70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2304 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2304  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 430 aa  843    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.721165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2472  monooxygenase FAD-binding  90.44 
 
 		 430 aa  705    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2948  monooxygenase FAD-binding  79.77 
 
 		 430 aa  674    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284077  normal  0.479686 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2979  aromatic-ring hydroxylase  62.27 
 
 		 434 aa  471  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0759  hypothetical protein  55.72 
 
 		 447 aa  359  5e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1702  PimS2 protein  34.2 
 
 		 416 aa  132  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.665919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4493  monooxygenase FAD-binding  25.42 
 
 		 488 aa  95.9  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575117  normal  0.0380746 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0291  FAD dependent oxidoreductase  28.31 
 
 		 361 aa  85.1  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5262  hypothetical protein  27.94 
 
 		 366 aa  80.9  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6678  tryptophan halogenase  27.35 
 
 		 506 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0828  FAD dependent oxidoreductase  25.69 
 
 		 356 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.491479  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3720  FAD dependent oxidoreductase  23.82 
 
 		 372 aa  70.1  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288954 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2626  monooxygenase FAD-binding  25.68 
 
 		 356 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  24.18 
 
 		 449 aa  68.6  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3477  dehydrogenase (flavoprotein)  25.13 
 
 		 356 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00015718  normal  0.0486362 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  25.82 
 
 		 480 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  25.22 
 
 		 461 aa  66.6  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0318  dehydrogenases (flavoproteins)-like  22.25 
 
 		 482 aa  66.6  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.331589 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  25.53 
 
 		 470 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3311  tryptophan halogenase  25 
 
 		 449 aa  64.3  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2641  monooxygenase, FAD-binding  27.3 
 
 		 401 aa  63.5  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  24.65 
 
 		 439 aa  62.4  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  24.65 
 
 		 439 aa  62.4  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2750  Dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  27.76 
 
 		 366 aa  61.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.589907  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3529  monooxygenase FAD-binding  28.87 
 
 		 409 aa  58.9  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174105  decreased coverage  0.00232713 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  22.19 
 
 		 444 aa  58.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  23.2 
 
 		 506 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  26.84 
 
 		 445 aa  58.2  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  23.8 
 
 		 444 aa  57  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  22.46 
 
 		 455 aa  56.6  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2083  FAD dependent oxidoreductase  26.07 
 
 		 344 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2048  putative tryptophan halogenase  25.19 
 
 		 480 aa  53.9  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826968  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2240  alkylhalidase  25.19 
 
 		 480 aa  53.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345155  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01623  conserved hypothetical protein  22.43 
 
 		 476 aa  53.9  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.282796 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2103  putative tryptophan halogenase  25.19 
 
 		 480 aa  53.5  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0674783  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1005  FAD binding domain-containing protein  25.19 
 
 		 480 aa  53.5  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0347975  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  22.32 
 
 		 455 aa  53.1  0.000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  24.76 
 
 		 491 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05461  NAD binding site  21.84 
 
 		 377 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  23.43 
 
 		 413 aa  51.6  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2756  tryptophan halogenase  24.14 
 
 		 618 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05841  NAD binding site  21.76 
 
 		 377 aa  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  23.5 
 
 		 444 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2206  FAD dependent oxidoreductase  26.33 
 
 		 410 aa  48.5  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.685598 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  22.93 
 
 		 441 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1021  FAD dependent oxidoreductase  26.38 
 
 		 392 aa  48.9  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2065  tryptophan halogenase  24.72 
 
 		 439 aa  47.8  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3158  tryptophan halogenase  21.1 
 
 		 584 aa  47  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000257719 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05761  NAD binding site  20.4 
 
 		 377 aa  47  0.0006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.680324  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0135  tryptophan halogenase  21.57 
 
 		 417 aa  46.6  0.0008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  25.21 
 
 		 378 aa  46.2  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  25.97 
 
 		 398 aa  46.2  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  23.26 
 
 		 415 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  26.76 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4289  monooxygenase FAD-binding  23.02 
 
 		 372 aa  46.2  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  27.81 
 
 		 379 aa  45.8  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  26.1 
 
 		 380 aa  45.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  25.94 
 
 		 388 aa  44.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  21.02 
 
 		 408 aa  44.7  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  27.65 
 
 		 413 aa  45.1  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  24.48 
 
 		 375 aa  45.1  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  23.06 
 
 		 495 aa  43.9  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3960  monooxygenase, FAD-binding  27.74 
 
 		 388 aa  44.3  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0982  geranylgeranyl reductase  37.18 
 
 		 384 aa  43.9  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0176875  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5035  FAD dependent oxidoreductase  21.99 
 
 		 374 aa  43.5  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.378834 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03920  Monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:Tryptophanhalogenase  25.93 
 
 		 415 aa  43.5  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.117201  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  23.47 
 
 		 429 aa  43.5  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3898  tryptophan halogenase  22.73 
 
 		 429 aa  43.1  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0520  NAD binding site  21.55 
 
 		 377 aa  43.1  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  22.74 
 
 		 429 aa  43.1  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.131128 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>