More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0279 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 424 aa  850    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  79.52 
 
 		 425 aa  678    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  70.43 
 
 		 418 aa  615  1e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  70.33 
 
 		 435 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  69.19 
 
 		 434 aa  601  1.0000000000000001e-171  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  68.35 
 
 		 423 aa  590  1e-167  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  66.59 
 
 		 434 aa  573  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  66.18 
 
 		 445 aa  560  1e-158  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  67.55 
 
 		 440 aa  557  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  63.16 
 
 		 423 aa  509  1e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  59.72 
 
 		 431 aa  501  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  59.39 
 
 		 430 aa  503  1e-141  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  61.96 
 
 		 423 aa  504  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  60 
 
 		 457 aa  496  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  61.87 
 
 		 430 aa  496  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  59.38 
 
 		 426 aa  481  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  58.81 
 
 		 443 aa  474  1e-132  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  58.43 
 
 		 424 aa  472  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07370  geranylgeranyl reductase family protein  57.55 
 
 		 431 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0284516 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  55.97 
 
 		 431 aa  466  9.999999999999999e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2826  geranylgeranyl reductase  54.98 
 
 		 443 aa  434  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0858816 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  56.63 
 
 		 419 aa  432  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3131  geranylgeranyl reductase  54.48 
 
 		 444 aa  427  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17730  geranylgeranyl reductase family protein  45.85 
 
 		 466 aa  324  2e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0362  geranylgeranyl reductase  36.95 
 
 		 436 aa  227  3e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.495463  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  33.25 
 
 		 393 aa  206  6e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  33.25 
 
 		 393 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1826  geranylgeranyl reductase  33.82 
 
 		 393 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1873  geranylgeranyl reductase  33.82 
 
 		 393 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5254  geranylgeranyl reductase  36.19 
 
 		 416 aa  186  5e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0784  geranylgeranyl reductase  37.04 
 
 		 406 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0765  geranylgeranyl reductase  37.04 
 
 		 406 aa  186  9e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.616022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10571  oxidoreductase  36.14 
 
 		 408 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.649109  normal  0.274108 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0770  geranylgeranyl reductase  34.91 
 
 		 400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1807  geranylgeranyl reductase  33.53 
 
 		 393 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1099  geranylgeranyl reductase  37.56 
 
 		 435 aa  180  4.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.997696  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0948  geranylgeranyl reductase  37.53 
 
 		 417 aa  172  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.3862  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0714  geranylgeranyl reductase  37.01 
 
 		 415 aa  171  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0991  geranylgeranyl reductase  32.72 
 
 		 418 aa  169  8e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  35.36 
 
 		 411 aa  154  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  31.85 
 
 		 384 aa  145  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  35.26 
 
 		 413 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  32.82 
 
 		 398 aa  144  3e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  29.76 
 
 		 376 aa  143  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1294  geranylgeranyl reductase  33.86 
 
 		 420 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.730528  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  35.17 
 
 		 425 aa  138  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  31.09 
 
 		 398 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  34.92 
 
 		 409 aa  133  5e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0164  putative electron transfer oxidoreductase  34.34 
 
 		 420 aa  125  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.762503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  33.42 
 
 		 375 aa  123  8e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  33.93 
 
 		 378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  27.74 
 
 		 376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  32.92 
 
 		 379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  32 
 
 		 403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  28.79 
 
 		 398 aa  111  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5969  geranylgeranyl reductase  31.02 
 
 		 409 aa  110  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.365894  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  28.61 
 
 		 408 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  30.09 
 
 		 396 aa  108  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0830  geranylgeranyl reductase  28.91 
 
 		 415 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  31.12 
 
 		 414 aa  107  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3185  monooxygenase FAD-binding protein  28.87 
 
 		 375 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.388588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  33.92 
 
 		 365 aa  105  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  27.11 
 
 		 382 aa  104  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1161  geranylgeranyl reductase  33.12 
 
 		 429 aa  104  4e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  30.19 
 
 		 362 aa  103  5e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  26.03 
 
 		 370 aa  103  8e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  31.81 
 
 		 506 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  28.21 
 
 		 389 aa  101  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0982  geranylgeranyl reductase  32.3 
 
 		 384 aa  100  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0176875  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  33.13 
 
 		 384 aa  99.8  8e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  29.04 
 
 		 406 aa  99.4  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  28.45 
 
 		 390 aa  99  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1119  geranylgeranyl reductase  29.17 
 
 		 367 aa  99  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  27.87 
 
 		 455 aa  98.2  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  29.07 
 
 		 402 aa  98.6  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2702  geranylgeranyl reductase  33.05 
 
 		 401 aa  98.6  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  25.97 
 
 		 387 aa  98.2  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  28.93 
 
 		 390 aa  97.4  4e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  26.67 
 
 		 439 aa  97.1  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  26.67 
 
 		 439 aa  97.1  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3806  FAD dependent oxidoreductase  23.74 
 
 		 375 aa  96.3  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749975  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  27.96 
 
 		 444 aa  95.9  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  31 
 
 		 406 aa  95.9  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  27.48 
 
 		 368 aa  96.3  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  28.92 
 
 		 385 aa  95.9  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  30.93 
 
 		 407 aa  94.7  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  29.1 
 
 		 418 aa  94.7  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  29.46 
 
 		 406 aa  94.4  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0660  geranylgeranyl reductase  30.82 
 
 		 406 aa  93.6  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  28.25 
 
 		 390 aa  93.6  7e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  31.66 
 
 		 400 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  29.53 
 
 		 384 aa  91.7  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  32.25 
 
 		 396 aa  92.4  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  29.43 
 
 		 421 aa  91.3  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  26.55 
 
 		 395 aa  91.7  3e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  28.73 
 
 		 390 aa  91.3  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0508  geranylgeranyl reductase  29.33 
 
 		 376 aa  91.7  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  32.55 
 
 		 394 aa  90.5  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0178  geranylgeranyl reductase  29.52 
 
 		 405 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  26.16 
 
 		 446 aa  90.9  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>