74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1705 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1705  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 366 aa  749    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2641  monooxygenase, FAD-binding  28.49 
 
 		 401 aa  88.6  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2626  monooxygenase FAD-binding  23.51 
 
 		 356 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3477  dehydrogenase (flavoprotein)  23.22 
 
 		 356 aa  82.8  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00015718  normal  0.0486362 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3720  FAD dependent oxidoreductase  25.48 
 
 		 372 aa  79.7  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288954 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4493  monooxygenase FAD-binding  26.33 
 
 		 488 aa  77.4  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575117  normal  0.0380746 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0828  FAD dependent oxidoreductase  24.73 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.491479  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0318  dehydrogenases (flavoproteins)-like  25 
 
 		 482 aa  71.2  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.331589 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4289  monooxygenase FAD-binding  23.53 
 
 		 372 aa  63.5  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1021  FAD dependent oxidoreductase  26.86 
 
 		 392 aa  59.7  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3529  monooxygenase FAD-binding  25.17 
 
 		 409 aa  58.9  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174105  decreased coverage  0.00232713 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  26.24 
 
 		 455 aa  58.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  24.8 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  25.07 
 
 		 449 aa  56.2  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03920  Monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:Tryptophanhalogenase  23.71 
 
 		 415 aa  55.1  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.117201  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1497  tryptophan halogenase  23.08 
 
 		 406 aa  55.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.756039  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  23.71 
 
 		 455 aa  55.5  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  27.19 
 
 		 444 aa  54.3  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  23.75 
 
 		 416 aa  53.5  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1260  FAD dependent oxidoreductase  23.68 
 
 		 438 aa  51.6  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3556  FAD dependent oxidoreductase  32.35 
 
 		 432 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  23.31 
 
 		 382 aa  51.6  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1195  FAD dependent oxidoreductase  23.68 
 
 		 438 aa  51.2  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0291  FAD dependent oxidoreductase  24.59 
 
 		 361 aa  50.8  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  23.28 
 
 		 439 aa  50.4  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  23.28 
 
 		 439 aa  50.4  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  24.11 
 
 		 470 aa  50.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  23.96 
 
 		 419 aa  50.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  23.46 
 
 		 445 aa  50.1  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5262  hypothetical protein  24.92 
 
 		 366 aa  50.1  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  23.46 
 
 		 384 aa  50.1  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  23.96 
 
 		 419 aa  50.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2944  monooxygenase, FAD-binding protein  26.57 
 
 		 436 aa  49.7  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1852  NAD binding site  23.1 
 
 		 376 aa  49.3  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05761  NAD binding site  20.77 
 
 		 377 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.680324  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0431  hypothetical protein  24.93 
 
 		 422 aa  49.3  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.446535  normal  0.169558 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004059  FAD-binding protein inferred for ABFAE pathway  21.55 
 
 		 414 aa  48.5  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0313  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  23.91 
 
 		 430 aa  47.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.800751  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05461  NAD binding site  21.1 
 
 		 377 aa  47  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3913  monooxygenase FAD-binding  21.43 
 
 		 416 aa  47  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0428  monooxygenase, FAD-binding  24.07 
 
 		 415 aa  47  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00208516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  22.74 
 
 		 424 aa  47  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05771  NAD binding site  23.01 
 
 		 376 aa  46.6  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.161819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  25.07 
 
 		 375 aa  45.8  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2822  flavoprotein/dehydrogenase  21.76 
 
 		 413 aa  45.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3616  tryptophan halogenase  24.72 
 
 		 415 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.190224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  22.37 
 
 		 506 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2003  tryptophan halogenase  22.56 
 
 		 415 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.923769 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1027  FAD dependent oxidoreductase  25.46 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3653  monooxygenase FAD-binding  25.94 
 
 		 411 aa  45.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  21.7 
 
 		 444 aa  45.1  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  20.81 
 
 		 384 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  25.07 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_003296  RS03119  putative transmembrane protein  26.83 
 
 		 435 aa  44.3  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.886572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2948  monooxygenase FAD-binding  24.52 
 
 		 430 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284077  normal  0.479686 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1916  hypothetical protein  29.07 
 
 		 429 aa  44.7  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00759  putative oxidoreductase protein  24.52 
 
 		 419 aa  44.3  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  0.0681702 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2315  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  23.06 
 
 		 436 aa  44.7  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0377746  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  23.41 
 
 		 415 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2979  aromatic-ring hydroxylase  25.42 
 
 		 434 aa  44.3  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1943  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  28.49 
 
 		 429 aa  43.5  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.633206  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  22.25 
 
 		 406 aa  43.5  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1448  hypothetical protein  27.22 
 
 		 428 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  23.12 
 
 		 414 aa  43.5  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 379 aa  43.1  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  22.1 
 
 		 424 aa  43.1  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1482  hypothetical protein  27.81 
 
 		 428 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839158  normal  0.0909638 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1099  geranylgeranyl reductase  24.6 
 
 		 435 aa  43.1  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.997696  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10884  conserved hypothetical protein  31.06 
 
 		 647 aa  43.1  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01657  hypothetical protein  28.49 
 
 		 429 aa  42.7  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1992  hypothetical protein  27.81 
 
 		 428 aa  42.7  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.594962  normal  0.0242177 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1820  hypothetical protein  27.81 
 
 		 428 aa  42.7  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1464  hypothetical protein  27.81 
 
 		 428 aa  43.1  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.682941  normal  0.67626 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01668  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  28.49 
 
 		 429 aa  42.7  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>