryptophan halogenase  21.47 
 
 
415 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3389  monooxygenase FAD-binding  26.83 
 
 
392 aa  47.8  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  21.39 
 
 
409 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2507  FAD dependent oxidoreductase  21.28 
 
 
414 aa  47.8  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  22.56 
 
 
387 aa  47  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0135  tryptophan halogenase  28.57 
 
 
417 aa  47.4  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1497  tryptophan halogenase  20.73 
 
 
406 aa  47  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.756039  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>