More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10571 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10571  oxidoreductase  100 
 
 		 408 aa  803    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.649109  normal  0.274108 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0765  geranylgeranyl reductase  79.1 
 
 		 406 aa  568  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.616022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0784  geranylgeranyl reductase  79.1 
 
 		 406 aa  569  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0770  geranylgeranyl reductase  77.84 
 
 		 400 aa  565  1e-160  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0991  geranylgeranyl reductase  73.28 
 
 		 418 aa  550  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5254  geranylgeranyl reductase  73.57 
 
 		 416 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0714  geranylgeranyl reductase  61.35 
 
 		 415 aa  450  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0948  geranylgeranyl reductase  61.8 
 
 		 417 aa  440  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.3862  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1099  geranylgeranyl reductase  60.34 
 
 		 435 aa  437  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.997696  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0362  geranylgeranyl reductase  38.89 
 
 		 436 aa  238  1e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.495463  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  38.96 
 
 		 418 aa  229  9e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  36.78 
 
 		 435 aa  224  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  36.75 
 
 		 434 aa  223  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  38.8 
 
 		 423 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  36.56 
 
 		 431 aa  216  4e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  38.27 
 
 		 424 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  37.11 
 
 		 423 aa  209  6e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  37.62 
 
 		 443 aa  209  6e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  35.64 
 
 		 425 aa  209  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  38.29 
 
 		 445 aa  209  9e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  37.62 
 
 		 434 aa  208  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  37.5 
 
 		 431 aa  207  3e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  35.45 
 
 		 426 aa  206  6e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  36.32 
 
 		 430 aa  205  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  34.54 
 
 		 423 aa  205  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2826  geranylgeranyl reductase  34.38 
 
 		 443 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0858816 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3131  geranylgeranyl reductase  34.61 
 
 		 444 aa  196  7e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07370  geranylgeranyl reductase family protein  35.51 
 
 		 431 aa  195  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0284516 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  36.84 
 
 		 440 aa  194  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  37.04 
 
 		 419 aa  194  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  33.5 
 
 		 430 aa  190  4e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  32.54 
 
 		 457 aa  186  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  35.52 
 
 		 424 aa  186  8e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  35.56 
 
 		 393 aa  161  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17730  geranylgeranyl reductase family protein  33.64 
 
 		 466 aa  161  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  35.56 
 
 		 393 aa  161  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  37.29 
 
 		 413 aa  153  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  38.46 
 
 		 409 aa  145  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1826  geranylgeranyl reductase  34.93 
 
 		 393 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1873  geranylgeranyl reductase  34.93 
 
 		 393 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1807  geranylgeranyl reductase  34.93 
 
 		 393 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  33.96 
 
 		 398 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  32.7 
 
 		 384 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  33.43 
 
 		 398 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0830  geranylgeranyl reductase  28.93 
 
 		 415 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  31.67 
 
 		 375 aa  116  6e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  28.18 
 
 		 376 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1294  geranylgeranyl reductase  32.6 
 
 		 420 aa  113  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.730528  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  33.13 
 
 		 411 aa  112  9e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  26.74 
 
 		 382 aa  110  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  27.37 
 
 		 387 aa  110  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  29.39 
 
 		 385 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  29.68 
 
 		 389 aa  103  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  34.43 
 
 		 425 aa  103  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5969  geranylgeranyl reductase  31.51 
 
 		 409 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.365894  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0164  putative electron transfer oxidoreductase  34.93 
 
 		 420 aa  100  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.762503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  30.2 
 
 		 384 aa  97.8  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  26.22 
 
 		 398 aa  95.5  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  31.06 
 
 		 378 aa  95.9  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  30.65 
 
 		 414 aa  95.1  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  29.89 
 
 		 362 aa  95.1  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1161  geranylgeranyl reductase  33.44 
 
 		 429 aa  91.3  3e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  33.23 
 
 		 403 aa  90.9  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0660  geranylgeranyl reductase  30.3 
 
 		 406 aa  90.9  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  26.86 
 
 		 370 aa  90.5  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  29.28 
 
 		 403 aa  87  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2702  geranylgeranyl reductase  29.31 
 
 		 401 aa  86.3  9e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  30.67 
 
 		 379 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  30.52 
 
 		 362 aa  84  0.000000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  29.35 
 
 		 368 aa  84  0.000000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  31.75 
 
 		 382 aa  83.2  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  31.49 
 
 		 400 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  25.43 
 
 		 390 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0327  geranylgeranyl reductase  35.17 
 
 		 373 aa  81.6  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.252383  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1355  geranylgeranyl reductase  30.43 
 
 		 358 aa  82  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0520333 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  26.09 
 
 		 407 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  24.29 
 
 		 408 aa  81.3  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  24.86 
 
 		 376 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  24.36 
 
 		 390 aa  80.5  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1434  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  25.43 
 
 		 436 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000988984  normal  0.0161309 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  24.86 
 
 		 368 aa  79.7  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1199  geranylgeranyl reductase  31.64 
 
 		 423 aa  79.7  0.00000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  28.79 
 
 		 384 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  26.67 
 
 		 402 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1119  geranylgeranyl reductase  29.77 
 
 		 367 aa  77.8  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1603  geranylgeranyl reductase  25.87 
 
 		 374 aa  77.8  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1852  NAD binding site  26.18 
 
 		 376 aa  76.6  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  23.75 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  25.29 
 
 		 390 aa  76.3  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  31.45 
 
 		 394 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  31.45 
 
 		 394 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0982  geranylgeranyl reductase  29.94 
 
 		 384 aa  75.9  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0176875  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2189  geranylgeranyl reductase  29.17 
 
 		 383 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  29.69 
 
 		 380 aa  75.5  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5142  monooxygenase, FAD-binding  31.46 
 
 		 348 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  29.41 
 
 		 379 aa  74.3  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  25.62 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  30.48 
 
 		 380 aa  73.2  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2315  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  25.44 
 
 		 436 aa  73.2  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0377746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  28.82 
 
 		 400 aa  73.2  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>