52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2979 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2979  aromatic-ring hydroxylase  100 
 
 		 434 aa  877    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2948  monooxygenase FAD-binding  61.57 
 
 		 430 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284077  normal  0.479686 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2304  FAD dependent oxidoreductase  61.57 
 
 		 430 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.721165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2472  monooxygenase FAD-binding  59.51 
 
 		 430 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0759  hypothetical protein  52.97 
 
 		 447 aa  380  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1702  PimS2 protein  31.88 
 
 		 416 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.665919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4493  monooxygenase FAD-binding  25.94 
 
 		 488 aa  87.4  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575117  normal  0.0380746 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0291  FAD dependent oxidoreductase  28 
 
 		 361 aa  82.4  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0318  dehydrogenases (flavoproteins)-like  23.33 
 
 		 482 aa  73.9  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.331589 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2626  monooxygenase FAD-binding  27.54 
 
 		 356 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3477  dehydrogenase (flavoprotein)  27.27 
 
 		 356 aa  73.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00015718  normal  0.0486362 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0828  FAD dependent oxidoreductase  25.55 
 
 		 356 aa  72.4  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.491479  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2641  monooxygenase, FAD-binding  26.82 
 
 		 401 aa  69.7  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6678  tryptophan halogenase  25.96 
 
 		 506 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3720  FAD dependent oxidoreductase  24.32 
 
 		 372 aa  63.5  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288954 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  24.43 
 
 		 455 aa  62.8  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5262  hypothetical protein  26.71 
 
 		 366 aa  62.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3529  monooxygenase FAD-binding  25 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174105  decreased coverage  0.00232713 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  23.84 
 
 		 439 aa  57.8  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  23.84 
 
 		 439 aa  57.8  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  25.22 
 
 		 445 aa  57.8  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1705  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 		 366 aa  57  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  24.78 
 
 		 444 aa  56.6  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  22.57 
 
 		 461 aa  55.8  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  26.02 
 
 		 378 aa  55.1  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  23.8 
 
 		 449 aa  54.3  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4289  monooxygenase FAD-binding  32.63 
 
 		 372 aa  53.9  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2083  FAD dependent oxidoreductase  21.54 
 
 		 344 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  22.28 
 
 		 413 aa  49.3  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  22.15 
 
 		 415 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  23.85 
 
 		 470 aa  48.5  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2003  tryptophan halogenase  21.38 
 
 		 415 aa  47.4  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.923769 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  20.88 
 
 		 455 aa  47  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  22.49 
 
 		 480 aa  46.6  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2163  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  24.65 
 
 		 402 aa  46.6  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.260088  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  22.51 
 
 		 390 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  20.88 
 
 		 444 aa  45.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1021  FAD dependent oxidoreductase  25.82 
 
 		 392 aa  46.2  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  24 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3311  tryptophan halogenase  24.71 
 
 		 449 aa  44.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  22.47 
 
 		 384 aa  43.9  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2822  flavoprotein/dehydrogenase  21.21 
 
 		 413 aa  43.9  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2065  tryptophan halogenase  27.78 
 
 		 439 aa  43.5  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  23.91 
 
 		 375 aa  43.5  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3566  monooxygenase, FAD-binding  37.89 
 
 		 389 aa  43.5  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3561  monooxygenase, FAD-binding protein  37.89 
 
 		 389 aa  43.5  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.014092  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  21.18 
 
 		 506 aa  43.5  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3634  monooxygenase, FAD-binding  37.89 
 
 		 389 aa  43.5  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.231418  normal  0.598375 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  23.78 
 
 		 419 aa  43.1  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1863  tryptophan halogenase  24.54 
 
 		 415 aa  43.1  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  23.78 
 
 		 419 aa  43.1  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2048  putative tryptophan halogenase  22.71 
 
 		 480 aa  43.1  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>